McDuffie a fost ales în prima rundă a draftului din 1992 de Miami Dolphins [1] . A fost distins cu începutul anului de către Sports Illustrated și cu debutantul defensiv al anului de Football News după ce a terminat cu 84 de atacuri , 6 saci (al treilea cel mai mare vreodată pentru un debutant Dolphins) și o bătaie forțată în 15 jocuri ca titular. A mai jucat trei ani la Miami, apoi a jucat trei cu San Diego Chargers . În 1999 s-a mutat la Washington Redskins cu care, în primul an, a fost chemat pentru singurul său Pro Bowl după ce a înregistrat 6,5 saci. În anul următor, cu toate acestea, a marcat un punctaj personal de 12 saci. A petrecut ultimele sezoane din carieră cu Jacksonville Jaguars (2002), Philadelphia Eagles (2003) și Denver Broncos (2004-2005).