Organism model

De la Wikipedia, enciclopedia liberă.
Salt la navigare Salt la căutare
Caenorhabditis elegans , un organism tipic model eucariot
Drosophila melanogaster , unul dintre cele mai cunoscute „animale experimentale”

Un organism model este o specie studiată pe larg pentru a înțelege anumite fenomene biologice , pe baza presupunerii că achizițiile făcute asupra organismului model pot furniza informații despre alte organisme. Acest lucru este posibil datorită faptului că principiile biologice fundamentale, cum ar fi căile metabolice , de reglare și dezvoltare, precum și genele care le codifică, sunt menținute prin evoluție .

Din punct de vedere istoric, primul organism model folosit în experimente riguroase pentru a înțelege ereditatea a fost Pisum sativum al lui Gregor Mendel [1] . [2] [3] Mazărea de grădină răspunde de fapt nevoilor specifice de încrucișare controlată, schimbării rapide a generației, numeroși descendenți, caracterelor fenotipice alternative și disponibilității a numeroase soiuri comerciale. Aceste caracteristici l-au făcut optim pentru o abordare cantitativă și statistică a problemelor de moștenire.

Criterii de selecție

Adesea, organismele model sunt alese pe baza capacității lor de a fi adaptabile la manipulări experimentale. De obicei sunt preferate următoarele caracteristici: ciclul celular scurt, tehnici de manipulare genetică (tulpini consangvinizate , linii de celule stem și sisteme de transfecție ). Uneori, rearanjarea genetică facilitează secvențierea genomului organismului model, de exemplu, deoarece este foarte compact sau are o cantitate mică de ADN necodificator , așa-numitul „ADN junk” (ADN junk).

Există un număr de organisme model. Primul organism model pentru biologia moleculară a fost probabil bacteria E. coli , frecvent întâlnită în sistemul digestiv uman (și de obicei benefică - tulpina periculoasă Escherichia coli O157: H7 este rară). Este, de asemenea, utilizat în studiul multor bacteriofagi , în special fagul lambda .

În eucariote, unele drojdii au fost studiate pe larg, în special Saccharomyces cerevisiae (drojdie de bere), în principal pentru că sunt ușor de gestionat. Ciclul celular dintr-o drojdie este foarte asemănător ciclului celular la om și este reglat de proteine ​​omoloage. Muștele fructelor Drosophila melanogaster a fost, de asemenea, studiat, din nou, deoarece este ușor de gestionat pentru un organism multicelular. Viermele Caenorhabditis elegans a fost studiat deoarece are etape de dezvoltare extrem de definite și, prin urmare, este posibilă detectarea rapidă a anomaliilor.

Când cercetătorii caută un organism de utilizat în studiile lor, ei iau în considerare mai multe caracteristici. Cele mai frecvente sunt dimensiunea, timpul de generare, accesibilitatea, manipularea, genetica, conservarea mecanismelor și un potențial benefic economic. Odată cu răspândirea biologiei moleculare comparative, cercetătorii au căutat organisme model care să reprezinte diferite tipuri de viață.

Principalele organisme model

Virus

Procariote

Eucariote unicelulare

Eucariote multicelulare

Plantă

Ciuperci

Nevertebrate

Vertebrate

Organisme model utilizate pentru cercetări specifice

Selecție sexuală și conflicte

Zonele hibride

Ecologie genomică

Tabel genetic al organismelor model

Tabelul indică starea proiectului genomului pentru fiecare organism, arătând recombinarea omoloagă a organismului și starea de cunoaștere a căilor biochimice ale organismului.

Corp Secvențierea genomului Recombinare omoloagă Biochimie
Procariot
Escherichia coli da da Excelent
Eucariot unicelular
Dictyostelium discoideum da da Excelent
Saccharomyces cerevisiae da da Bun
Schizosaccharomyces pombe da da Bun
Chlamydomonas reinhardtii da Nu Bun
Tetrahymena thermophila da da Bun
Eucariot multicelular
Caenorhabditis elegans da Dificil Nu asa de bine
Drosophila melanogaster da Greu Bun
Arabidopsis thaliana da Nu Rău
Physcomitrella patens da da Excelent
Vertebrat
Danio rerio da Nu Bun
Mus musculus da da Bun
Xenopus laevis [199] da
Homo sapiens NB: nu este un organism model da da Bun

Notă

  1. ^ JL. Weller, V. Hecht, LC. Liew, FC. Sussmilch, B. Wenden, CL. Knowles, Vander Schoor, Actualizare privind controlul genetic al înfloririi în mazărea de grădină. , în J Exp Bot , vol. 60, n. 9, 2009, pp. 2493-9, DOI : 10.1093 / jxb / erp120 , PMID 19414500 .
  2. ^ M. Bhattacharyya, C. Martin și A. Smith, Importanța biosintezei amidonului în caracterul de formă a semințelor ridate de mazăre studiat de Mendel. , în Plant Mol Biol , vol. 22, n. 3, iunie 1993, pp. 525-31, PMID 8329688 .
  3. ^ WW. Piegorsch, RA. Fisher, JG. Mendel, contribuțiile lui Fisher la genetică și ereditate, cu accent deosebit pe controversa lui Gregor Mendel. , în Biometrie , vol. 46, nr. 4, decembrie 1990, pp. 915-24, PMID 2085640 .
  4. ^ G. Wegrzyn și A. Wegrzyn, [Replicarea ADN-ului bacteriofagului lambda - noi descoperiri făcute folosind un vechi model experimental] , în Postepy Biochem , vol. 52, nr. 1, 2006, pp. 42-8 , PMID 16869300 .
  5. ^ SN. Austad, Grădina Zoologică a lui Methusaleh: modul în care natura ne oferă indicii pentru extinderea perioadei de sănătate umană. , în J Comp Pathol , 142 Suppl 1, ianuarie 2010, pp. S10-21, DOI : 10.1016 / j.jcpa.2009.10.024 , PMID 19962715 .
  6. ^ AW. Briggs, U. Stenzel, PL. Johnson, RE. Green, J. Kelso, K. Prüfer, M. Meyer, J. Krause și MT. Ronan, Modele de deteriorare în secvențele genomice de ADN de la un Neandertal. , în Proc Natl Acad Sci SUA , vol. 104, nr. 37, septembrie 2007, pp. 14616-21, DOI : 10.1073 / pnas . 0704665104 , PMID 17715061 .
  7. ^ O. Tenaillon, OK. Silander, JP. Uzan și L. Chao, Cuantificarea complexității organismului utilizând o abordare genetică a populației. , în PLoS One , vol. 2, nr. 2, 2007, pp. e217, DOI : 10.1371 / journal.pone.0000217 , PMID 17299597 .
  8. ^ JS. Lim, SM. Kim, SY. Lee, EA. Stach, JN. Culver și MT. Harris, Studiu cantitativ al biosorbției ionilor Au (III) și Pd (II) asupra virusului mozaicului tutunului modificat genetic. , în J Colloid Interface Sci , vol. 342, n. 2, februarie 2010, pp. 455-61, DOI : 10.1016 / j.jcis.2009.10.028 , PMID 19914631 .
  9. ^ J. Lewis, De la cercetarea virusului la biologia moleculară: virusul mozaicului tutunului în Germania, 1936-1956. , în J Hist Biol , vol. 37, n. 2, 2004, pp. 259-301, PMID 15490522 .
  10. ^ G. Stahl, L. Bidou, JP. Rousset și M. Cassan, vectori versatili pentru studierea recodificării: conservarea regulilor între drojdie și celule de mamifere. , în Nucleic Acids Res. , vol. 23, n. 9, mai 1995, pp. 1557-60, PMID 7784210 .
  11. ^ NS. Persky și ST. Lovett, Mecanisme de recombinare: lecții de la E. coli. , în Crit Rev Biochem Mol Biol , vol. 43, nr. 6, pp. 347-70, DOI : 10.1080 / 10409230802485358 , PMID 19016098 .
  12. ^ C. Kaleta, A. Göhler, S. Schuster, K. Jahreis, R. Guthke și S. Nikolajewa, Inferența integrativă a rețelelor de reglare a genei în Escherichia coli utilizând concepte teoretice ale informațiilor și analiza secvenței. , în BMC Syst Biol , vol. 4, 2010, p. 116, DOI : 10.1186 / 1752-0509-4-116 , PMID 20718955 .
  13. ^ J. Bohlin și E. Skjerve, Examinarea omogenității genomului la procariote folosind semnături genomice. , în PLoS One , vol. 4, nr. 12, 2009, pp. e8113, DOI : 10.1371 / journal.pone.0008113 , PMID 19956556 .
  14. ^ EB. Johnston, PJ. Lewis și R. Griffith, interacțiunea Bacillus subtilis sigmaA cu ARN polimeraza. , în Protein Sci , vol. 18, nr. 11, noiembrie 2009, pp. 2287-97, DOI : 10.1002 / pro.239 , PMID 19735077 .
  15. ^ CD. Vázquez, JA. Freyre-González, G. Gosset, JA. Loza și RM. Gutiérrez-Ríos, Identificarea unităților topologice de rețea care coordonează răspunsul la expresia globală la glucoză în Bacillus subtilis și comparația sa cu Escherichia coli. , în BMC Microbiol , vol. 9, 2009, p. 176, DOI : 10.1186 / 1471-2180-9-176 , PMID 19703276 .
  16. ^ A. Srivatsan, Y. Han, J. Peng, AK. Tehranchi, R. Gibbs, JD. Wang și R. Chen, Secvențierea genomului întreg de înaltă precizie a tulpinilor de laborator facilitează studiile genetice. , în PLoS Genet , vol. 4, nr. 8, 2008, pp. e1000139, DOI : 10.1371 / journal.pgen.1000139 , PMID 18670626 .
  17. ^ A. Barré, A. de Daruvar și A. Blanchard, MolliGen, o bază de date dedicată genomicii comparative a Mollicutes. , în Nucleic Acids Res , vol. 32, Ediția bazei de date, ianuarie 2004, pp. D307-10, DOI : 10.1093 / nar / gkh114 , PMID 14681420 .
  18. ^ H. Bang, A. Pecht, G. Raddatz, T. Scior, W. Solbach, K. Brune și A. Pahl, Prolyl isomerases in a minimum cell. Cataliza plierii proteinelor prin factorul declanșator de la Mycoplasma genitalium. , în Eur J Biochem , vol. 267, nr. 11, iunie 2000, pp. 3270-80, PMID 10824113 .
  19. ^ AR. Mushegian și EV. Koonin, o genă minimă setată pentru viața celulară derivată prin compararea genomului bacterian complet. , în Proc Natl Acad Sci SUA , vol. 93, nr. 19, septembrie 1996, pp. 10268-73, PMID 8816789 .
  20. ^ a b AK. Dunn și EV. Stabb, Analiza genetică a trimetilaminei N-oxid reductaze în organul luminos simbiont Vibrio fischeri ES114. , în J Bacteriol , vol. 190, nr. 17, septembrie 2008, pp. 5814-23, DOI : 10.1128 / JB.00227-08 , PMID 18606737 .
  21. ^ EA. Meighen, Bioluminescență bacteriană: organizare, reglare și aplicare a genelor lux. , în FASEB J , vol. 7, nr. 11, august 1993, pp. 1016-22, PMID 8370470 .
  22. ^ M. Nakao, S. Okamoto, M. Kohara, T. Fujishiro, T. Fujisawa, S. Sato, S. Tabata, T. Kaneko și Y. Nakamura, CyanoBase: actualizarea bazei de date a genomului cianobacteriilor 2010. , în Acizi nucleici Rez , vol. 38, Ediția bazei de date, ianuarie 2010, pp. D379-81, DOI : 10.1093 / nar / gkp915 , PMID 19880388 .
  23. ^ SY. Gerdes, OV. Kurnasov, K. Shatalin, B. Polanuyer, R. Sloutsky, V. Vonstein, R. Overbeek și AL. Osterman, Genomica comparativă a biosintezei NAD în cianobacterii. , în J Bacteriol , vol. 188, nr. 8, aprilie 2006, pp. 3012-23, DOI :10.1128 / JB.188.8.3012-3023.2006 , PMID 16585762 .
  24. ^ M. Zanetti, E. Teardo, N. La Rocca, L. Zulkifli, V. Checchetto, T. Shijuku, Y. Sato, GM. Giacometti și N. Uozumi, Un nou canal de potasiu în cianobacteriile fotosintetice. , în PLoS One , vol. 5, nr. 4, 2010, pp. e10118, DOI : 10.1371 / journal.pone.0010118 , PMID 20404935 .
  25. ^ HJ. Eberl și S. Collinson, Un studiu de modelare și simulare a antagonismului mediat de siderofor în biofilmele cu două specii. , în Theor Biol Med Model , vol. 6, 2009, p. 30, DOI : 10.1186 / 1742-4682-6-30 , PMID 20028518 .
  26. ^ VO. Stockwell și JP. Stivă, folosind Pseudomonas spp. pentru controlul biologic integrat. , în Fitopatologie , vol. 97, nr. 2, februarie 2007, pp. 244-9, DOI : 10.1094 / PHYTO-97-2-0244 , PMID 18944382 .
  27. ^ LE. Jensen și O. Nybroe, disponibilitatea azotului la Pseudomonas fluorescens DF57 este limitată în timpul descompunerii paiului de orz în sol vrac și în rizosfera de orz. , în Appl Environ Microbiol , vol. 65, nr. 10, octombrie 1999, pp. 4320-8, PMID 10508054 .
  28. ^ a b c C. Stark, BJ. Breitkreutz, A. Chatr-Aryamontri, L. Boucher, R. Oughtred, MS. Livstone, J. Nixon, K. Van Auken și X. Wang, The BioGRID Interaction Database: 2011 update. , în Nucleic Acids Res , noiembrie 2010, DOI : 10.1093 / nar / gkq1116 , PMID 21071413 .
  29. ^ SR. Birkeland, N. Jin, AC. Ozdemir, RH. Lyon, LS. Weisman și TE. Wilson, Discovery of Mutations in Saccharomyces cerevisiae by Pooled Linkage Analysis and Whole Genome Sequencing. , în Genetică , octombrie 2010, DOI : 10.1534 / genetics.110.123232 , PMID 20923977 .
  30. ^ S. Bordel, R. Agren și J. Nielsen, Eșantionarea spațiului soluției în rețelele metabolice la scară genomică relevă reglarea transcripțională a enzimelor cheie. , în PLoS Comput Biol , vol. 6, nr. 7, 2010, pp. e1000859, DOI : 10.1371 / journal.pcbi.1000859 , PMID 20657658 .
  31. ^ A. Goffeau, BG. Barrell, H. Bussey, RW. Davis, B. Dujon, H. Feldmann, F. Galibert, JD. Hoheisel și C. Jacq, Viața cu 6000 de gene. , în Știință , vol. 274, nr. 5287, octombrie 1996, pp. 546, 563-7, PMID 8849441 .
  32. ^ D. Dardalhon, AR. Angelin, G. Baldacci, E. Sage și S. Francesconi, Efectele neconvenționale ale radiației UVA asupra progresiei ciclului celular în S. pombe. , în Ciclul celular , vol. 7, nr. 5, martie 2008, pp. 611-22, PMID 18256544 .
  33. ^ CJ. Webb și VA. Zakian, Identificarea și caracterizarea ARN telomerazei Schizosaccharomyces pombe TER1. , în Nat Struct Mol Biol , vol. 15, nr. 1, ianuarie 2008, pp. 34-42, DOI : 10.1038 / nsmb1354 , PMID 18157149 .
  34. ^ H. Lin, AL. Kwan și SK. Dutcher, Sinteza și recuperarea NAD: lecții învățate de la Chlamydomonas reinhardtii. , în PLoS Genet , vol. 6, nr. 9, 2010, DOI : 10.1371 / journal.pgen.1001105 , PMID 20838591 .
  35. ^ S. Shaver, JA. Casas-Mollano, RL. Cerny și H. Cerutti, Originea complexului represiv policomb 2 și silențierea genei printr-un omolog E (z) în alga unicelulară Chlamydomonas. , în Epigenetica , vol. 5, nr. 4, mai 2010, pp. 301-12, PMID 20421736 .
  36. ^ G. Periz, D. Dharia, SH. Miller și LR. Keller, alungirea flagelară și expresia genelor în Chlamydomonas reinhardtii. , în Eucaryot Cell , vol. 6, nr. 8, august 2007, pp. 1411-20, DOI : 10.1128 / EC.00167-07 , PMID 17573545 .
  37. ^ PH. Brito, E. Guilherme, H. Soares și I. Gordo, acumularea de mutații în Tetrahymena. , în BMC Evol Biol , vol. 10, nr. 1, noiembrie 2010, p. 354, DOI : 10.1186 / 1471-2148-10-354 , PMID 21078144 .
  38. ^ BP. Culver, JB. Meehl, TH. Giddings și M. Winey, cei doi omologi SAS-6 din Tetrahymena thermophila au funcții distincte în asamblarea corpului bazal. , în Mol Biol Cell , vol. 20, nr. 6, martie 2009, pp. 1865-77, DOI : 10.1091 / mbc.E08-08-0838 , PMID 19158390 .
  39. ^ JA. Eisen, RS. Coyne, M. Wu, D. Wu, M. Thiagarajan, JR. Wortman, JH. Badger, Q. Ren și P. Amedeo, secvența genomului macronuclear al ciliatului Tetrahymena thermophila, un model eucariot. , în PLoS Biol , vol. 4, nr. 9, septembrie 2006, pp. e286, DOI : 10.1371 / journal.pbio.0040286 , PMID 16933976 .
  40. ^ G. Glöckner și AJ. Heidel, secvența Centromere și dinamica în Dictyostelium discoideum. , în Nucleic Acids Res , vol. 37, n. 6, aprilie 2009, pp. 1809-16, DOI : 10.1093 / nar / gkp017 , PMID 19179372 .
  41. ^ JM. Joseph, P. Fey, N. Ramalingam, XI. Liu, M. Rohlfs, AA. Noegel, A. Müller-Taubenberger, G. Glöckner și M. Schleicher, Actinomul Dictyostelium discoideum în comparație cu actinele și proteinele legate de actină din alte organisme. , în PLoS One , vol. 3, nr. 7, 2008, pp. e2654, DOI : 10.1371 / journal.pone.0002654 , PMID 18612387 .
  42. ^ A. Sillo, G. Bloomfield, A. Balest, A. Balbo, B. Pergolizzi, B. Peracino, J. Skelton, A. Ivens și S. Bozzaro, modificări transcripționale la nivelul genomului induse de fagocitoză sau de creștere a bacteriilor în Dictyostelium. , în BMC Genomics , vol. 9, 2008, p. 291, DOI : 10.1186 / 1471-2164-9-291 , PMID 18559084 .
  43. ^ a b JX. Yue, J. Li, D. Wang, H. Araki, D. Tian și S. Yang, investigația la nivelul genomului relevă rate evolutive ridicate la plantele model anuale. , în BMC Plant Biol , vol. 10, nr. 1, noiembrie 2010, p. 242, DOI : 10.1186 / 1471-2229-10-242 , PMID 21062446 .
  44. ^ E. Wywial și SM. Singh, Identificarea și caracterizarea structurală a proteinelor care conțin domeniu FYVE din Arabidopsis thaliana. , în BMC Plant Biol , vol. 10, 2010, p. 157, DOI : 10.1186 / 1471-2229-10-157 , PMID 20678208 .
  45. ^ J. Kane, M. Freeling și E. Lyons, Evoluția unei matrici de gene cu copie înaltă în Arabidopsis. , în J Mol Evol , vol. 70, nr. 6, iunie 2010, pp. 531-44, DOI : 10.1007 / s00239-010-9350-2 , PMID 20495794 .
  46. ^ JE. Bowers, MA. Arias, R. Asher, JA. Avise, RT. Ball, GA. Brewer, RW. Buss, AH. Chen și TM. Edwards, cartografierea fizică comparativă leagă conservarea microsintezei de structura cromozomială și recombinarea în ierburi. , în Proc Natl Acad Sci SUA , vol. 102, nr. 37, septembrie 2005, pp. 13206-11, DOI : 10.1073/pnas.0502365102 , PMID 16141333 .
  47. ^ CE. Gallagher, PD. Matthews, F. Li e ET. Wurtzel, Gene duplication in the carotenoid biosynthetic pathway preceded evolution of the grasses. , in Plant Physiol. , vol. 135, n. 3, luglio 2004, pp. 1776-83, DOI : 10.1104/pp.104.039818 , PMID 15247400 .
  48. ^ H. Lin, S. Ouyang, A. Egan, K. Nobuta, BJ. Haas, W. Zhu, X. Gu, JC. Silva e BC. Meyers, Characterization of paralogous protein families in rice. , in BMC Plant Biol , vol. 8, 2008, p. 18, DOI : 10.1186/1471-2229-8-18 , PMID 18284697 .
  49. ^ S. Fu, R. Meeley e MJ. Scanlon, Empty pericarp2 encodes a negative regulator of the heat shock response and is required for maize embryogenesis. , in Plant Cell , vol. 14, n. 12, dicembre 2002, pp. 3119-32, PMID 12468731 .
  50. ^ DR. Kovar, BK. Drøbak, DA. Collings e CJ. Staiger, The characterization of ligand-specific maize (Zea mays) profilin mutants. , in Biochem J , vol. 358, Pt 1, agosto 2001, pp. 49-57, PMID 11485551 .
  51. ^ M. Deutsch e M. Long, Intron-exon structures of eukaryotic model organisms. , in Nucleic Acids Res , vol. 27, n. 15, agosto 1999, pp. 3219-28, PMID 10454621 .
  52. ^ M. Langer, LF. Sniderhan, U. Grossniklaus e A. Ray, Transposon excision from an atypical site: a mechanism of evolution of novel transposable elements. , in PLoS One , vol. 2, n. 10, 2007, pp. e965, DOI : 10.1371/journal.pone.0000965 , PMID 17912344 .
  53. ^ AM. Jovanović, S. Durst e P. Nick, Plant cell division is specifically affected by nitrotyrosine. , in J Exp Bot , vol. 61, n. 3, marzo 2010, pp. 901-9, DOI : 10.1093/jxb/erp369 , PMID 20018903 .
  54. ^ K. Eggenberger, E. Birtalan, T. Schröder, S. Bräse e P. Nick, Passage of Trojan peptoids into plant cells. , in Chembiochem , vol. 10, n. 15, ottobre 2009, pp. 2504-12, DOI : 10.1002/cbic.200900331 , PMID 19739189 .
  55. ^ K. Szczyglowski e J. Stougaard, Lotus genome: pod of gold for legume research. , in Trends Plant Sci , vol. 13, n. 10, ottobre 2008, pp. 515-7, DOI : 10.1016/j.tplants.2008.08.001 , PMID 18762442 .
  56. ^ J. Ramos, L. Naya, M. Gay, J. Abián e M. Becana, Functional characterization of an unusual phytochelatin synthase, LjPCS3, of Lotus japonicus. , in Plant Physiol , vol. 148, n. 1, settembre 2008, pp. 536-45, DOI : 10.1104/pp.108.121715 , PMID 18614711 .
  57. ^ F. Alkhalfioui, M. Renard, WH. Vensel, J. Wong, CK. Tanaka, WJ. Hurkman, BB. Buchanan e F. Montrichard, Thioredoxin-linked proteins are reduced during germination of Medicago truncatula seeds. , in Plant Physiol , vol. 144, n. 3, luglio 2007, pp. 1559-79, DOI : 10.1104/pp.107.098103 , PMID 17513483 .
  58. ^ AF. Lamblin, JA. Crow, JE. Johnson, KA. Silverstein, TM. Kunau, A. Kilian, D. Benz, M. Stromvik e G. Endré, MtDB: a database for personalized data mining of the model legume Medicago truncatula transcriptome. , in Nucleic Acids Res , vol. 31, n. 1, gennaio 2003, pp. 196-201, PMID 12519981 .
  59. ^ L. Tyler, JN. Bragg, J. Wu, X. Yang, GA. Tuskan e JP. Vogel, Annotation and comparative analysis of the glycoside hydrolase genes in Brachypodium distachyon. , in BMC Genomics , vol. 11, 2010, p. 600, DOI : 10.1186/1471-2164-11-600 , PMID 20973991 .
  60. ^ T. Unver e H. Budak, Conserved microRNAs and their targets in model grass species Brachypodium distachyon. , in Planta , vol. 230, n. 4, settembre 2009, pp. 659-69, DOI : 10.1007/s00425-009-0974-7 , PMID 19585143 .
  61. ^ EB. McGregor, KR. Solomon e ML. Hanson, Monensin is not toxic to aquatic macrophytes at environmentally relevant concentrations. , in Arch Environ Contam Toxicol , vol. 53, n. 4, novembre 2007, pp. 541-51, DOI : 10.1007/s00244-007-0002-5 , PMID 17657449 .
  62. ^ S. Shrivastava, R. Poddar, P. Shukla e K. Mukhopadhyay, Study of codon bias perspective of fungal xylanase gene by multivariate analysis. , in Bioinformation , vol. 3, n. 10, 2009, pp. 425-9, PMID 19759864 .
  63. ^ I. Sato, M. Shimizu, T. Hoshino e N. Takaya, The glutathione system of Aspergillus nidulans involves a fungus-specific glutathione S-transferase. , in J Biol Chem , vol. 284, n. 12, marzo 2009, pp. 8042-53, DOI : 10.1074/jbc.M807771200 , PMID 19171936 .
  64. ^ G. Panagiotou, MR. Andersen, T. Grotkjaer, TB. Regueira, G. Hofmann, J. Nielsen e L. Olsson, Systems analysis unfolds the relationship between the phosphoketolase pathway and growth in Aspergillus nidulans. , in PLoS One , vol. 3, n. 12, 2008, pp. e3847, DOI : 10.1371/journal.pone.0003847 , PMID 19052639 .
  65. ^ C. Tian, WT. Beeson, AT. Iavarone, J. Sun, MA. Marletta, JH. Cate e NL. Glass, Systems analysis of plant cell wall degradation by the model filamentous fungus Neurospora crassa. , in Proc Natl Acad Sci USA , vol. 106, n. 52, dicembre 2009, pp. 22157-62, DOI : 10.1073/pnas.0906810106 , PMID 20018766 .
  66. ^ N. Liu, ZD. Xiao, CH. Yu, P. Shao, YT. Liang, DG. Guan, JH. Yang, CL. Chen e LH. Qu, SnoRNAs from the filamentous fungus Neurospora crassa: structural, functional and evolutionary insights. , in BMC Genomics , vol. 10, 2009, p. 515, DOI : 10.1186/1471-2164-10-515 , PMID 19895704 .
  67. ^ NB. Raju, Neurospora as a model fungus for studies in cytogenetics and sexual biology at Stanford. , in J Biosci , vol. 34, n. 1, marzo 2009, pp. 139-59, PMID 19430125 .
  68. ^ DE. Heck, L. Louis, MA. Gallo e JD. Laskin, Modulation of the development of plutei by nitric oxide in the sea urchin Arbacia punctulata. , in Biol Bull , vol. 199, n. 2, ottobre 2000, pp. 195-7, PMID 11081732 .
  69. ^ DE. Heck e JD. Laskin, Ryanodine-sensitive calcium flux regulates motility of Arbacia punctulata sperm. , in Biol Bull , vol. 205, n. 2, ottobre 2003, pp. 185-6, PMID 14583520 .
  70. ^ MN. Semenova e ND. Ozerniuk, [Influence of NO-synthase inhibitors on embryonal development of sea urchins.] , in Zh Evol Biokhim Fiziol , vol. 40, n. 3, pp. 229-34, PMID 15453454 .
  71. ^ WA. Anderson e ME. Perotti, An ultracytochemical study of the respiratory potency, integrity, and fate of the sea urchin sperm mitochondria during early embryogenesis. , in J. Cell. Biol. , vol. 66, n. 2, agosto 1975, pp. 367-76, DOI : 10.1083/jcb.66.2.367 , PMID 167033 .
  72. ^ JM. Noronha, GH. Sheys e JM. Buchanan, Induction of a reductive pathway for deoxyribonucleotide synthesis during early embryogenesis of the sea urchin. , in Proc Natl Acad Sci USA , vol. 69, n. 8, agosto 1972, pp. 2006-10, PMID 4626400 .
  73. ^ M. Doitsidou, RJ. Poole, S. Sarin, H. Bigelow e O. Hobert, C. elegans Mutant Identification with a One-Step Whole-Genome-Sequencing and SNP Mapping Strategy. , in PLoS One , vol. 5, n. 11, 2010, pp. e15435, DOI : 10.1371/journal.pone.0015435 , PMID 21079745 .
  74. ^ O. Hobert, Neurogenesis in the nematode Caenorhabditis elegans. , in WormBook , 2010, pp. 1-24, DOI : 10.1895/wormbook.1.12.2 , PMID 20891032 .
  75. ^ H. Furuhashi, T. Takasaki, A. Rechtsteiner, T. Li, H. Kimura, PM. Checchi, S. Strome e WG. Kelly, Trans-generational epigenetic regulation of C. elegans primordial germ cells. , in Epigenetics Chromatin , vol. 3, n. 1, 2010, p. 15, DOI : 10.1186/1756-8935-3-15 , PMID 20704745 .
  76. ^ N. Noren Hooten, K. Abdelmohsen, M. Gorospe, N. Ejiogu, AB. Zonderman e MK. Evans, microRNA expression patterns reveal differential expression of target genes with age. , in PLoS One , vol. 5, n. 5, 2010, pp. e10724, DOI : 10.1371/journal.pone.0010724 , PMID 20505758 .
  77. ^ A. Viñuela, LB. Snoek, JA. Riksen e JE. Kammenga, Genome-wide gene expression regulation as a function of genotype and age in C. elegans. , in Genome Res , vol. 20, n. 7, luglio 2010, pp. 929-37, DOI : 10.1101/gr.102160.109 , PMID 20488933 .
  78. ^ HE. Arda, S. Taubert, LT. MacNeil, CC. Conine, B. Tsuda, M. Van Gilst, R. Sequerra, L. Doucette-Stamm e KR. Yamamoto, Functional modularity of nuclear hormone receptors in a Caenorhabditis elegans metabolic gene regulatory network. , in Mol Syst Biol , vol. 6, maggio 2010, p. 367, DOI : 10.1038/msb.2010.23 , PMID 20461074 .
  79. ^ CC. Yang, YT. Wang, YY. Hsiao, LG. Doudeva, PH. Kuo, SY. Chow e HS. Yuan, Structural and biochemical characterization of CRN-5 and Rrp46: an exosome component participating in apoptotic DNA degradation. , in RNA , vol. 16, n. 9, settembre 2010, pp. 1748-59, DOI : 10.1261/rna.2180810 , PMID 20660080 .
  80. ^ X. Teng e JM. Hardwick, The apoptosome at high resolution. , in Cell , vol. 141, n. 3, aprile 2010, pp. 402-4, DOI : 10.1016/j.cell.2010.04.015 , PMID 20434981 .
  81. ^ T. Sakashita, T. Takanami, S. Yanase, N. Hamada, M. Suzuki, T. Kimura, Y. Kobayashi, N. Ishii e A. Higashitani, Radiation biology of Caenorhabditis elegans: germ cell response, aging and behavior. , in J Radiat Res (Tokyo) , vol. 51, n. 2, marzo 2010, pp. 107-21, PMID 20208402 .
  82. ^ LM. Cook, Disequilibrium in some Cepaea populations. , in Heredity , vol. 94, n. 5, maggio 2005, pp. 497-500, DOI : 10.1038/sj.hdy.6800645 , PMID 15742002 .
  83. ^ A. Davison e B. Clarke, History or current selection? A molecular analysis of 'area effects' in the land snail Cepaea nemoralis. , in Proc Biol Sci , vol. 267, n. 1451, luglio 2000, pp. 1399-405, DOI : 10.1098/rspb.2000.1156 , PMID 10983823 .
  84. ^ A. Bellido, L. Madec, JF. Arnaud e A. Guiller, Spatial structure of shell polychromatism in populations of Cepaea nemoralis: new techniques for an old debate. , in Heredity , vol. 88, n. 1, gennaio 2002, pp. 75-82, DOI : 10.1038/sj.hdy.6800012 , PMID 11813110 .
  85. ^ L. Christiaen, B. Davidson, T. Kawashima, W. Powell, H. Nolla, K. Vranizan e M. Levine, The transcription/migration interface in heart precursors of Ciona intestinalis. , in Science , vol. 320, n. 5881, giugno 2008, pp. 1349-52, DOI : 10.1126/science.1158170 , PMID 18535245 .
  86. ^ H. Auger, C. Lamy, M. Haeussler, P. Khoueiry, P. Lemaire e JS. Joly, Similar regulatory logic in Ciona intestinalis for two Wnt pathway modulators, ROR and SFRP-1/5. , in Dev Biol , vol. 329, n. 2, maggio 2009, pp. 364-73, DOI : 10.1016/j.ydbio.2009.02.018 , PMID 19248777 .
  87. ^ A. Nakayama-Ishimura, JP. Chambon, T. Horie, N. Satoh e Y. Sasakura, Delineating metamorphic pathways in the ascidian Ciona intestinalis. , in Dev Biol , vol. 326, n. 2, febbraio 2009, pp. 357-67, DOI : 10.1016/j.ydbio.2008.11.026 , PMID 19100250 .
  88. ^ MT. Yamamoto, Drosophila Genetic Resource and Stock Center; The National BioResource Project. , in Exp Anim , vol. 59, n. 2, 2010, pp. 125-38, PMID 20484846 .
  89. ^ JC. Tuthill, Lessons from a compartmental model of a Drosophila neuron. , in J Neurosci , vol. 29, n. 39, settembre 2009, pp. 12033-4, DOI : 10.1523/JNEUROSCI.3348-09.2009 , PMID 19793961 .
  90. ^ J. Pearson, L. López-Onieva, P. Rojas-Ríos e A. González-Reyes, Recent advances in Drosophila stem cell biology. , in Int J Dev Biol , vol. 53, n. 8-10, 2009, pp. 1329-39, DOI : 10.1387/ijdb.072431jp , PMID 19247935 .
  91. ^ AD. Huberman, TR. Clandinin e H. Baier, Molecular and cellular mechanisms of lamina-specific axon targeting. , in Cold Spring Harb Perspect Biol , vol. 2, n. 3, marzo 2010, pp. a001743, DOI : 10.1101/cshperspect.a001743 , PMID 20300211 .
  92. ^ S. Broughton e L. Partridge, Insulin/IGF-like signalling, the central nervous system and aging. , in Biochem J , vol. 418, n. 1, febbraio 2009, pp. 1-12, DOI : 10.1042/BJ20082102 , PMID 19159343 .
  93. ^ N. Hafer e P. Schedl, Dissection of larval CNS in Drosophila melanogaster. , in J Vis Exp , n. 1, dicembre 2006, p. 85, DOI : 10.3791/85 , PMID 18704179 .
  94. ^ CK. Beam e K. Moberg, The gang of four gene regulates growth and patterning of the developing Drosophila eye. , in Fly (Austin) , vol. 4, n. 2, aprile 2010, pp. 104-16, PMID 20473027 .
  95. ^ Y. Zhan, NY. Melian, M. Pantoja, N. Haines, H. Ruohola-Baker, CW. Bourque, Y. Rao e S. Carbonetto, Dystroglycan and mitochondrial ribosomal protein l34 regulate differentiation in the Drosophila eye. , in PLoS One , vol. 5, n. 5, 2010, pp. e10488, DOI : 10.1371/journal.pone.0010488 , PMID 20463973 .
  96. ^ LC. Firth, A. Bhattacharya e NE. Baker, Cell cycle arrest by a gradient of Dpp signaling during Drosophila eye development. , in BMC Dev Biol , vol. 10, 2010, p. 28, DOI : 10.1186/1471-213X-10-28 , PMID 20214806 .
  97. ^ MS. Wollenberg e EG. Ruby, Population structure of Vibrio fischeri within the light organs of Euprymna scolopes squid from Two Oahu (Hawaii) populations. , in Appl Environ Microbiol , vol. 75, n. 1, gennaio 2009, pp. 193-202, DOI : 10.1128/AEM.01792-08 , PMID 18997024 .
  98. ^ Y. Wang, YS. Dufour, HK. Carlson, TJ. Donohue, MA. Marletta e EG. Ruby, H-NOX-mediated nitric oxide sensing modulates symbiotic colonization by Vibrio fischeri. , in Proc Natl Acad Sci USA , vol. 107, n. 18, maggio 2010, pp. 8375-80, DOI : 10.1073/pnas.1003571107 , PMID 20404170 .
  99. ^ AM. Wier, SV. Nyholm, MJ. Mandel, RP. Massengo-Tiassé, AL. Schaefer, I. Koroleva, S. Splinter-Bondurant, B. Brown e L. Manzella, Transcriptional patterns in both host and bacterium underlie a daily rhythm of anatomical and metabolic change in a beneficial symbiosis. , in Proc Natl Acad Sci USA , vol. 107, n. 5, febbraio 2010, pp. 2259-64, DOI : 10.1073/pnas.0909712107 , PMID 20133870 .
  100. ^ D. Tong, NS. Rozas, TH. Oakley, J. Mitchell, NJ. Colley e MJ. McFall-Ngai, Evidence for light perception in a bioluminescent organ. , in Proc Natl Acad Sci USA , vol. 106, n. 24, giugno 2009, pp. 9836-41, DOI : 10.1073/pnas.0904571106 , PMID 19509343 .
  101. ^ HR. Bode, Axial patterning in hydra. , in Cold Spring Harb Perspect Biol , vol. 1, n. 1, luglio 2009, pp. a000463, DOI : 10.1101/cshperspect.a000463 , PMID 20066073 .
  102. ^ RE. Steele e CE. Dana, Evolutionary history of the HAP2/GCS1 gene and sexual reproduction in metazoans. , in PLoS One , vol. 4, n. 11, 2009, pp. e7680, DOI : 10.1371/journal.pone.0007680 , PMID 19888453 .
  103. ^ K. Khalturin, F. Anton-Erxleben, S. Sassmann, J. Wittlieb, G. Hemmrich e TC. Bosch, A novel gene family controls species-specific morphological traits in Hydra. , in PLoS Biol , vol. 6, n. 11, novembre 2008, pp. e278, DOI : 10.1371/journal.pbio.0060278 , PMID 19018660 .
  104. ^ H. Meinhardt, Models for the generation and interpretation of gradients. , in Cold Spring Harb Perspect Biol , vol. 1, n. 4, ottobre 2009, pp. a001362, DOI : 10.1101/cshperspect.a001362 , PMID 20066097 .
  105. ^ T. Fujisawa, Hydra regeneration and epitheliopeptides. , in Dev Dyn , vol. 226, n. 2, febbraio 2003, pp. 182-9, DOI : 10.1002/dvdy.10221 , PMID 12557197 .
  106. ^ KM. Smith, L. Gee e HR. Bode, HyAlx, an aristaless-related gene, is involved in tentacle formation in hydra. , in Development , vol. 127, n. 22, novembre 2000, pp. 4743-52, PMID 11044390 .
  107. ^ P. Grant, Y. Zheng e HC. Pant, Squid (Loligo pealei) giant fiber system: a model for studying neurodegeneration and dementia? , in Biol Bull , vol. 210, n. 3, giugno 2006, pp. 318-33, PMID 16801505 .
  108. ^ RR. Llinás, M. Sugimori, KA. Moran, JE. Moreira e M. Fukuda, Vesicular reuptake inhibition by a synaptotagmin I C2B domain antibody at the squid giant synapse. , in Proc Natl Acad Sci USA , vol. 101, n. 51, dicembre 2004, pp. 17855-60, DOI : 10.1073/pnas.0408200101 , PMID 15591349 .
  109. ^ GD. Beaven, PT. Erskine, JN. Wright, F. Mohammed, R. Gill, SP. Wood, J. Vernon, KP. Giese e JB. Cooper, Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of calexcitin from Loligo pealei: a neuronal protein implicated in learning and memory. , in Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun , vol. 61, Pt 10, ottobre 2005, pp. 879-81, DOI : 10.1107/S1744309105026758 , PMID 16511184 .
  110. ^ M. Guida, M. Guida, B. De Felice, D. Santafede, R. D'Alessandro, A. Di Spiezio Sardo, M. Scognamiglio, C. Ferrara e G. Bifulco, Assessment of DNA damage by RAPD in Paracentrotus lividus embryos exposed to amniotic fluid from residents living close to waste landfill sites. , in J Biomed Biotechnol , vol. 2010, 2010, DOI : 10.1155/2010/251767 , PMID 20706694 .
  111. ^ M. Agnello, G. Morici e AM. Rinaldi, A method for measuring mitochondrial mass and activity. , in Cytotechnology , vol. 56, n. 3, marzo 2008, pp. 145-9, DOI : 10.1007/s10616-008-9143-2 , PMID 19002852 .
  112. ^ S. Ravera, C. Falugi, D. Calzia, IM. Pepe, I. Panfoli e A. Morelli, First cell cycles of sea urchin Paracentrotus lividus are dramatically impaired by exposure to extremely low-frequency electromagnetic field. , in Biol Reprod , vol. 75, n. 6, dicembre 2006, pp. 948-53, DOI : 10.1095/biolreprod.106.051227 , PMID 16957026 .
  113. ^ N. Borchert, C. Dieterich, K. Krug, W. Schütz, S. Jung, A. Nordheim, RJ. Sommer e B. Macek, Proteogenomics of Pristionchus pacificus reveals distinct proteome structure of nematode models. , in Genome Res , vol. 20, n. 6, giugno 2010, pp. 837-46, DOI : 10.1101/gr.103119.109 , PMID 20237107 .
  114. ^ E. de Wit, SE. Linsen, E. Cuppen e E. Berezikov, Repertoire and evolution of miRNA genes in four divergent nematode species. , in Genome Res , vol. 19, n. 11, novembre 2009, pp. 2064-74, DOI : 10.1101/gr.093781.109 , PMID 19755563 .
  115. ^ A. Click, CH. Savaliya, S. Kienle, M. Herrmann e A. Pires-daSilva, Natural variation of outcrossing in the hermaphroditic nematode Pristionchus pacificus. , in BMC Evol Biol , vol. 9, 2009, p. 75, DOI : 10.1186/1471-2148-9-75 , PMID 19379507 .
  116. ^ LS. Tang, ML. Goeritz, JS. Caplan, AL. Taylor, M. Fisek e E. Marder, Precise temperature compensation of phase in a rhythmic motor pattern. , in PLoS Biol , vol. 8, n. 8, 2010, DOI : 10.1371/journal.pbio.1000469 , PMID 20824168 .
  117. ^ ND. DeLong e MP. Nusbaum, Hormonal modulation of sensorimotor integration. , in J Neurosci , vol. 30, n. 7, febbraio 2010, pp. 2418-27, DOI : 10.1523/JNEUROSCI.5533-09.2010 , PMID 20164325 .
  118. ^ AI. Selverston, A. Szücs, R. Huerta, R. Pinto e M. Reyes, Neural mechanisms underlying the generation of the lobster gastric mill motor pattern. , in Front Neural Circuits , vol. 3, 2009, p. 12, DOI : 10.3389/neuro.04.012.2009 , PMID 19893763 .
  119. ^ JM. Goaillard, AL. Taylor, DJ. Schulz e E. Marder, Functional consequences of animal-to-animal variation in circuit parameters. , in Nat Neurosci , vol. 12, n. 11, novembre 2009, pp. 1424-30, DOI : 10.1038/nn.2404 , PMID 19838180 .
  120. ^ D. Dreyer, H. Vitt, S. Dippel, B. Goetz, B. El Jundi, M. Kollmann, W. Huetteroth e J. Schachtner, 3D Standard Brain of the Red Flour Beetle Tribolium Castaneum: A Tool to Study Metamorphic Development and Adult Plasticity. , in Front Syst Neurosci , vol. 4, 2010, p. 3, DOI : 10.3389/neuro.06.003.2010 , PMID 20339482 .
  121. ^ AD. Peel, Forward genetics in Tribolium castaneum: opening new avenues of research in arthropod biology. , in J Biol , vol. 8, n. 12, 2009, p. 106, DOI : 10.1186/jbiol208 , PMID 20053302 .
  122. ^ HS. Kim, T. Murphy, J. Xia, D. Caragea, Y. Park, RW. Beeman, MD. Lorenzen, S. Butcher e JR. Manak, BeetleBase in 2010: revisions to provide comprehensive genomic information for Tribolium castaneum. , in Nucleic Acids Res , vol. 38, Database issue, gennaio 2010, pp. D437-42, DOI : 10.1093/nar/gkp807 , PMID 19820115 .
  123. ^ TD. Kocher, WR. Jeffery, DM. Parichy, CL. Peichel, JT. Streelman e GH. Thorgaard, Special feature--roundtable discussion. Fish models for studying adaptive evolution and speciation. , in Zebrafish , vol. 2, n. 3, 2005, pp. 147-56, DOI : 10.1089/zeb.2005.2.147 , PMID 18248189 .
  124. ^ J. Bradbury, Small fish, big science. , in PLoS Biol , vol. 2, n. 5, maggio 2004, pp. E148, DOI : 10.1371/journal.pbio.0020148 , PMID 15138510 .
  125. ^ AJ. Hill, H. Teraoka, W. Heideman e RE. Peterson, Zebrafish as a model vertebrate for investigating chemical toxicity. , in Toxicol Sci , vol. 86, n. 1, luglio 2005, pp. 6-19, DOI : 10.1093/toxsci/kfi110 , PMID 15703261 .
  126. ^ JM. Spitsbergen e ML. Kent, The state of the art of the zebrafish model for toxicology and toxicologic pathology research--advantages and current limitations. , in Toxicol Pathol , 31 Suppl, pp. 62-87, PMID 12597434 .
  127. ^ ( EN ) www.official-documents.gov.uk ( PDF ), su official-documents.gov.uk .
  128. ^ ( EN ) Animal-Testing Ban for Cosmetics to Be Upheld, EU Court Rules - Bloomberg , su bloomberg.com .
  129. ^ ( EN ) US FDA/CFSAN - Animal Testing , su cfsan.fda.gov (archiviato dall' url originale il 23 maggio 2007) .
  130. ^ Safar P, Behringer W, Böttiger BW, Sterz F, Cerebral resuscitation potentials for cardiac arrest , in Crit. Care Med. , vol. 30, 4 Suppl, aprile 2002, pp. S140–4, PMID 11940789 .
  131. ^ Suckow, Mark A.; Terril, Lizabeth A.; Clemons, Donna J.,The laboratory guinea pig , Boca Raton, CRC Press, 1998, ISBN 0-8493-2564-1 .
  132. ^ AL. Poirrier, P. Van den Ackerveken, TS. Kim, R. Vandenbosch, L. Nguyen, PP. Lefebvre e B. Malgrange, Ototoxic drugs: difference in sensitivity between mice and guinea pigs. , in Toxicol Lett , vol. 193, n. 1, marzo 2010, pp. 41-9, DOI : 10.1016/j.toxlet.2009.12.003 , PMID 20015469 .
  133. ^ P. Schwarz, P. Strnad, N. Singer, F. Oswald, R. Ehehalt, G. Adler e H. Kulaksiz, Identification, sequencing, and cellular localization of hepcidin in guinea pig (Cavia porcellus). , in J Endocrinol , vol. 202, n. 3, settembre 2009, pp. 389-96, DOI : 10.1677/JOE-09-0191 , PMID 19553281 .
  134. ^ a b R. Dumke, I. Catrein, R. Herrmann e E. Jacobs, Preference, adaptation and survival of Mycoplasma pneumoniae subtypes in an animal model. , in Int J Med Microbiol , vol. 294, n. 2-3, settembre 2004, pp. 149-55, PMID 15493825 .
  135. ^ R. O'Toole, Experimental models used to study human tuberculosis. , in Adv Appl Microbiol , vol. 71, 2010, pp. 75-89, DOI : 10.1016/S0065-2164(10)71003-0 , PMID 20378051 .
  136. ^ M. Möller, E. de Wit e EG. Hoal, Past, present and future directions in human genetic susceptibility to tuberculosis. , in FEMS Immunol Med Microbiol , vol. 58, n. 1, febbraio 2010, pp. 3-26, DOI : 10.1111/j.1574-695X.2009.00600.x , PMID 19780822 .
  137. ^ A. Rawat, KA. Gust, MO. Elasri e EJ. Perkins, Quail Genomics: a knowledgebase for Northern bobwhite. , in BMC Bioinformatics , 11 Suppl 6, 2010, pp. S13, DOI : 10.1186/1471-2105-11-S6-S13 , PMID 20946596 .
  138. ^ A. Biswas, OS. Ranganatha e J. Mohan, The effect of different foam concentrations on sperm motility in Japanese quail. , in Vet Med Int , vol. 2010, 2010, p. 564921, DOI : 10.4061/2010/564921 , PMID 21076546 .
  139. ^ Patricia Pope Bartlett e Michele Earle-Bridges, The hamster handbook , Hauppauge, NY, Barron's, 2003, ISBN 978-0-7641-2294-1 .
  140. ^ DA. Haake, Hamster model of leptospirosis. , in Curr Protoc Microbiol , Chapter 12, settembre 2006, pp. Unit 12E.2, DOI : 10.1002/9780471729259.mc12e02s02 , PMID 18770576 .
  141. ^ A. Lee, Animal models and vaccine development. , in Baillieres Clin Gastroenterol , vol. 9, n. 3, settembre 1995, pp. 615-32, PMID 8563056 .
  142. ^ MA. Meredith e BE. Stein, Visual, auditory, and somatosensory convergence on cells in superior colliculus results in multisensory integration. , in J Neurophysiol , vol. 56, n. 3, settembre 1986, pp. 640-62, PMID 3537225 .
  143. ^ BR. Møller e PA. Mårdh, Animal models for the study of Chlamydial infections of the urogenital tract. , in Scand J Infect Dis Suppl , vol. 32, 1982, pp. 103-8, PMID 6813962 .
  144. ^ YS. Rao, ZF. Wang, XW. Chai, GZ. Wu, M. Zhou, QH. Nie e XQ. Zhang, Selection for the compactness of highly expressed genes in Gallus gallus. , in Biol Direct , vol. 5, 2010, p. 35, DOI : 10.1186/1745-6150-5-35 , PMID 20465857 .
  145. ^ a b WC. Warren, DF. Clayton, H. Ellegren, AP. Arnold, LW. Hillier, A. Künstner, S. Searle, S. White e AJ. Vilella, The genome of a songbird. , in Nature , vol. 464, n. 7289, aprile 2010, pp. 757-62, DOI : 10.1038/nature08819 , PMID 20360741 .
  146. ^ H. Ono, N. Nakao, T. Yamamura, K. Kinoshita, M. Mizutani, T. Namikawa, M. Iigo, S. Ebihara e T. Yoshimura, Red jungle fowl (Gallus gallus) as a model for studying the molecular mechanism of seasonal reproduction. , in Anim Sci J , vol. 80, n. 3, giugno 2009, pp. 328-32, DOI : 10.1111/j.1740-0929.2009.00628.x , PMID 20163644 .
  147. ^ DI. Shushevich, AI. Fomenko e AG. Khalmuradov, [Interrelationship between NAD metabolism and DNA synthesis in chicken liver nuclei during ontogenesis] , in Biokhimiia , vol. 42, n. 2, febbraio 1977, pp. 251-6, PMID 192347 .
  148. ^ Wolfe, Linda D.; Fuentes, Agustin, Primates face to face: conservation implications of human-nonhuman primate interconnections , Cambridge, UK, Cambridge University Press, 2002, ISBN 0-521-79109-X .
  149. ^ KF. Snowden, ES. Didier, JM. Orenstein e JA. Shadduck, Animal models of human microsporidial infections. , in Lab Anim Sci , vol. 48, n. 6, dicembre 1998, pp. 589-92, PMID 10090081 .
  150. ^ AP. Sripati e CR. Olson, Global image dissimilarity in macaque inferotemporal cortex predicts human visual search efficiency. , in J Neurosci , vol. 30, n. 4, gennaio 2010, pp. 1258-69, DOI : 10.1523/JNEUROSCI.1908-09.2010 , PMID 20107054 .
  151. ^ JM. Samonds, BR. Potetz e TS. Lee, Cooperative and competitive interactions facilitate stereo computations in macaque primary visual cortex. , in J Neurosci , vol. 29, n. 50, dicembre 2009, pp. 15780-95, DOI : 10.1523/JNEUROSCI.2305-09.2009 , PMID 20016094 .
  152. ^ T. Nekovarova, J. Nedvidek, D. Klement e J. Bures, Spatial decisions and cognitive strategies of monkeys and humans based on abstract spatial stimuli in rotation test. , in Proc Natl Acad Sci USA , vol. 106, n. 36, settembre 2009, pp. 15478-82, DOI : 10.1073/pnas.0907053106 , PMID 19706408 .
  153. ^ I. Adachi, DP. Chou e RR. Hampton, Thatcher effect in monkeys demonstrates conservation of face perception across primates. , in Curr Biol , vol. 19, n. 15, agosto 2009, pp. 1270-3, DOI : 10.1016/j.cub.2009.05.067 , PMID 19559613 .
  154. ^ NA. Wilson e DI. Watkins, Is an HIV vaccine possible? , in Braz J Infect Dis , vol. 13, n. 4, agosto 2009, pp. 304-10, PMID 20231996 .
  155. ^ G. Silvestri, Immunity in natural SIV infections. , in J Intern Med , vol. 265, n. 1, gennaio 2009, pp. 97-109, DOI : 10.1111/j.1365-2796.2008.02049.x , PMID 19093963 .
  156. ^ G. Grimaldi Jr, The utility of rhesus monkey (Macaca mulatta) and other non-human primate models for preclinical testing of Leishmania candidate vaccines. , in Mem Inst Oswaldo Cruz , vol. 103, n. 7, novembre 2008, pp. 629-44, PMID 19057811 .
  157. ^ KV. Anderson e PW. Ingham, The transformation of the model organism: a decade of developmental genetics. , in Nat Genet , 33 Suppl, marzo 2003, pp. 285-93, DOI : 10.1038/ng1105 , PMID 12610538 .
  158. ^ a b T. Sasado, M. Tanaka, K. Kobayashi, T. Sato, M. Sakaizumi e K. Naruse, The National BioResource Project Medaka (NBRP Medaka): an integrated bioresource for biological and biomedical sciences. , in Exp Anim , vol. 59, n. 1, 2010, pp. 13-23, PMID 20224166 .
  159. ^ JM. Fortier e TA. Graubert, Murine models of human acute myeloid leukemia. , in Cancer Treat Res , vol. 145, 2010, pp. 183-96, DOI : 10.1007/978-0-387-69259-3_11 , PMID 20306252 .
  160. ^ B. Zhang, Z. Duan e Y. Zhao, Mouse models with human immunity and their application in biomedical research. , in J Cell Mol Med , vol. 13, n. 6, giugno 2009, pp. 1043-58, DOI : 10.1111/j.1582-4934.2008.00347.x , PMID 18419795 .
  161. ^ DR. Reed, X. Li, AH. McDaniel, K. Lu, S. Li, MG. Tordoff, RA. Price e AA. Bachmanov, Loci on chromosomes 2, 4, 9, and 16 for body weight, body length, and adiposity identified in a genome scan of an F2 intercross between the 129P3/J and C57BL/6ByJ mouse strains. , in Mamm Genome , vol. 14, n. 5, maggio 2003, pp. 302-13, PMID 12856282 .
  162. ^ GL. Wolff e P. Whittaker, Dose-response effects of ectopic agouti protein on iron overload and age-associated aspects of the Avy/a obese mouse phenome. , in Peptides , vol. 26, n. 10, ottobre 2005, pp. 1697-711, DOI : 10.1016/j.peptides.2004.12.033 , PMID 15982784 .
  163. ^ L. Ding, WW. Kuhne, DE. Hinton, J. Song e WS. Dynan, Quantifiable biomarkers of normal aging in the Japanese medaka fish (Oryzias latipes). , in PLoS One , vol. 5, n. 10, 2010, pp. e13287, DOI : 10.1371/journal.pone.0013287 , PMID 20949019 .
  164. ^ A. Shima e A. Shimada, The Japanese medaka, Oryzias latipes, as a new model organism for studying environmental germ-cell mutagenesis. , in Environ Health Perspect , 102 Suppl 12, dicembre 1994, pp. 33-5, PMID 7713031 .
  165. ^ NY. Ho, VW. Li, WL. Poon e SH. Cheng, Cloning and developmental expression of kinesin superfamily7 (kif7) in the brackish medaka (Oryzias melastigma), a close relative of the Japanese medaka (Oryzias latipes). , in Mar Pollut Bull , vol. 57, n. 6-12, 2008, pp. 425-32, DOI :10.1016/j.marpolbul.2008.02.044 , PMID 18423496 .
  166. ^ IL. Iessi, A. Bueno, YK. Sinzato, KN. Taylor, MV. Rudge e DC. Damasceno, Evaluation of neonatally-induced mild diabetes in rats: Maternal and fetal repercussions. , in Diabetol Metab Syndr , vol. 2, n. 1, 2010, p. 37, DOI : 10.1186/1758-5996-2-37 , PMID 20529353 .
  167. ^ MR. Dwinell, EA. Worthey, M. Shimoyama, B. Bakir-Gungor, J. DePons, S. Laulederkind, T. Lowry, R. Nigram e V. Petri, The Rat Genome Database 2009: variation, ontologies and pathways. , in Nucleic Acids Res , vol. 37, Database issue, gennaio 2009, pp. D744-9, DOI : 10.1093/nar/gkn842 , PMID 18996890 .
  168. ^ J. Sedý, J. Zicha, J. Kunes, P. Jendelová e E. Syková, Rapid but not slow spinal cord compression elicits neurogenic pulmonary edema in the rat. , in Physiol Res , vol. 58, n. 2, 2009, pp. 269-77, PMID 18380532 .
  169. ^ SM. Cohen, LL. Arnold, M. Eldan, AS. Lewis e BD. Beck, Methylated arsenicals: the implications of metabolism and carcinogenicity studies in rodents to human risk assessment. , in Crit Rev Toxicol , vol. 36, n. 2, febbraio 2006, pp. 99-133, PMID 16736939 .
  170. ^ L. Shaughnessy, B. Chamblin, L. McMahon, A. Nair, MB. Thomas, J. Wakefield, F. Koentgen e R. Ramabhadran, Novel approaches to models of Alzheimer's disease pathology for drug screening and development. , in J Mol Neurosci , vol. 24, n. 1, 2004, pp. 23-32, DOI : 10.1385/JMN:24:1:023 , PMID 15314246 .
  171. ^ Don W. Wilson e Deeann Reeder, Mammal species of the world: a taxonomic and geographic reference , Baltimore, Johns Hopkins University Press, 2005, ISBN 978-0-8018-8221-0 .
  172. ^ L. Nanassy, J. Griffin, BR. Emery e DT. Carrell, The marmoset and cotton rat as animal models for the study of sperm chromatin packaging. , in Syst Biol Reprod Med , vol. 56, n. 3, giugno 2010, pp. 207-12, DOI : 10.3109/19396361003653311 , PMID 20536320 .
  173. ^ K. Chen, T. Baxter, WM. Muir, MA. Groenen e LB. Schook, Genetic resources, genome mapping and evolutionary genomics of the pig (Sus scrofa). , in Int J Biol Sci , vol. 3, n. 3, 2007, pp. 153-65, PMID 17384734 .
  174. ^ AL. Ferraz, A. Ojeda, M. López-Béjar, LT. Fernandes, A. Castelló, JM. Folch e M. Pérez-Enciso, Transcriptome architecture across tissues in the pig. , in BMC Genomics , vol. 9, 2008, p. 173, DOI : 10.1186/1471-2164-9-173 , PMID 18416811 .
  175. ^ AM. Reddy, Y. Zheng, G. Jagadeeswaran, SL. Macmil, WB. Graham, BA. Roe, U. Desilva, W. Zhang e R. Sunkar, Cloning, characterization and expression analysis of porcine microRNAs. , in BMC Genomics , vol. 10, 2009, p. 65, DOI : 10.1186/1471-2164-10-65 , PMID 19196471 .
  176. ^ B. Gesslein, G. Håkansson, R. Carpio, L. Gustafsson, MT. Perez e M. Malmsjö, Mitogen-activated protein kinases in the porcine retinal arteries and neuroretina following retinal ischemia-reperfusion. , in Mol Vis , vol. 16, 2010, pp. 392-407, PMID 20300568 .
  177. ^ J. Guduric-Fuchs, LJ. Ringland, P. Gu, M. Dellett, DB. Archer e T. Cogliati, Immunohistochemical study of pig retinal development. , in Mol Vis , vol. 15, 2009, pp. 1915-28, PMID 19784390 .
  178. ^ IK. Petropoulos, JA. Pournaras, AN. Stangos e CJ. Pournaras, Effect of systemic nitric oxide synthase inhibition on optic disc oxygen partial pressure in normoxia and in hypercapnia. , in Invest Ophthalmol Vis Sci , vol. 50, n. 1, gennaio 2009, pp. 378-84, DOI : 10.1167/iovs.08-2413 , PMID 18676634 .
  179. ^ F. Fallarino, G. Luca, M. Calvitti, F. Mancuso, C. Nastruzzi, MC. Fioretti, U. Grohmann, E. Becchetti e A. Burgevin, Therapy of experimental type 1 diabetes by isolated Sertoli cell xenografts alone. , in J Exp Med , vol. 206, n. 11, ottobre 2009, pp. 2511-26, DOI : 10.1084/jem.20090134 , PMID 19822646 .
  180. ^ K. Gelse, C. Mühle, O. Franke, J. Park, M. Jehle, K. Durst, M. Göken, F. Hennig e K. von der Mark, Cell-based resurfacing of large cartilage defects: long-term evaluation of grafts from autologous transgene-activated periosteal cells in a porcine model of osteoarthritis. , in Arthritis Rheum , vol. 58, n. 2, febbraio 2008, pp. 475-88, DOI : 10.1002/art.23124 , PMID 18240212 .
  181. ^ X. Zhang, J. Li, XY. Liu, YL. Sun, CM. Zhang e SL. Wang, Morphological characteristics of submandibular glands of miniature pig. , in Chin Med J (Engl) , vol. 118, n. 16, agosto 2005, pp. 1368-73, PMID 16157032 .
  182. ^ CM. Benskin, G. Rhodes, RW. Pickup, K. Wilson e IR. Hartley, Diversity and temporal stability of bacterial communities in a model passerine bird, the zebra finch. , in Mol Ecol , novembre 2010, DOI : 10.1111/j.1365-294X.2010.04892.x , PMID 21054607 .
  183. ^ M. Luo, Y. Yu, H. Kim, D. Kudrna, Y. Itoh, RJ. Agate, E. Melamed, JL. Goicoechea e J. Talag, Utilization of a zebra finch BAC library to determine the structure of an avian androgen receptor genomic region. , in Genomics , vol. 87, n. 1, gennaio 2006, pp. 181-90, DOI : 10.1016/j.ygeno.2005.09.005 , PMID 16321505 .
  184. ^ Y. Yamanoue, M. Miya, K. Matsuura, S. Miyazawa, N. Tsukamoto, H. Doi, H. Takahashi, K. Mabuchi e M. Nishida, Explosive speciation of Takifugu: another use of fugu as a model system for evolutionary biology. , in Mol Biol Evol , vol. 26, n. 3, marzo 2009, pp. 623-9, DOI : 10.1093/molbev/msn283 , PMID 19074759 .
  185. ^ YH. Loh, S. Brenner e B. Venkatesh, Investigation of loss and gain of introns in the compact genomes of pufferfishes (Fugu and Tetraodon). , in Mol Biol Evol , vol. 25, n. 3, marzo 2008, pp. 526-35, DOI : 10.1093/molbev/msm278 , PMID 18089580 .
  186. ^ S. Imai, T. Sasaki, A. Shimizu, S. Asakawa, H. Hori e N. Shimizu, The genome size evolution of medaka (Oryzias latipes) and fugu (Takifugu rubripes). , in Genes Genet Syst , vol. 82, n. 2, aprile 2007, pp. 135-44, PMID 17507779 .
  187. ^ V. Veeramachaneni e W. Makalowski, DED: Database of Evolutionary Distances. , in Nucleic Acids Res , vol. 33, Database issue, gennaio 2005, pp. D442-6, DOI : 10.1093/nar/gki094 , PMID 15608234 .
  188. ^ EJ. Pearl, CK. Bilogan, S. Mukhi, DD. Brown e ME. Horb, Xenopus pancreas development. , in Dev Dyn , vol. 238, n. 6, giugno 2009, pp. 1271-86, DOI : 10.1002/dvdy.21935 , PMID 19334283 .
  189. ^ E. Segerdell, JB. Bowes, N. Pollet e PD. Vize, An ontology for Xenopus anatomy and development. , in BMC Dev Biol , vol. 8, 2008, p. 92, DOI : 10.1186/1471-213X-8-92 , PMID 18817563 .
  190. ^ DA. Yergeau e PE. Mead, Manipulating the Xenopus genome with transposable elements. , in Genome Biol , 8 Suppl 1, 2007, pp. S11, DOI : 10.1186/gb-2007-8-s1-s11 , PMID 18047688 .
  191. ^ JB. Bowes, KA. Snyder, E. Segerdell, R. Gibb, C. Jarabek, E. Noumen, N. Pollet e PD. Vize, Xenbase: a Xenopus biology and genomics resource. , in Nucleic Acids Res , vol. 36, Database issue, gennaio 2008, pp. D761-7, DOI : 10.1093/nar/gkm826 , PMID 17984085 .
  192. ^ ML. Tomlinson, RA. Field e GN. Wheeler, Xenopus as a model organism in developmental chemical genetic screens. , in Mol Biosyst , vol. 1, n. 3, settembre 2005, pp. 223-8, DOI : 10.1039/b506103b , PMID 16880986 .
  193. ^ G. Kreil, Antimicrobial peptides from amphibian skin: an overview. , in Ciba Found Symp , vol. 186, 1994, pp. 77-85; discussion 85-90, PMID 7768159 .
  194. ^ I. Keller, IC. Chintauan-Marquier, P. Veltsos e RA. Nichols, Ribosomal DNA in the grasshopper Podisma pedestris: escape from concerted evolution. , in Genetics , vol. 174, n. 2, ottobre 2006, pp. 863-74, DOI : 10.1534/genetics.106.061341 , PMID 16951064 .
  195. ^ F. Ishikawa, [Incidence and recognition of malocclusion] , in Shikai Tenbo , vol. 63, n. 7, giugno 1984, pp. 1419-29, PMID 6593840 .
  196. ^ ML. Arnold, R. Appels e DD. Shaw, The heterochromatin of grasshoppers from the Caledia captiva species complex. I. Sequence evolution and conservation in a highly repeated DNA family. , in Mol Biol Evol , vol. 3, n. 1, gennaio 1986, pp. 29-43, PMID 3444395 .
  197. ^ R. Tollrian e F. Leese, Ecological genomics: steps towards unraveling the genetic basis of inducible defenses in Daphnia. , in BMC Biol , vol. 8, 2010, p. 51, DOI : 10.1186/1741-7007-8-51 , PMID 20529235 .
  198. ^ Florian Odronitz, Sebastian Becker & Martin Kollmar, Reconstructing the phylogeny of 21 completely sequenced arthropod species based on their motor proteins , in BMC Genomics , vol. 10, 2009, p. 173, DOI : 10.1186/1471-2164-10-173 .
  199. ^ JGI-Led Team Sequences Frog Genome , in GenomeWeb.com , Genome Web, 29 aprile 2010. URL consultato il 30 aprile 2010 (archiviato dall' url originale il 7 agosto 2011) .

Bibliografia

Voci correlate

Altri progetti

Collegamenti esterni

Biologia Portale Biologia : accedi alle voci di Wikipedia che trattano di biologia