Fold Rossmann

De la Wikipedia, enciclopedia liberă.
Salt la navigare Salt la căutare
Un exemplu de pli Rossmann în Staphylococcus epidermidis decarboxylase (PDB ID 1G5Q) care arată cofactorul legat al FMN .
Diagrama schematică a unui pli Rossmann cu șase fire
Vedere din față
Vedere laterală

Pliul Rossmann este un domeniu structural proteic al proteinelor care leagă nucleotidele , în special cofactorul NAD . [1] Structura cu două repetări este compusă din șase β-catene paralele, conectate la două perechi de helice α în ordinea topologică β-α-β-α-β. Deoarece fiecare pli Rossmann poate lega doar o singură nucleotidă, legăturile de domeniu pentru dinucleotide, cum ar fi NAD, constau din două pliuri Rossmann pereche care leagă fiecare o jumătate din nucleotida moleculei cofactorului. Pliurile individuale Rossmann pot lega mononucleotidele β, cum ar fi cofactorul FMN .

Motivul poartă numele lui Michael Rossmann , care a subliniat pentru prima dată că acesta este un motiv frecvent recurent în proteinele care se leagă de nucleotide, cum ar fi dehidrogenaza. [2]

În 1989, Israel Hanukoglu de la Institutul Weizmann a descoperit că secvența de consens pentru situsul de legare NADP în unele enzime care utilizează NADP diferă de motivul de legare NADP. [3] Această descoperire a fost utilizată pentru a re-proiecta specificitățile enzimelor. [4]

Notă

  1. ^ Hanukoglu I., Proteopedia: Rossmann fold: A beta-alfa-beta fold at dinucleotide binding sites , în Biochem Mol Biol Educ , vol. 43, nr. 3, 2015, pp. 206-209, DOI : 10.1002 / bmb.20849 , PMID 25704928 .
  2. ^ Rao S., Rossmann M., Comparația structurilor super-secundare în proteine , în J Mol Biol , vol. 76, nr. 2, 1973, pp. 241-56, DOI : 10.1016 / 0022-2836 (73) 90388-4 , PMID 4737475 .
  3. ^ Hanukoglu I., Gutfinger T., secvența ADNc a adrenodoxin reductazei. Identificarea siturilor de legare a NADP în oxidoreductaze. , în Eur J Biochem , vol. 180, n. 2, mar 1989, pp. 479-484, DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1989.tb14671.x , PMID 2924777 .
  4. ^ Scrutton NS, Berry A., Perham RN, Redesign al specificității coenzimei unei dehidrogenaze prin ingineria proteinelor. , în Nature , vol. 343, nr. 6253, ianuarie 1990, pp. 38-43, DOI : 10.1038 / 343038a0 , PMID 2296288 .