Topologie moleculară
În chimie , topologia moleculară reprezintă o aplicație a topologiei utilizate pentru a descrie și prezice structura chimică în limitele spațiului tridimensional . Pe baza legăturii chimice și a proprietăților chimice ale atomilor , acesta oferă un model care explică modul în care funcțiile undelor trebuie combinate pentru a da naștere unei molecule . Topologia moleculară face parte din studiul chimiei matematice și se ocupă cu descrierea algebrică a compușilor chimici , permițând astfel o caracterizare unică și simplă.
Topologia nu este afectată de detaliile unui câmp scalar și poate fi adesea determinată folosind calcule simplificate. Câmpurile scalare precum densitatea electronilor , câmpul Madelung , câmpul covalent și potențialul electrostatic pot fi introduse în modelul topologiei. [1]
Fiecare câmp scalar are propria sa topologie distinctă și fiecare oferă informații diferite despre natura legăturii chimice și a structurii. Analiza acestor topologii, atunci când este combinată cu teoria electrostatică simplă și unele observații empirice, conduce la un model cantitativ al legăturii chimice localizate. În acest fel, analiza oferă informații despre natura legăturii chimice.
Topologia aplicată explică modul în care moleculele mari își ating formele finale, precum și contabilizarea activității biologice a biomoleculelor . "Topologia circuitului" este o proprietate topologică a polimerilor liniari pliați. Această noțiune a fost aplicată analizei structurale a biomoleculelor, cum ar fi proteinele și ARN-ul . [2]
Indici topologici
Indicii topologici sunt ecuații care permit stabilirea corelației directe între relația cantitativă structură-activitate (QSAR) și proprietățile experimentale. Acești indici sunt utilizați în calculele QSAR pentru a raporta activitatea biologică sau alte proprietăți ale moleculelor la structura lor chimică.
Notă
- ^ I. David Brown, Topologie și chimie , în chimia structurală , vol. 13, n. 3-4, Springer, august 2002, pp. 339-355, DOI : 10.1023 / A: 1015872125545 .
- ^ Alireza Mashaghi, Roeland J. van Wijk și Sander J. Tans, Circuitul topologiei proteinelor și acizilor nucleici , în structură , vol. 22, n. 9, 2014, pp. 1227-1237, DOI : 10.1016 / j.str.2014.06.015 , PMID 25126961 .
linkuri externe
- (EN) Topologie moleculară , pe moleculartopology.com.
