Atlasul de proteine umane
Programul Atlas de proteine umane (în italiană: Atlas de proteine umane) este un program de cercetare științifică cu scopul de a explora întreaga ființă umană proteomă cu o abordare bazată pe anticorpi. Programul s-a născut la Royal Institute of Technology din Suedia în 2003 și a fost finanțat de organizația non-profit Knut și Fundația Alice Wallenberg (KAW).
Proiectul ia o abordare centrată pe genă, cu un efort de a mapa și caracteriza o proteină reprezentativă pentru fiecare genă umană care codifică o proteină (aproximativ 20.000 de gene). Anticorpii, atât umani, cât și anticorpii externi (comerciali) sunt validați în fluxul de proteine umane Atlas și sunt utilizați pentru caracterizarea proteinelor. Datele sunt publicate anual într-un portal cu o bază de date disponibilă publicului. [1] .
Baza de date include profiluri de expresie a proteinelor a 44 de cancere de țesut, 56 de linii celulare, localizare subcelulară și niveluri de expresie a transcrierii. Baza de date poate fi căutată pentru o anumită genă sau proteină. Cele mai recente funcționalități îmbunătățite permit, de asemenea, căutări combinate pentru a găsi toate proteinele exprimate într-un anumit organ sau țesut sau diferitele proteine exprimate pentru un anumit tip de tumoră.
Notă
- ^ Uhlen M, Oksvold P, Fagerberg L, Lundberg E, Jonasson K, Forsberg M, Zwahlen M, Kampf C, Wester K, Hober S, Wernerus H, Björling L, Ponten F, Towards a knowledge-based Human Protein Atlas , in Nature Biotechnology , vol. 28, n. 12, Dec 2010, pp. 1248-50, DOI : 10.1038 / nbt1210-1248 , PMID 21139605 .