OpenMM
OpenMM [1] este atât o bibliotecă open source, cât și un program de simulare a dinamicii moleculare menținut de PandeLab . Compatibil cu limbile Python, C ++, Fortran și altele, are posibilitatea de a fi accelerat pe GPU. De asemenea, este capabil să interacționeze cu alte instrumente de simulare moleculară, cum ar fi AMOEBA, Gromacs sau Amber . Creat de cercetătorul Vijay Pande, de la Universitatea din Standford, proiectul este acum disponibil gratuit pe GitHub .
Istoria programului
Prima versiune a programului, Preview Release 1, a fost lansată în septembrie 2008, în timp ce prima versiune stabilă, 1.0 a fost făcută publică în ianuarie 2010, incluzând deja suport pentru limbile OpenCL și Cuda gpu. Cea mai recentă versiune publicată este 7.5.0 din decembrie 2020.
Domeniul de aplicare
Limbajul OpenMM, datorită flexibilității și preciziei sale, este utilizat pentru cercetări în multe domenii, de la chimia teoretică la cercetarea bolilor precum boala Alzheimer sau coreea Hungtinton.
Proiecte asociate
Proiectul Folding @ Home este construit în întregime în jurul bibliotecii OpenMM.