SIMAP
Matricea de similaritate a proteinelor (SIMAP) este o bază de date publică care stochează date despre secvențele de proteine și utilizează calcule distribuite pentru a detecta similitudini.
Utilizați Berkeley Open Infrastructure for Network Computing (BOINC) ca platformă pentru calcul distribuit. Proiectul a fost închis în mai 2014.
Obiectivele proiectului
Baza de date SIMAP este actualizată continuu și stochează toate proteinele cunoscute. Dintre toate proteinele existente, doar o fracțiune a fost studiată suficient pentru a le descoperi funcția. Ideea pleacă de la presupunerea că proteinele similare au probabil funcții similare. Prin urmare, prin baza de date SIMAP ar fi posibil să se investigheze comportamentul proteinelor similare celor mai „importante”, cum ar fi cele referitoare la boli sau medicamente.
Prin donarea puterii de calcul către SIMAP, contribuiți la extinderea și actualizarea bazei de date.
Software
Simap este dezvoltat de către studenții de bioinformatică Mathias Walter și Michael Böhme.
Există binare precompilate specifice sistemului de operare și arhitecturii. Sistemele de operare acceptate sunt: GNU / Linux , Microsoft Windows , FreeBSD , HP-UX ,Solaris (sistem de operare) , NetBSD .
Există diferite binare atât pentru IA-32, cât și pentru IA-64 .
Software-ul este optimizat pentru procesoare: PARSIC, SUN UltraSparc , toate procesoarele AMD și Intel .
Cea mai recentă versiune a simap pentru Linux este 5.11 lansată pe 17 iulie 2006 .
Elemente conexe
linkuri externe
- ( RO ) Site oficial , pe boincsimap.org . Adus la 17 octombrie 2011 (arhivat din original la 22 ianuarie 2011) .
- ( RO ) Descrierea detaliată a proiectului la MIPS