Codificare în bare ADN
Codarea în bare a ADN-ului este o metodă moleculară dezvoltată pentru a identifica entitățile biologice și se bazează pe analiza variabilității unui marker molecular . În regnul animal, așa-numitele metazoane , principalul marker utilizat este un fragment al genei mitocondriale care codifică subunitatea I a citocrom oxidazei .
Principiu
Principiul din spatele metodei derivă din contribuția lui Carl Woese care a introdus abordarea moleculară ca standard pentru identificarea organismelor procariote : datorită primelor aplicații ale acestor studii asupra secvențelor genelor ribozomale ( ARNr ), s-au descoperit Archaea . Studiul variabilității markerilor moleculari a devenit apoi utilizat pe scară largă pentru analiza populației, incluzând diverși markeri: ARNr , alozime , microsateliți , AFLP etc.
Anunțuri
Codul de bare ADN s-a născut dintr-o inițiativă a lui Paul DN Hebert de la Universitatea din Guelph, Ontario , Canada . Deși nu este revoluționar din punct de vedere metodologic, marea noutate a codării cu bare ADN este amploarea analizei și standardizarea metodei. În urma numeroaselor lucrări științifice, diferite organisme promovează proiecte ambițioase cu scopul de a asocia una sau câteva secvențe de ADN capabile să identifice în mod unic fiecare organism viu.
Aplicații
Această metodă, aplicabilă întregii scări a ființelor vii, a dat naștere unui număr mare de aplicații în diferite sectoare: de la entomologia criminalistică la căutarea contrafacerilor alimentare.
Laboratoare italiene asociate cu CBOL
- Antonio Ruberti Institutul de Analiza Sistemelor și Informatică - Consiliul Național de Cercetare
- Institutul Zoopropilactic Experimental din Piemont
- Universitatea Tor Vergata din Roma, Departamentul de Biologie
- Centrul internațional pentru inginerie genetică și biotehnologie
- Universitatea din Udine
- ZooPlantLab - Universitatea din Milano Bicocca
Centre de servicii
- FEM2 - Mediu Site oficial al spin-off-ului Departamentului de Biotehnologie și Biosciences al Universității din Milano-Bicocca
- BMR Genomics , spin off de la Universitatea din Padova - CRIBI
Bibliografie
- Hebert PD, Cywinska A, Ball SL, deWaard JR (2003). Identificări biologice prin coduri de bare ADN [ link rupt ] . Proc Biol Sci , 270: 313-321.
- Hebert PD, Ratnasingham S, deWaard JR (2003). Codificarea barelor vieții animale: subunitatea 1 citocrom c oxidază divergențe între speciile înrudite . Proc Biol Sci , 270 Suppl 1: S96-S99.
Alte proiecte
- Wikimedia Commons conține imagini sau alte fișiere despre codul de bare ADN
linkuri externe
- Baza de date a codului de bare al vieții , pe barcodinglife.org .
- Cod de bare internațional al vieții , pe dnabarcoding.org .
- Consorțiu pentru codul de bare al vieții , pe barcoding.si.edu . Adus la 28 iunie 2008 (arhivat din original la 21 iunie 2008) .
- Inițiativa Cod de bare a vieții peștilor (FISH-BOL) , la fishbol.org . Adus la 17 august 2019 (depus de „url original 23 mai 2018).
- Toate Păsări Inițiativa de codificare în linie (ABBI) , pe barcoding.si.edu. Adus la 28 iunie 2008 (arhivat din original la 12 mai 2013) .
- Site-ul Polar Flora and Fauna Barcoding (Ultimul avanpost din Arctica canadiană pe teren)
- Blogul Codului de bare al vieții , la phe.rockefeller.edu .
- Liniile directoare pentru selecția genei non-COI ( PDF ), pe barcoding.si.edu . Adus la 28 iunie 2008 (arhivat din original la 16 decembrie 2008) .