Escherichia coli O104: H4
Escerichia coli O104: H4 este o tulpină enteroagregativă a bacteriei Escherichia coli , a fost cauza focarului Escherichia coli O104: H4 din 2011. [1] „O” din clasificarea serologică identifică antigenul lipopolizaharidic al peretelui celular și „H” identifică antigenul flagelului.
Analiza secvenței genomice obținută de BGI Shenzhen arată că tulpina epidemică O104: H4 este un tip enteroagregativ de E. coli (EAEC sau EAggEC) care a dobândit gene ale toxinei Shiga , probabil prin transfer orizontal de gene . [2] [3] [4] genomică de asamblare a confirmat că două copii ale toxinei Shiga stx2 prophage gena clusterul sunt o trăsătură distinctivă a genomului de O104: tulpina epidemice H4. [5] [6]
Tulpina O104: H4 se caracterizează prin acești markeri genetici: [7]
- Toxină Shiga pozitivă stx2
- genă pozitivă de rezistență la telurit de tip cluster
- gena de adeziune intimin negativă
- Există β-lactamază ampC, AMPD, Ampe, AMPG, AMPH.
Abordarea integrată a securității alimentare a Comisiei Europene (CE) [8] definește un caz de diaree de la toxina producătoare de E. coli similară cu Shiga (STEC) cauzată de debutul acut al diareei O104: H4 sau diareea sângeroasă împreună cu detectarea toxina Shiga 2 (Stx2) sau gena Shiga stx2 . [9] Înainte de izbucnirea din 2011, un singur caz identificat ca O104: H4 a fost observat la o femeie din Coreea de Sud în 2005. [10]
THE. coli O104: H4 este dificil de tratat, deoarece este rezistent la multe antibiotice, deși este sensibil la carbapeneme . [11]
Notă
- ^ Alexander Mellman, D Harmsen și CA Cummings, Caracterizarea genomică prospectivă a Escherichia coli enterohemoragică germană O104: focar H4 prin tehnologia rapidă de secvențiere a următoarei generații , în PLoS One , vol. 6, nr. 7, 20 iulie 2011, pp. e22751, DOI : 10.1371 / journal.pone.0022751 , PMID 21799941 .
- ^ genomics.cn , http://www.genomics.cn/en/news_show.php?type=show&id=644 . Adus pe 2 iunie 2011 .
- ^ David Tribe, biofortified.org , http://www.biofortified.org/2011/06/bgi-sequencing-news-german-ehec-strain-is-a-chimera-created-by-horizontal-gene-transfer/ . Adus pe 2 iunie 2011 .
- ^ Maev Kennedy și agenții, Focar de E. coli : OMS spune că bacteria este o nouă tulpină , Londra, guardian.co.uk, 2 iunie 2011. Accesat la 4 iunie 2011 .
- ^ genomics.cn , http://www.genomics.cn/en/news_show.php?type=show&id=660 . Adus la 20 iunie 2011 .
- ^ bioinf.jku.at , http://www.bioinf.jku.at/research/ehec/ehec.html . Adus la 15 iunie 2011 .
- ^ rki.de , http://www.rki.de/cln_178/nn_217400/EN/Home/EHECO104,templateId=raw,property=publicationFile.pdf/EHECO104.pdf . Adus la 15 iunie 2011 .
- ^ ec.europa.eu , http://ec.europa.eu/food/intro_en.htm .
- ^ ec.europa.eu , http://ec.europa.eu/food/food/docs/STEC-HUS_CaseDefinition_03062011_en.pdf . Adus la 16 iunie 2011 .
- ^ WK Bae, YK Lee și MS Cho, Un caz de sindrom uremic hemolitic cauzat de Escherichia coli O104: H4 , în Yonsei Medical Journal , vol. 47, nr. 3, 30 iunie 2006, pp. 473–479, DOI : 10.3349 / ymj.2006.47.3.437 , PMID 16807997 .
- ^ Gorman, Christine. „E. Coli în martie: Scientific American”. Știri, articole și informații științifice | American științific. Scientific American, 7 august 2011. Web. 08 noiembrie 2011. < http://www.scientificamerican.com/article.cfm?id=e-coli-on-the-march >.