Pentru a sparge izolarea în care căzuse SDP după 1960 , el a propus să îmbunătățească relațiile cu președintele Republicii Urho Kekkonen , cu comuniștii finlandezi și cu Uniunea Sovietică . Linia lui, aprobat de către partid, a condus la victoria electorală din 1966 , care a permis președintelui PSD, Rafael Paasio , pentru a forma un guvern de coaliție cu comuniștii și centriștii, în care a obținut Koivisto Ministerul Finanțelor (1966 1968 ) și a luat măsuri monetare și fiscale dure pentru a restabili economia.
După demisia guvernului Paasio (1968), Koivisto a fost numit guvernator al Băncii Finlandei . El a format un guvern de centru-stânga (1968- 1970 ) care a trebuit să facă față problemelor legate de transformarea companiei tradiționale finlandeze (impozite, transfer de fermieri, alcoolism , avort ) cu reforme importante, dar, deși căile sale sincere și informale ar trebui a devenit omul cel mai popular politician național din anii săi, alegerile din 1970 au adus o înfrângere guvernului său, obligându-l să demisioneze. Mai mult, atât președintele Kekkonen , cât și guvernul sovietic s-au opus planurilor sale pentru o uniune economică scandinavă (Nordek). Încă ministru al finanțelor într-un nou guvern Paasio ( 1972 ), a trebuit să înfrunte creșterea datoriei externe în urma crizei din anii 1970 .
Președinte al Consiliului de stat pentru a doua oară ( 1979 - 1982 ), cu un guvern de centru-stânga, a menținut o politică de profil redus pentru a evita conflictele interne, dar a rezistat încercărilor președintelui Kekkonen de a-l împinge să demisioneze.
În funcția de președinte al Republicii după demisia lui Kekkonen (1981-1982), a fost ales președinte în 1982 și reconfirmat în 1988 cu o largă majoritate. El a redus metodele cvasiprezidențiale ale predecesorului său de a transfera politica finlandeză înapoi la parlamentarism . A menținut relații bune cu conducerea sovietică până la dizolvarea URSS ( 1991 ), apoi a adoptat o politică clar-pro-occidentală de colaborare cu NATO și orientată spre aderarea la Uniunea Europeană . Deja în timpul mandatului său a publicat mai multe lucrări autobiografice despre cariera sa politică, intrând în conflict cu biografii lui Kekkonen cu privire la opera predecesorului său.
La sfârșitul mandatului său, s-a remarcat și pentru numeroasele sale critici, care au primit o primire diferită: în toamna anului 1999 a primit un premiu de pace din partea Comitetului de 100 pentru că a criticat războiul aerian condus de NATO împotriva Iugoslaviei în timpul Războiul din Kosovo .