Neighbor-net

Această intrare pe subiectul computerului este orfană , ceea ce înseamnă că nu există legături de intrare din alte intrări . Introduceți cel puțin unul relevant și non-generic și eliminați avertismentul. Urmați sfaturile de proiectare de referință .

Această intrare pe tema bioinformaticii este doar o schiță . Contribuiți la îmbunătățirea acestuia în conformitate cu convențiile Wikipedia . Urmați sfaturile de proiectare de referință .

Neighbor-net (de asemenea, NeighborNet) este un algoritm folosit pentru a construi copaci filogenetici , bazat în mod vag pe algoritmul „aderării vecinilor”. ^[1] La fel ca acesta din urmă, metoda ia ca intrare o matrice de distanță și funcționează prin aglomerări de clustere. Cu toate acestea, algoritmul vecin-net poate returna colecții de clustere care se suprapun și nu formează o ierarhie. Aceste colecții sunt reprezentate folosind un tip de rețea filogenetică numită „rețea divizată”. Dacă distanța matricei îndeplinește condițiile combinatorii ale lui Kalmanson, netul vecin returnează ordinea circulară corespunzătoare. Metoda este implementată de software-ul SplitsTree.

Notă

Bibliografie

• Bryant, D. și V. Moulton, Neighbor-net, o metodă aglomerativă pentru construirea rețelelor filogenetice , în Molecular Biology and Evolution 21 , 2003.

linkuri externe

• splitstree.org , http://www.splitstree.org Titlu lipsă pentru url url ( ajutor ) . URL consultat la www.splitstree.org .