Orotidin-5'-fosfat decarboxilază
| Orotidin-5'-fosfat decarboxilază | |
|---|---|
 Model tridimensional al enzimei de la E. coli [1] | |
| Numărul CE | 4.1.1.23 |
| Clasă | Lioza |
| Alte nume | |
| Uridin monofosfat sintetaza (UMPS) | |
| Baze de date | BRENDA , EXPASY , GTD , PPB ( RCSB PPB PDBe PDBj PDBsum ) |
| Sursa:IUBMB | |
Orotidina-5'-fosfat decarboxilaza ( decarboxilaza OMP) este o enzimă aparținând clasei liaselor implicată în biosinteza pirimidinelor . Catalizează decarboxilarea orotidinei monofosfat (OMP) pentru a forma uridina monofosfat (UMP). Funcția acestei enzime este esențială pentru biosinteza de novo a nucleotidelor pirimidinice trifosfat de uridină, trifosfat de citidină și trifosfat de timidină.
Cataliză
OMP decarboxilaza este cunoscută a fi un catalizator extraordinar de eficient, capabil să accelereze viteza de reacție cu un factor de 10 17 . Cu alte cuvinte, enzima este capabilă să catalizeze substratul în 18 milisecunde, într-o reacție care, în mod normal, ar fi trebuit să aibă loc 78 de milioane de ani în absența enzimei. [2] Această eficiență enzimatică extremă este deosebit de interesantă deoarece OMP decarboxilaza nu folosește cofactori și nu conține metale [3] sau grupări protetice. [4] Cataliza se bazează pe câteva reziduuri încărcate de aminoacizi poziționate în situsul activ al enzimei.
Notă
- ^(EN) Harris P, Poulsen Navarro JC, Jensen KF, S Larsen, Bază structurală pentru mecanismul catalitic al unei enzime competente: orotidină 5'-monofosfat decarboxilază , în Biochimie , vol. 39, aprilie 2000, pp. 4217–24, DOI : 10.1021 / bi992952r , PMID 10757968 .
- ^(EN) Radzicka A, R Wolfenden, O enzimă competentă , în Știință , vol. 267, nr. 5194, ianuarie 1995, pp. 90–3, DOI : 10.1126 / science.7809611 , PMID 7809611 .
- ^(EN) Miller BG, Smiley JA, Short SA, Wolfenden R, Activity of drojdie orotidin-5'-fosfat decarboxilază în absența metalelor , în J. Biol. Chem. , vol. 274, nr. 34, august 1999, pp. 23841–3, DOI : 10.1074 / jbc.274.34.23841 , PMID 10446147 .
- ^(EN) BG Miller, R Wolfenden, Competență catalitică: cazul neobișnuit al decarboxilazei OMP , în Annu. Pr. Biochem. , vol. 71, 2002, pp. 847–85, DOI : 10.1146 / annurev.biochem.71.110601.135446 , PMID 12045113 .
