Proiectarea proteinelor
Proiectarea proteinelor , mai bine cunoscută sub numele de proteine , are ca scop crearea de noi secvențe de proteine care au activități specifice. Fundamental pentru proiectare este cunoașterea relației dintre secvență-structură-funcție.
Proteinele pot fi proiectate de la zero ( proiectare de novo sau design de novo ) sau prin variații vizate ale secvențelor de proteine cunoscute ( reproiectarea proteinelor ). Abordările către proiectarea rațională a proteinelor creează predicții ale secvențelor de proteine care se vor plia în structuri specifice.
Aceste secvențe prezise pot fi confirmate experimental prin metode precum sinteza peptidică , mutageneză directă in situ sau sinteza genetică artificială.
Proiectarea rațională a proteinelor datează de la mijlocul anilor 1970, deși abordările s-au bazat în principal pe compoziția secvențelor și nu au luat în considerare interacțiunile specifice între lanțuri la nivel atomic [1] .
Recent, îmbunătățirile în câmpurile de forță moleculară, algoritmii de proiectare a proteinelor și bioinformatica structurală, cum ar fi bibliotecile de conformare a aminoacizilor , au condus la dezvoltarea avansată de instrumente avansate pentru proiectarea calculată a proteinelor. Aceste instrumente de calcul pot face calcule complexe privind flexibilitatea și energia proteinelor și pot efectua căutări pe spații mari de configurare, care nu sunt posibile manual. Datorită acestui fapt, proiectarea proteinelor este unul dintre cele mai importante instrumente de inginerie a proteinelor .
Notă
- ^ Richardson JS & Richardson DC, Proiectarea de novo a structurilor proteice , în Tendințe în științe biochimice , vol. 14, n. 7, 1989, pp. 304-9, DOI : 10.1016 / 0968-0004 (89) 90070-4 , PMID 2672455 .
