Baza de date cu identificări proteomice

Această intrare despre subiectul biologie este orfană , ceea ce înseamnă că nu există legături de intrare din alte intrări . Introduceți cel puțin unul relevant și non-generic și eliminați avertismentul. Urmați sfaturile de proiectare de referință .

PRIDE ( baza de date PRoteomics IDEntifications , în italiană: Baza de date pentru identificări proteomice) este unul dintre cele mai proeminente depozite publice de date de spectrometrie de masă bazate pe date proteomice și este întreținut de Institutul European de Bioinformatică ca parte a echipei de servicii Proteomics.

PRIDE stochează trei tipuri diferite de informații: identificări de peptide și proteine ​​derivate din experimente de spectrometrie de masă, spectre de masă ca listă a vârfurilor și orice metadate asociate. Secvențele peptidice ar putea fi păstrate ca parte a identificărilor.

În septembrie 2010 , PRIDE conține mai mult de 13.000 de experimente, 4 milioane de identificări ale proteinelor, 20 de milioane de identificări ale peptidelor și mai mult de 104 milioane de spectre. Un set de date PRIDE tipic conține mai multe experimente.

Multe alte baze de date proteomice au fost create în trecut, cum ar fi GPMDB , PeptideAtlas , Proteinpedia și NCBI Peptidome .

Împreună cu NCBI Peptidome, PRIDE constituie un depozit structurat de date care stochează datele experimentale originale ale cercetătorilor și nu își asumă niciun control editorial asupra datelor introduse. NCBI Peptidome a fost activ discontinuu și toate datele sale au fost transferate către PRIDE.

linkuri externe

• ( EN ) PRIDE , pe ebi.ac.uk.
• ( RO ) PRIDE Inspector pe Google Code , la code.google.com .