Toba de esapament (ADN)
În genetică , un amortizor de zgomot este o secvență ADN capabilă să lege factorii de reglare a transcripției , numiți represori . ADN-ul conține genele și oferă șablonul pentru fabricarea ARN-ului mesager (ARNm), care este utilizat pentru sinteza proteinelor care activează sau inactivează expresia genelor în celulă. Când un represor se leagă de regiunea amortizorului de ADN, acesta inhibă legarea promotorului de ARN polimeraza - enzima care este implicată în transcrierea ADN în ARN - și, prin urmare, blochează sinteza. Prin urmare, funcția amortizoarelor de zgomot este de a preveni expresia genelor.
ARN polimeraza călătorește prin secvențele de nucleotide ADN în direcția 3 '→ 5' și sintetizează ARN mesager în direcția 5 '→ 3'. ARN este similar ADN-ului, dar conține Uracil, în locul timinei, care se împerechează cu adenina. O regiune importantă pentru reprimarea și exprimarea genei găsite în ARN este regiunea 3 ' neexprimată (3'UTR): este regiunea terminalului 3' al ARN care nu va fi tradusă în proteine, dar care conține diferite situri de reglare. .
În acest moment nu se știu prea multe despre amortizoarele de zgomot, dar cercetătorii lucrează pentru a clasifica noi tipuri, a localizării lor în genom și a studia manifestările patologice asociate acestora.
Funcţie
Localizarea în genom
Un amortizor de zgomot este o secvență specifică de nucleotide care determină inhibarea transcrierii genelor și poate fi găsit în diferite locații din ADN. Cea mai comună poziție este situată în amonte de gena țintă - a cărei transcripție urmează să fie reprimată - și în mod normal distanța dintre amortizor și secvența de inhibat este cuprinsă între -20 bp și -2000 bp. [1] Anumite tipuri de amortizoare de zgomot pot fi găsite și în aval de un promotor situat în intronul sau exonul genei în sine. Cercetătorii au găsit amortizoare de zgomot speciale în regiunea 3'UTR a ARN-ului mesager. [2]
Tipuri
În prezent, au fost clasificate două tipuri principale de amortizoare de zgomot: elemente de amortizor de zgomot tip NRE clasice și neclasice . În amortizoarele de zgomot clasice independente de poziție, gena este în mod activ reprimată de amortizorul în sine, care interferează cu asamblarea factorilor de transcripție generală (GTF). [2] NRE-urile dependente de poziție, pe de altă parte, acționează pasiv, de obicei prin inhibarea altor elemente situate în amonte de genă. Unele dintre aceste amortizoare de zgomot pasive sunt dependente de orientare, ceea ce înseamnă că factorul de legare funcționează într-o anumită direcție care afectează alte secvențe. O formă specială de amortizoare de zgomot este dependentă de promotor, care depinde și de poziție / orientare, dar trebuie să utilizeze și un factor specific promotorului. [2] S- au descoperit recent elemente de răspuns ale proteinelor PREs din grupul Polycomb care permit sau inhibă reprimarea genelor în funcție de proteina de care sunt legate și de prezența transcripției necodificate . [1]
Notă
- ^ a b Glenn Maston, Sarah Evans și Michael Green, Elemente de reglementare transcripționale în genomul uman ( PDF ), în Revista anuală , 23 mai 2006. Accesat la 2 aprilie 2013 .
- ^ a b c Steven Ogbourne și Toni Antalis, Controlul transcripțional și rolul amortizoarelor în reglarea transcripțională în eucariote ( PDF ), în PubMed , 1998, PMC 1219314 . Adus pe 2 aprilie 2013 .
