Argonaut
| Argonaut | |
|---|---|
 O proteină argonaută cristalizată din Pyrococcus furiosus (PDB 1u04) | |
Proteinele argonaute (înțelesul italian argonauta este mai puțin utilizat) sunt componenta catalitică a complexului de reducere a silenției indus de ARN (denumit în mod obișnuit RISC), complexul riboproteic responsabil pentru procesul de silențiere a expresiei genice cunoscut sub numele de interferența ARN (sau RNAi).
Argonauții sunt de fapt capabili să lege fragmente mici de ARN care interferează (în special firul de ghidare ) și să desfășoare activitate de endonuclează împotriva ARNm-urilor complementare de același fir de ghidare. Proteinele sunt, de asemenea, responsabile pentru selectarea șirului de ghidare corect, precum și pentru degradarea celui complementar (definit de unii pasageri ) [1] .
Proteinele au fost localizate la concentrații mari în regiunile citoplasmei celulare cunoscute sub numele de corpuri citoplasmatice [2] .
Mai precis, există dovezi că proteinele argonaute sunt singurele care sunt întotdeauna prezente în diferitele forme ale complexelor RISC. În unele cazuri, cum ar fi într-un RISC identificat în Drosophila melanogaster , argonautul a fost găsit ca fiind singura proteină din complex. Acest lucru pare să sugereze că astfel de proteine pot fi prin ele însele capabile să inițieze interferența ARN .
Structura
Proteinele argonaute identificate până acum constau din două domenii. Un domeniu numit PAZ la terminalul N și un PIWI la terminalul C.
Domeniul PAZ este implicat în legarea ARN. Acest rol a fost confirmat de cristalizarea unui domeniu PAZ legat de o dublă spirală de ARN cu o structură similară cu un ARNsi.
Domeniul PIWI constă dintr-un canal încărcat pozitiv, care îi conferă caracteristicile unei proteine care leagă ARN , deoarece acidul ribonucleic este încărcat negativ. Există dovezi că domeniul PIWI are, de asemenea, o structură similară cu cea a unei H RNase . Acest lucru ne permite să facem ipoteza că domeniul PIWI este responsabil pentru degradarea mARN-urilor țintă mediată de argonauți [3] .
Notă
- ^(EN) Rand TA, Petersen S, Du F, Wang X. (2005). Argonaute2 clivează firul anti-ghid al siARN în timpul activării RISC. Celula 123 (4): 621-9
- ^(EN) Sen GL, Blau HM. (2005). Argonautul 2 / RISC se află în siturile de dezintegrare a ARNm la mamifere cunoscute sub numele de corpuri citoplasmatice. Nat Cell Biol 7 (6): 633-6
- ^(EN) Parker JS, Roe SM, Barford D. (2004). Structura cristalină a unei proteine PIWI sugerează mecanisme pentru recunoașterea siRNA și activitate pentru feliere. EMBO J., 23, 4727-4737
Bibliografie
- (EN) Parker JS, Roe SM, Barford D. (2005). Prezentări structurale în recunoașterea ARNm dintr-un domeniu PIWI - complex de ghid siARN. Nature, 434, 663-666 , pe ncbi.nlm.nih.gov .
- ( EN ) Interferența ARN și reducerea ARN-ului , de către British Institute of Cancer Research .
