Clubul a fost fondat la Vlore la 23 martie 1923 cu numele de Shoqeria Sportive Vlorë împreună cu Milto Korçari , cu scopul de a promova practicarea fotbalului într-un mod organizat. Primul președinte este Milto Korçari, primul secretar Malo Ismaili și trezorierul este Faslli Zoga. Clubul se întreține prin donațiile membrilor săi și prin fonduri strânse din diferitele activități desfășurate în oraș. Shoqeria Sportive a debutat împotriva Shoqëria Sportive Jeronim de Rada , o echipă de studenți valonezi, și a remizat cu 2-2. Obiectivele Shoqeria Sportive sunt de la Adem Gavani și Hazbi Tepelena.
În anii 1920, echipa a jucat diverse amicale cu alte echipe albaneze și chiar străine. Sunt demne de remarcat meciurile împotriva lui Crnogorac Cetinje și a Istituto Navale di Livorno , ambele câștigate de valonezi, 1-0 și 3-2. Shoqeria Sportive Vlorë este membru fondator al federațieialbaneze de fotbal și participă la prima ediție a campionatului albanez de fotbal , în care debutează împotriva Skënderbeu Korçë în Vlore, câștigând cu 2-0. Căpitanul primei echipe este Jani Kosta. Încheie primul campionat pe ultimul loc, cu două victorii, obținute împotriva lui Skënderbeu Coriza și Urani Elbasan (1-2 în deplasare), două remize (0-0 la Skënderbeu Coriza 1-1 acasă cu Bashkimi Scutari ) și șase înfrângeri.
Epoca de aur a lui KS Flamurtari este în anii optzeci . În sezonul 1986-1987 , Flamurtari a participat la Cupa UEFA , unde a fost eliminat de Barcelona doar pentru regula golurilor în deplasare (1-1 în Vlore, 0-0 la Camp Nou ). În sezonul următor , clubul Vlore a participat din nou la Cupa UEFA. În prima rundă l-a eliminat pe Partizan (2-0 în Vlore și 1-2 în Belgrad ) și în runda a doua s-a întâlnit cu est-germani de la Wismut Aue , eliminându-i (1-0 în Aue și 2-0 în Vlore). În turul al treilea a întâlnit din nou Barcelona: primul meci de la Camp Nou s-a încheiat cu 4-1 pentru catalani, în timp ce în turul secund Flamurtari a câștigat cu 1-0, o victorie istorică pentru clubul albanez, care a fost însă eliminat.
La 4 noiembrie 2014, Ernestino Ramella , antrenor italian, stă pe banca lui Flamurtari Valona, cu tot personalul său tehnic, compus din al doilea antrenor Paolo Doto și antrenorul atletic Maurizio Milana .
Roșu , negru
Valona
Albania
Sezonul curent
Franc Veliu (2010-2015)
Tomislav Bušić (2017-prezent)
Partizan
Erzgebirge Aue
Barcelona
IFK Göteborg
Motherwell
Budućnost
Jablonec
Honvéd
Sioni Bolnisi
Petrolul Ploiești
