Descriptor molecular
Un descriptor molecular în chimie este un sistem pentru caracterizarea unei molecule care vă permite să comparați diferite molecule și să căutați molecule conexe într-o bază de date . Acesta constă în reprezentarea matematică formală a unei molecule capabile să transforme informațiile chimice, codificate într-o reprezentare simbolică a aceleiași molecule, într-o valoare numerică utilă. [1]
Descriptorii moleculari sunt utilizați în caracterizarea proprietăților compușilor chimici în domenii științifice precum toxicologia , chimia analitică , chimia fizică , chimia farmaceutică și chimia mediului .
Conceptul
Conceptul de „descriptor molecular” este strâns legat de structura moleculară și proprietățile observabile experimental ale unei molecule. Valorile numerice care exprimă descriptorii moleculari pot fi obținute din proprietățile chimico-fizice experimentale ale moleculelor sau teoretic prin formule matematice și algoritmi de calcul.
Teoriile care stau la baza formulării descriptorilor moleculari sunt diferite și au un caracter multidisciplinar: ele variază de la chimia cuantică și chimia organică , până la teoria informației și teoria graficelor .
Exemple
Au fost propuși peste 5000 de descriptori moleculari posibili, [1] derivați din diferite teorii și abordări și obținuți utilizând software specific. Cele mai simple sunt reprezentate de proprietățile macroscopice ale moleculei, cum ar fi greutatea moleculară sau gradul de lipofilicitate .
Mai detaliați sunt descriptorii care caracterizează molecula în extensia sa spațială, împărțiți în descriptori bidimensionali (pe baza formulei structurale ) și tridimensionali (pe baza structurii tridimensionale actuale a moleculei). Exemple de descriptori 2D sunt grafice moleculare sau descriptori mai simpli, cum ar fi indicii topologici (gradul de conexiune, prezența inelelor ...) și amprentele structurale (prezența sau absența anumitor grupuri). Printre descriptorii 3D se numără în schimb amprentele PPP ( potențiale puncte farmacore), matricele de distanță (care conțin toate distanțele dintre atomi ), descrierea câmpurilor tridimensionale (de exemplu, sterice sau electrostatice).
Notă
- ^ a b Tomasz Puzyn, Jerzy Leszczynski, Mark TD Cronin, Recent Advances in QSAR Studies: Methods and Applications , Springer Science & Business Media, 2010, p. 30, ISBN 1-4020-9783-2 .
Bibliografie
- Roberto Todeschini, Viviana Consonni, Handbook of Molecular Descriptors , John Wiley & Sons, 2008, ISBN 3-527-61311-0 .
