CellProfiler
Salt la navigare Salt la căutare
| CellProfiler software | |
|---|---|
| Tip | |
| Ultima versiune | 4.1.3 (16 februarie 2021) |
| Sistem de operare | Linux macOS |
| Limba | Piton |
| Licență | Licență BSD ( licență gratuită ) |
| Site-ul web | cellprofiler.org |
CellProfiler [1] [2] este un program gratuit, open-source , de domeniu public, conceput de Broad Institute pentru a facilita biologii fără a fi nevoie să se antreneze în vederea computerizată sau să programeze automat măsurarea cantitativă a fenotipurilor din mii de imagini. Algoritmii avansați de analiză a imaginilor sunt module individuale care pot fi inserate secvențial pentru a forma o conductă , care este utilizată pentru a identifica și măsura obiecte biologice din imagini, în special cele obținute cu microscopul de fluorescență . Prima versiune a fost lansată în 2005, în timp ce ultima, 3.1.5, în 2018.
Notă
- ^ Carpenter AE, Jones TR, Lamprecht MR, Clarke C, Kang IH, Friman O, Guertin DA, Chang JH, Lindquist RA, Moffat J, Golland P, Sabatini DM,CellProfiler: software de analiză a imaginii pentru identificarea și cuantificarea fenotipurilor celulare , în Genomul Biologie , vol. 7, nr. 10, 2006, pp. R100, DOI : 10.1186 / gb-2006-7-10-r100 , PMC 1794559 , PMID 17076895 .
- ^ Kamentsky L, Jones TR, Fraser A, Bray MA, Logan DJ, Madden KL, Ljosa V, Rueden C, Eliceiri KW, Carpenter AE,Structură îmbunătățită, funcție și compatibilitate pentru CellProfiler: software modular de analiză a imaginilor cu randament ridicat , în Bioinformatică , vol. 27, n. 8, aprilie 2011, pp. 1179–80, DOI :10.1093 / bioinformatics / btr095 , PMC 3072555 , PMID 21349861 .
linkuri externe
- Site-ul oficial , pe cellprofiler.org .
- Depozitul sursă CellProfiler , la github.com .
