Disocierea prin transfer electronic
În spectrometria de masă disocierea transferului de electroni (în limba engleză electron transfer dissociation, ETD) este o metodă de fragmentare a ionilor. [1] [2]
Similar cu disocierea prin captarea electronilor , ETD induce fragmentarea cationilor prin transferarea electronilor către ei.
Fragmentarea ETD
ETD nu folosește electroni liberi, ci radicali anionici:
- . [3]
![{\ displaystyle [M + nH] ^ {n +} + A ^ {-} \ to {\ bigg [} [M + nH] ^ {(n-1) +} {\ bigg]} ^ {*} + A \ to fragments}](https://wikimedia.org/api/rest_v1/media/math/render/svg/ec748d04277429f854da86a4801898b23d90d356)
unde A este un anion.
Pauzele ETD sunt aleatorii de-a lungul scheletului peptidic (așa-numiții ioni cez), în timp ce lanțurile laterale și modificările, cum ar fi fosforilarea, sunt lăsate intacte. Această tehnică funcționează bine numai pentru ioni cu sarcini mari (z> 2), cu toate acestea, comparativ cu disocierea indusă de coliziune (CID), ETD este mai avantajoasă pentru fragmente de peptide lungi sau proteine întregi. Acest lucru face ca tehnica să fie importantă pentru proteomica de sus în jos.
Notă
- ^(EN) Syka JE, Coon JJ, Schroeder MJ, Shabanowitz J, Hunt DF, analiza secvenței de peptide și proteine prin spectrometrie de masă de disociere prin transfer de electroni , în Proc. Natl. Acad. Sci. SUA , vol. 101, nr. 26, 2004, pp. 9528–33, DOI : 10.1073 / pnas.0402700101 , PMID 15210983 .
- ^(EN) Mikesh LM, Ueberheide B, Chi A, Coon JJ, Syka JE, Shabanowitz J, Hunt DF, Utilitatea spectrometriei de masă ETD în analiza proteomică , în Biochim. Biofizi. Acta , vol. 1764, nr. 12, 2006, pp. 1811–22, DOI : 10.1016 / j.bbapap . 2006.10.003 , PMID 17118725 .
- ^(EN) McLuckey SA, Stephenson JL, <369 :: AID-MAS1> 3.0.CO 2-J Ion / chimie ion de ioni de înaltă masă cu sarcină multiplă , în Mass Spectrometry Review, vol. 17, n. 6, 1998, pp. 369–407, DOI : 10.1002 / (SICI) 1098-2787 (1998) 17: 6 <369 :: AID-MAS1> 3.0.CO; 2-J , PMID 10360331 .
