Degetul de zinc

Reprezentarea proteinei Zif268 (în albastru), conținând 3 degete de zinc (în verde), în complex cu ADN-ul (în portocaliu).

Motivele degetului de zinc (sau, cu semnificații ușor diferite, degetul de zinc sau grupul de zinc ) sunt regiuni proteice specifice capabile să lege ADN-ul .

Descoperirea

Degetele de zinc joacă un rol important în recunoașterea ADN-ului. ^[1] Descoperirea lor a fost posibilă datorită factorului de transcripție TFIIIA a ovocitelor broaștei acvatice Xenopus laevis . ^[2] ^[3]

Deget de zinc

În această reprezentare evidențiem legăturile de coordonare pe care le face zincul cu reziduurile de cisteină (în verde) și histidină (în galben)

Motivele degetului de zinc sunt caracterizate de prezența unui atom de zinc sau, în cazul motivelor a două grupe de zinc. Proteinele care prezintă aceste motive sunt caracterizate printr-o helix alfa care se inserează în canelura majoră a ADN - ului prin interacțiunea cu bazele. Pe fața helixului există reziduuri de histidină care interacționează cu atomul de zinc .

Interacțiunea cu atomul de zinc permite menținerea helixului poziționată ferm în interiorul sulcusului major, deoarece zincul în sine interacționează cu reziduurile de cisteină poziționate pe fața a două foi beta antiparalel. Foarte des, motivele degetelor de zinc pot fi legate între ele datorită interacțiunilor dintre cap și coadă, provocând două reacții importante:

Primul este că, în acest fel, cantitatea de ADN recunoscută este mai mare
Al doilea este că interacțiunea cu ADN-ul devine mai puternică

Recunoaștere modulară

Secvențele degetelor de zinc se împletesc în jurul firelor de ADN și ARN , legându-se în invaginații, inserând astfel aminoacizii pentru citirea bazelor azotate ; dacă degetele de zinc sunt legate mai tare, pot citi secvențe mai lungi de ADN.

Variante

O variantă poate fi motivele de grupare de zinc utilizate, de exemplu, în activatorul de drojdie gal4 pentru a lega ADN-ul la locul său de legare specific.

Notă

^ (EN) Klug A. și D. Rhodes, Zinc Fingers: A New Protein Fold pentru recunoașterea acidului nucleic , în Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology, Vol. 52, 1 ianuarie 1987, pp. 473–482, DOI : 10.1101 / sqb.1987.052.01.054 . Adus la 8 august 2017 .
^ (EN) JS Hanas, DJ Hazuda și DF Bogenhagen, factorul de transcripție Xenopus A necesită zinc pentru legarea genei ARN 5 S. , în Jurnalul de chimie biologică , vol. 258, nr. 23, 10 decembrie 1983, pp. 14120–14125. Adus la 8 august 2017 .
^ JM Berg, Degete de zinc și alte domenii de legare a metalelor. Elemente pentru interacțiunile dintre macromolecule , în Jurnalul de chimie biologică , vol. 265, nr. 12, 25 aprilie 1990, pp. 6513–6516. Adus la 8 august 2017 .