Subtipuri HIV
| Virusul imunodeficienței umane | |
|---|---|
 | |
| Clasificare științifică | |
| Domeniu | Riboviria |
| Regatul | Pararnavirae |
| Clasă | Revtraviricete |
| Ordin | Ortervirales |
| Familie | Retroviridae |
| Subfamilie | Orthoretrovirinae |
| Tip | Lentivirus |
| Specii |
|
Una dintre problemele virusului imunodeficienței umane în mediul clinic este variabilitatea sa genetică ridicată. [1]
Specia de virus HIV este împărțită în două tipuri principale:
- HIV de tip 1 (HIV-1), legat de virusurile găsite la cimpanzeii și gorilele din Africa de Vest ;
- HIV de tip 2 (HIV-2), legat de virusurile găsite într-un primat din Africa de Vest , Cercocebo moro .
Virușii HIV-1 pot fi împărțiți în continuare în grupuri, dintre care virusul HIV-1 grupul M este predominant în rândul oamenilor și este responsabil de pandemiile SIDA . La rândul său, grupa M poate fi împărțită în subtipuri bazate pe diferite informații genetice; pe baza acestora, este posibil să se determine gradul de virulență al agenților patogeni și orice rezistență la terapia antiretrovirală.
Virușii HIV-2 sunt, în general, considerați a fi mai puțin virulenți și mai contagioși decât virusii HIV-1 din grupa M, deși primii sunt, de asemenea, capabili să provoace SIDA .
Principalele tipuri
Următoarele nu sunt o listă exhaustivă și este foarte probabil ca alte tipuri de viruși să fie descoperite și clasificate în viitor. [2]
HIV-1
Agenții patogeni foarte frecvenți și virulenți sunt atribuiți grupului HIV-1. Este obișnuit să se identifice următoarele grupuri:
- Grupul M (principalul), de la M = Major (principal);
- Grupul N (minoritar), din N = nu (nu O și nu P);
- Grupa O (minoritate), din O = Outlier (excepție);
- Grupul P (minoritar), din P = În așteptare (se așteaptă reformularea);
Se crede că fiecare grup HIV-1 reprezintă o transmisie independentă a SIV la om. [3]
Grupa M
Grupul major (principal) este responsabil pentru peste 90% din cazurile de HIV / SIDA înregistrate la pacienții infectați cu HIV. În cadrul grupului M există „clade”, adică „subtipuri” identificate printr-o literă a alfabetului. În plus, pot exista variante recombinate sau „forme recombinate circulante” în care două subtipuri diferite formează un nou virus, identificat printr-un număr. De exemplu, un virus recombinant format din subtipurile B și F se numește CRF12_BF (forma recombinantă circulantă 12 BF, forma recombinantă circulantă 12 a B și F).
Principalele subtipuri sunt următoarele:
- Subtipul A, comun în Africa de Vest . [4]
- Subtipul B, formă dominantă în Europa , America , Japonia și Australia . [5] și cel mai frecvent în Orientul Mijlociu și Africa de Nord . [6]
- Subtipul C, formă dominantă în Africa de Sud , Africa de Est , India , Nepal și unele părți ale Chinei . [5]
- Subtipul D, întâlnit în general numai în Africa centrală și de est . [5]
- Subtipul E, găsit în Asia de Sud-Est ; este forma dominantă la heterosexuali, deoarece frecvența de transmisie este mai mare decât majoritatea celorlalte subtipuri. [ fără sursă ]
- Subtipul F, prezent în Africa Centrală , America de Sud și Europa de Est . [2]
- Subtipul G (împreună cu forma recombinantă cu subtipul A CRF02_AG) a fost găsit în Africa și Europa centrală . [2]
- Subtipul H, limitat la Africa Centrală . [2]
- (Subtipul I), care a fost inițial folosit pentru a descrie o specie care este acum cunoscută sub numele de CRF04_cpx, cu CPX în picioare pentru "complex" de recombinare pentru mai multe subtipuri. [ fără sursă ]
- Subtipul J, întâlnit în principal în Caraibe și Africa de Nord , Centrală și de Vest. [7]
- Subtipul K este limitat la Republica Democrată Congo și Camerun .
Grupa N
„N” înseamnă „non-M” și „non-O”. Acest grup a fost descoperit în 1998, de către un grup de cercetare franco-camerunez, când au identificat și izolat o altă tulpină HIV-1, YBF380.
YBF380 a fost izolat de o femeie din Republica Camerun care a murit de SIDA în 1995. Când a fost testată in vitro, varianta YBF380 a reacționat mai degrabă cu un antigen de suprafață al virusului SIV (cimpanzeu) decât cu cei din grupul M sau grupul O, sugerând apariția a unei noi tulpini HIV-1. [8] Începând cu 2015, există mai puțin de 20 de infecții din grupul N. [9]
Grupa O
Grupul Outlier a fost înregistrat în mod obișnuit în Camerun și în alte regiuni din vestul-central al Africii. În 1997 s-a susținut că aproximativ 2% dintre cei infectați în Camerun erau infectați cu HIV-1 grupa O. Acest subgrup clinic și-a exprimat inițial îngrijorarea în contextul clinic, deoarece pozitivitatea acestuia nu a fost detectată de vechile teste HIV-1. Testele actuale pot detecta atât grupa O, cât și grupa N.
Grupa P.
În 2009, a fost analizată o nouă secvență HIV, foarte asemănătoare cu SIV descoperită la unele gorile sălbatice (SIVgor) decât în cea descoperită la cimpanzei (SIVcpz). Virusul a fost izolat de o femeie din Camerun care locuia în Franța , diagnosticată în 2004 cu infecție cu HIV-1. Acest grup este așa numit în așteptare, adică „așteaptă identificarea altor cazuri umane”. [10] [11]
HIV-2
HIV-2 nu este comun în afara Africii. Primele cazuri de HIV-2 în zonele non-africane au fost înregistrate în 1987 în Statele Unite ale Americii . [12] Astăzi, multe truse sunt capabile să identifice atât HIV-1, cât și HIV-2. [13]
Începând cu 2010, sunt cunoscute opt grupuri HIV-2:
- Grupa A, pandemie , înregistrată în principal în Africa, deși cazurile de HIV-2 sunt cunoscute în Brazilia , India , Europa și Statele Unite ale Americii . [14] [15]
- Grupa B, pandemie , în principal limitată în Africa de Vest . Deși contagiunea este limitată, infecția cu HIV-2 ar trebui suspectată la toți pacienții care prezintă simptome ale HIV și care au avut contact cu fluide de la o persoană din Africa de Vest (utilizarea seringilor comune, contactul sexual, de exemplu). [16]
- Grupurile C și D, găsite la doar doi oameni din Liberia ;
- Grupurile E și F, găsite la doar doi oameni din Sierra Leone ;
- Grupul G și H, găsit la doar doi oameni din Coasta de Fildeș . [14]
Pentru cele șase grupuri care nu sunt pandemice (de la C la H) s-a constatat că genomul lor este foarte asemănător cu tulpinile SIVsmm (de mangabey ) care trăiesc în aceeași zonă în care a fost înregistrată infecția umană. [14] [15]
Notă
- ^ (EN) David L. Robertson, Beatrice H. Hahn și Paul M. Sharp, Recombinarea în virusurile SIDA , în Journal of Molecular Evolution, vol. 40, nr. 3, 1995-03, pp. 249-259, DOI : 10.1007 / BF00163230 . Adus la 4 ianuarie 2021 .
- ^ A b c d (EN) tulpini și tipuri de HIV , în AVERT, 16 iulie 2015. Accesat pe 7 iulie 2018.
- ^ Paul M. Sharp și Beatrice H. Hahn, Origins of HIV and the AIDS pandemic , în Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine , vol. 1, nr. 1, 2011-9, pp. a006841, DOI : 10.1101 / cshperspect.a006841 . Adus pe 7 iulie 2018 .
- ^ Aleksei F. Bobkov, Elena V. Kazennova și Ludmila M. Selimova, Tendințe temporale în epidemia HIV-1 în Rusia: predominanța subtipului A , în Journal of Medical Virology , vol. 74, nr. 2, 2004-10, pp. 191–196, DOI : 10.1002 / jmv.20177 . Adus pe 7 iulie 2018 .
- ^ a b c Goudsmit, Jaap., Sex viral; Natura SIDA. , în Oxford University Press. New York ,, Pg. 51-58.
- ^ Malik Sallam, Gülșen Özkaya Șahin și Mikael Ingman, Caracterizarea genetică a transmiterii virusului imunodeficienței umane de tip 1 în Orientul Mijlociu și Africa de Nord , în Heliyon , vol. 3, nr. 7, 2017-7, pp. e00352, DOI : 10.1016 / j.heliyon.2017.e00352 . Adus pe 7 iulie 2018 .
- ^ Joris Hemelaar, Eleanor Gouws și Peter D. Ghys, Distribuția globală și regională a subtipurilor genetice și recombinanților HIV-1 în 2004 , în SIDA (Londra, Anglia) , vol. 20, nr. 16, 24 octombrie 2006, pp. W13–23, DOI : 10.1097 / 01.aids.0000247564.73009.bc . Adus pe 7 iulie 2018 .
- ^ (EN) Thomas Mourez, François Simon și Jean-Christophe Plantier, Variante non-M ale virusului imunodeficienței umane de tip 1 , în Clinical Microbiology Reviews, vol. 26, n. 3, 1 iulie 2013, pp. 448–461, DOI : 10.1128 / CMR.00012-13 . Adus pe 7 iulie 2018 .
- ^ Mirela D'arc, Ahidjo Ayouba și Amandine Esteban, Origin of the HIV-1 group O epidemic in western lowlands gorillas , în Proceedings of the National Academy of Sciences din Statele Unite ale Americii , vol. 112, nr. 11, 17 martie 2015, pp. E1343 - E1352, DOI : 10.1073 / pnas.1502022112 . Adus pe 7 iulie 2018 .
- ^ Jean-Christophe Plantier, Marie Leoz și Jonathan E. Dickerson, Un nou virus al imunodeficienței umane derivat din gorile , în Nature Medicine , vol. 15, nr. 8, 2009-8, pp. 871–872, DOI : 10.1038 / nm . 2016 . Adus la 8 iulie 2018 .
- ^ (RO) Donald G. McNeil Jr., precursorul HIV a fost în maimuțe pentru milenii, studiul spune . Adus la 8 iulie 2018 .
- ^ Hivworkshop.com , pe www.hivworkshop.com . Adus la 8 iulie 2018 (arhivat din original la 15 ianuarie 2013) .
- ^ (EN) Centrul de evaluare și cercetare biologică, teste de boli infecțioase - Lista completă a testelor de screening pentru donatori pentru agenți infecțioși și teste de diagnostic HIV pe www.fda.gov. Adus la 8 iulie 2018 .
- ^ a b c Mario L. Santiago, Friederike Range și Brandon F. Keele, infecția cu virusul imunodeficienței Simian în mangabey funingine (Cercocebus atys atys) din pădurea Taï, Côte d'Ivoire: implicații pentru originea imunodeficienței umane epidemice virus de tip 2 , în Journal of Virology , vol. 79, nr. 19, 2005-10, pp. 12515–12527, DOI : 10.1128 / JVI.79.19.12515-12527.2005 . Adus la 8 iulie 2018 .
- ^ a b PA Marx, PG Alcabes și E. Drucker, Serial human passage of simian immunodeficiency virus by injections unsterile and the emergence of epidemic human imunodeficiency virus in Africa , in Philosophical Transactions of the Royal Society of London. Seria B, Științe biologice , vol. 356, nr. 1410, 29 iunie 2001, pp. 911–920, DOI : 10.1098 / rstb.2001.0867 . Adus la 8 iulie 2018 .
- ^ (EN) Ghiduri pentru tratamentul HIV / SIDA , pe AIDSinfo. Adus la 8 iulie 2018 .
