Regiunea codificatoare ADN
Regiunea de codificare a unei gene , cunoscută și sub numele de secvență de codificare ( CDS , coding DNA ADN ), este acea porțiune a ADN - ului sau ARN-ului unei gene, compusă din exoni , care codifică proteinele .
Regiunea este mărginită în apropierea capătului 5 'de codonul de început și în apropierea capătului 3' de codonul de oprire . Regiunea de codificare din ARNm este delimitată de 5'-UTR ( regiunea netradusă 5 ' ) și de 3'-UTR ( regiunea netradusă 3' ), care sunt, de asemenea, părți ale exonului. CDS este acea porțiune a transcrierii ARNm care este tradusă de un ribozom .
Regiunea de codificare a unui organism este suma totală a genomului organismului care este compus din regiunile sale de codificare.
Adnotarea secvenței de codare
În timp ce identificarea cadrelor de citire deschise într-o secvență de ADN este simplă, identificarea secvențelor de codificare nu este, deoarece celula traduce doar un set de cadre de citire deschise în proteine. [1] Predicția CDS utilizează în prezent eșantionarea și secvențierea ARNm de la celule, deși rămâne problema determinării părților unui ARNm dat care sunt de fapt traduse în proteine. Predicția CDS este un subset de predicție genică , care include, de asemenea, predicția secvențelor ADN care codifică nu numai proteinele, ci și alte elemente funcționale, cum ar fi genele ARN și secvențele reglatoare.
Notă
- ^ (EN) Masaaki Furuno, Takeya Kasukawa și Rintarolycan Saito, CDS Annotation in Full-Length cDNA Sequence , în Genome Research, vol. 13, 6b, 1 iunie 2003, pp. 1478–1487, DOI : 10.1101 / gr . 1060303 . Adus pe 10 februarie 2017 .
