Riboswitch

Această intrare pe tema Biologiei moleculare este doar o schiță . Contribuiți la îmbunătățirea acestuia în conformitate cu convențiile Wikipedia . Urmați sfaturile de proiectare de referință .

Reprezentare 3D a unui riboswitch legat de o moleculă de lizină

În biologia moleculară , un riboswitch (sau comutatorul genei ARN) ^[1] este un fir scurt de ARN , parte a unei molecule de ARNm , capabil să lege direct o mică moleculă țintă și, ca efect al acestei legări, modulează expresia unei gene . Un ARNm care conține un riboswitch este implicat direct în reglarea activității sale, ca răspuns la concentrația moleculelor sale țintă. Descoperirea că organismele moderne folosesc ARN pentru a lega molecule mici, discriminând molecule analoage strâns legate, a extins abilitățile naturale cunoscute ale ARN dincolo de capacitatea sa de a codifica proteinele, de a cataliza reacțiile și de a lega alte ARN sau macromolecule. Definiția inițială a "riboswitch" subliniază faptul că acestea sunt direct sensibile la concentrațiile de molecule mici de metaboliți . Deși această definiție a rămas în uz comun, unii biologi au conceput o definiție mai largă, care include și alte ARN-uri de reglementare în cis.

Majoritatea riboswitch-urilor cunoscute se găsesc în bacterii, dar un tip de riboswitch funcțional (riboswitch TPP) a fost descoperit la plante și la anumite ciuperci. Se consideră că riboswitch-ul TPP este prezent și în arquebacterii , dar nu au fost încă obținute dovezi experimentale.

Mecanismele riboswitch-urilor

Riboswitch-urile sunt adesea împărțite conceptual în două părți: un aptamer și o platformă de expresie. Aptamerul leagă molecula mică direct; platforma de expresie suferă în schimb modificări structurale ca răspuns la schimbările în aptamer. Este platforma de expresie care reglementează expresia genetică. Platformele de expresie reduc, de obicei, tăcerea genei ca răspuns la molecula mică, dar în unele cazuri o activează. Au fost demonstrate experimental următoarele mecanisme riboswitch:

• Formarea controlată de riboswitch de terminare intrinsecă harpin duce la terminarea prematură a transcrierii.
• Plierea mediată de Riboswitch a sechestrat locul de legare pentru ribozom, inhibând translația.
• Riboswitch este un ribozim care scindează în prezența unei concentrații suficiente de metaboliți.
• Un riboswitch din Neurospora crassa (o ciupercă) controlează îmbinarea alternativă pentru a produce condiționat un cadru de lectură deschisă în amonte (uORF) modificând astfel expresia genelor din aval.
• Un riboswitch Listeria monocytogenes reglează expresia genei sale din aval. Cu toate acestea, transcrierile riboswitch modulează ulterior expresia unei gene localizate în altă parte a genomului. Această reglare trans are loc prin asocierea bazelor genei îndepărtate la ARNm.

Notă

Bibliografie

• (EN) Suvendra Kumar Ray, riboswitch: Un nou mecanism de reglare a genelor la bacterii (PDF), în Current Science, vol. 87, nr. 9, 2004, pp. 1168-1169.
• ( EN ) Andrea L. Edwards și Robert T. Batey, Riboswitches: A Common RNA Regulatory Element , în Nature Education , vol. 3, nr. 9, 2010.
• ( EN ) Jane N. Kim și Ronald R. Breaker, Review Purine sensing by riboswitches , în Biol. Cell , vol. 100, nr. 1, 2008, pp. 1-11, DOI : 10.1042 / BC20070088 . PDF ^{[ link rupt ]}

Alte proiecte

• Wikimedia Commons conține imagini sau alte fișiere pe Riboswitch

linkuri externe

• Molecula chimică a lunii: Riboswitch , pe pianetachimica.it .

Portalul de biologie

Portalul chimiei