Cutie CAT
Cutia CAT (sau cutia CAAT ) este, în biologia moleculară , o secvență nucleotidică inclusă în secvența consens situată la aproximativ 75-80 de baze în amonte de locul de inițiere a transcripției .
Caseta CAAT indică, împreună cu casetele GC , situsul de legare pentru factorii de transcripție a ARN și este însoțit de obicei de secvența consens foarte conservată; este tipic pentru mulți promotori eucarioti .
CAAT și cutia GG sunt situate într-o regiune situată la 100-150 perechi de baze în amonte de cutia TATA .
Pentru activarea cutiei CAAT este necesară legarea proteinelor specifice, numite proteine care se leagă de cutia CAAT .
Caseta CAAT se găsește frecvent în genele eucariote, dar absentă în întregime în procariote .
Secvența de consimțământ
În direcția transcrierii firului model, secvența consens sau ordinea calculată a celor mai frecvente reziduuri, pentru caseta CAAT a fost 3'-TG ATTGG (T / C) (T / C) (T / C) (A / G) -5 '. Utilizarea parantezelor indică faptul că una dintre cele două baze este prezentă, dar nu este specificată în ceea ce privește frecvențele lor relative. De exemplu, „(T / C)” ar însemna că fie timina, fie citozina sunt selectate preferențial. În cadrul metazoanelor (regnul animal), complexul factorului de legare centrală (CBF) -ADN menține un grad ridicat de conservare în cadrul motivului de legare CCAAT, la fel ca și secvențele care înconjoară acest motiv pentameric. Trebuie remarcat faptul că motivul CCAAT la plante (spanacul a fost utilizat într-un experiment) diferă ușor de metazoane prin faptul că este de fapt un motiv de legare CAAT; promotorul nu are unul dintre cele două resturi de C ale motivului pentameric, iar adăugarea artificială a celui de-al doilea C nu are niciun efect semnificativ asupra activității de legare. În unele secvențe, caseta CAAT lipsește complet. În al doilea rând, nucleotidele din jur din plante nu se potrivesc cu secvența consens stabilită mai sus de Bi și colab.
Alte proiecte
-
Wikimedia Commons conține imagini sau alte fișiere în caseta CAT
linkuri externe
- Fao: Glosar de biotehnologie și inginerie genetică , la fao.org .
