-omică

În biologia moleculară , ne referim în mod obișnuit la neologism omics (în engleză omics ) pentru a indica numărul mare de discipline biomoleculare care au sufixul „-omics”, așa cum este cazul pentru genomică sau proteomică . Sufixul înrudit -oma (în engleză -omes ) indică obiectul de studiu al acestor discipline ( genom , proteom ).

Origini ale termenului

Succesul sufixului mai general „ -om- ” a provenit din utilizarea largă pe care termenul „ genom ” a câștigat-o în comunitatea științifică. Prima apariție a acestei terminații, în realitate, se datorează termenului de biom . Deși unii trasează originea acestui sufix la un cromozom , această corelație este cel puțin inexactă. Cromozomul provine din greaca "χρωμ (ατ) -" ( culoare ) și "σωμ (ατ) -" ( corp ). Prin urmare, este evident că sufixul cromozomial ( -unii , de fapt) este diferit de -oma .

Tendința de a crea noi „-omas” poate fi urmărită în jurul anului 1995 , în cadrul comunităților de bioinformatică din Cambridge , Stanford , Yale , Harvard și alte centre importante de cercetare. Prin urmare, în a doua jumătate a anilor 1990, credința a început să se răspândească în comunitatea științifică că sufixul „-oma” ar putea eticheta cu ușurință orice disciplină în curs de formare. Astfel metabolomului, textoma, interactoma, bacterioma, eukaryoma, neurinomul și mulți alții s- au născut.

În opinia unei mari părți a comunității științifice, rămâne ideea că sufixul -oma este de origine greacă. Deoarece genomul indică totalitatea materialului genetic al unui organism, de fapt, se crede pe larg că sufixul -oma indică totalitatea a ceea ce este indicat în prefix. În orice caz, nu există nicio corelație între acest sufix și limba greacă veche. Unii, atunci, cred că -oma poate deriva din latinescul omni- (care exprimă bine ideea de tot ): această interpretare pare forțată, dacă nu complet fără fundament.

În orice caz, în urma răspândirii proiectelor de biologie cantitativă aplicată la scară largă (cum ar fi Proiectul genomului uman ), sufixul „-oma” a fost adoptat de comunitățile de bioinformatică și biologi moleculari , care au continuat să-l folosească pentru a eticheta numeroasele disciplinele instituției recente.

Utilizarea actuală a "-oma"

Utilizarea „-omelor” permite biologilor și bioinformaticienilor să clasifice cu ușurință un anumit domeniu de studiu în biologia celulară. În plus față de „genom“, strămoșul -omes, termenul proteomul, ceea ce indică totalitatea proteinelor exprimate într - un organism, țesut sau celulă (adică ei expresia genelor ), a avut o răspândire largă. Succesul acestor termeni, difuzarea lor, precum și proliferarea lor, se datorează necesității de a delimita și defini domeniul de cercetare al noilor domenii disciplinare.

Lista „-oma”

Următoarele sunt cele mai importante „-omas” propuse recent în cadrul comunității științifice.

• Transcriptomul este ansamblul de ARNm transcrise în întregul organism, țesut, celulă; este studiat prin transcriptomică .
• Metabolomul include toți metaboliții prezenți într-un organism; este studiat prin metabolomică .
• Metalomul include toate speciile de metale și metaloizi ; este studiat de metalomică .
• Lipidomul include toate lipidele ; este studiat prin lipidomică ^[1] .
• Interactomul include totalitatea interacțiunilor moleculare care au loc într-un organism; un nume care indică în mod obișnuit disciplina interattomica ^[2] este pentru biologia sistemelor ( biologia sistemelor ).
• Spliceomul (care nu trebuie confundat cu spliceozomul , complexul de proteine ​​și acizi nucleici implicați în splicing ) include toate izoformele proteice datorate splicingului alternativ ; este studiat prin spliceomică .
• ORFeoma cuprinde totalitatea secvențelor ADN începând cu un codon ATG și terminând cu un codon stop (secvențe cunoscute sub numele de ORF, cadre de citire deschise ). Se crede că aceste secvențe pot codifica o proteină sau o parte. ^{[3] [4]}
• Textoma : ansamblul literaturii științifice disponibile pentru consultare (studiat de textomică ).
• Kinoma : ansamblul protein kinazelor (din kinaza engleză) ale unei celule. Există publicații științifice care menționează termenul kinomică .
• Glicozilom : legat de reacțiile de glicozilare (studiate prin glicozilomică ).
• Fiziom : legat de fiziologie (studiat de fiziomică ).
• Neurom : ansamblul componentelor nervoase ale unui organism (studiat de neuromică ).
• Predictome : ansamblul predicțiilor structurii proteinelor. ^[5]
• Reattoma : ansamblul proceselor biologice. ^[6]
• Ionoma : set de nutrienți minerali și oligoelemente găsite într-un organism ^[7]
• conectom : ansamblul tuturor neuronilor și sinapselor unui creier

Notă

Elemente conexe

• Sufixe ale limbii italiene

linkuri externe

• OMICS: un jurnal de biologie integrată , pe liebertpub.com (arhivat din original la 17 august 2017) .
• Lista „-omicilor” de la Cambridge Health Institute la genomicglossaries.com .
• Omics World , pe omicsworld.com . Adus la 8 mai 2006 (arhivat din original la 27 aprilie 2006) .
• Omics.org: wiki „ -omics ” , pe omics.org .

Portalul de biologie : Accesați intrările Wikipedia care se ocupă de biologie