Recombinare non-alelică omologă
Recombinarea omologă non-alelică (cunoscută sub acronimul NAHR English Non-allelic homologous recombination) este o formă de recombinare omologă care are loc între două secvențe de ADN cu asemănare mare, dar care nu sunt alele ale aceleiași gene. [1] [2] [3]
În general, NAHR apare între secvențele de ADN care au suferit un proces de duplicare rezultat din evoluție și care, prin urmare, au repetări reduse ale copiilor (LCR). Aceste elemente repetate au de obicei o lungime estimată între 10 și 300 kb și au o identitate de secvență de 95-97%. [4] În timpul meiozei sau mitozei , LCR-urile pot deveni nealiniate și încrucișarea ulterioară poate provoca rearanjări genetice neașteptate. Când apare o recombinare omologă non-alelică între diferite LCR, pot apărea deleții sau alte duplicări ale ADN-ului. Acest lucru poate da naștere la tulburări genetice rare, cauzate de reducerea sau creșterea numărului de copii ale genelor în regiunea ștearsă sau duplicată. De asemenea, poate contribui la variația numărului de copii observată în unele grupuri genetice. [5]
Deoarece CSF-urile se găsesc adesea în „punctele fierbinți” ale genomului uman (adică regiunile cu o rată mare de mutații), unele regiuni cromozomiale sunt deosebit de predispuse la NAHR. [1] Cele mai frecvente rearanjări sunt variații particulare ale secvenței de nucleotide care au fost găsite la mai mulți indivizi. Împărtășesc atât dimensiunea secvențelor recombinate, cât și locația punctelor de întrerupere. [4] Prin urmare, mai mulți pacienți pot prezenta deleții sau duplicări similare, încadrându-se astfel în descrierea sindroamelor genetice. Exemple dintre acestea includ sindromul de microdelecție NF1 , sindromul de microdelecție recurent 17q21.3 sau sindromul de microdelecție 3q29. [6] [7] [8]
Notă
- ^ a b Matthew Hurles, Hotspots de recombinare în recombinarea omologă nonalelică , în tulburări genomice: baza genomică a bolii [ link rupt ] , Humana Press, 2006, pp. 341–355.
- ^ Variante de număr copiat și trăsături genetice: mai aproape de rezoluția variabilității fenotipice de genotipice , în Nat. Pr. Genet. , vol. 8, nr. 8, august 2007, pp. 639–46, DOI : 10.1038 / nrg2149 , PMID 17637735 .
- ^ Rita Colnaghi, Consecințele modificărilor genomice structurale la om: tulburări genomice, instabilitate genomică și cancer , în seminarii în celulă și biologie a dezvoltării , vol. 22, n. 8, iulie 2011, pp. 875–885, DOI : 10.1016 / j.semcdb.2011.07.010 , PMID 21802523 .
- ^ a b Rita Colnaghi, Gillian Carpenter și Marcel Volker, Consecințele alterărilor genomice structurale la om: tulburări genomice, instabilitate genomică și cancer , în seminarii în biologie celulară și de dezvoltare , creștere și mișcare polarizate: cum se generează forme și structuri noi Recombinarea cromozomului , vol. 22, n. 8, 1 octombrie 2011, pp. 875–885, DOI : 10.1016 / j.semcdb.2011.07.010 , PMID 21802523 .
- ^ Mecanismul de expansiune și volatilitatea pe care le-a creat în trei grupuri genetice de feromoni din genomul șoarecelui (Mus musculus) , în Genom Biol Evol , vol. 1, 2009, pp. 494-503, DOI : 10.1093 / gbe / evp049 , PMID 20333217 .
- ^ Dovezi pentru îmbinarea finală neomologă și recombinare omologă non-alelică în microdelecții atipice NF1 , în Hum. Genet. , vol. 115, nr. 1, iunie 2004, pp. 69–80, DOI : 10.1007 / s00439-004-1101-2 , PMID 15103551 .
- ^ Delimitarea clinică și moleculară a sindromului de microdelecție 17q21.31 , în J. Med. Genet. , vol. 45, n. 11, noiembrie 2008, pp. 710-20, DOI : 10.1136 / jmg.2008.058701 , PMID 18628315 .
- ^ 3q29 sindrom de microdelecție: caracterizarea clinică și moleculară a unui nou sindrom , în Am. J. Hum. Genet. , vol. 77, nr. 1, iulie 2005, pp. 154–60, DOI : 10.1086 / 431653 , PMID 15918153 .
