SOX6
Salt la navigare Salt la căutare
Factorul de transcripție SOX-6 este o proteină codificată la om de gena SOX6 . [1] [2]
| SOX-6 | |
|---|---|
 | |
| Gene | |
| HUGO | SOX6 HSSOX6 |
| Entrez | 55553 |
| Locus | Chr. 11 [1] |
| Proteină | |
| OMIM | 607257 |
| UniProt | P04637 |
Familia de gene SOX codifică un grup de factori de transcripție caracterizați de domeniul grupului de mobilitate ridicată (HMG), un domeniu de legare a ADN-ului. Factorii de transcriere SOX, spre deosebire de majoritatea factorilor de transcripție, se leagă de canelura minoră a ADN-ului prin îndoirea lanțului dublu la un unghi de 70-85 grade și introducerea modificărilor conformaționale locale. [2]
Interacțiuni
S-a demonstrat că SOX6 interacționează cu CTBP2 [3] și CENPK . [4]
Notă
- ^ Cohen-Barak O, Hagiwara N, Arlt MF, Horton JP, Brilliant MH, Clonarea, caracterizarea și maparea cromozomială a genei SOX6 umane , în Gene , vol. 265, nr. 1-2, martie 2001, pp. 157-64, PMID 11255018 .
- ^ a b Gene Entrez: SOX6 SRY (regiunea de determinare a sexului Y) -box 6 , la ncbi.nlm.nih.gov .
- ^ A Murakami, Ishida S, Thurlow J, Revest JM, Dickson C, SOX6 leagă CtBP2 pentru a reprima transcrierea din promotorul Fgf-3 , în Nucleic Acids Res. , Vol. 29, nr. 16, Anglia, august 2001, pp. 3347-55, PMID 11504872 .
- ^ A Yamashita, Ito M, Takamatsu N, Shiba T, Characterization of Solt, un roman SoxLZ / Sox6 care leagă proteina exprimată în testicul de șoarece adult , în FEBS Lett. , Vol. 481, nr. 2, OLANDA, septembrie 2000, pp. 147-51, ISSN 0014-5793 , PMID 10996314 .
Bibliografie
- Denny P, Swift S, Brand N și colab. , O familie conservată de gene legate de gena determinantă a testiculului, SRY. , în Nucleic Acids Res. , vol. 20, nr. 11, 1992, p. 2887, DOI : 10.1093 / nar / 20.11.2887 , PMID 1614875 .
- Lefebvre V, Li P, de Crombrugghe B, O nouă formă lungă de Sox5 (L-Sox5), Sox6 și Sox9 sunt coexprimate în condrogeneză și activează în cooperare gena colagenului de tip II. , în Embo J. , vol. 17, n. 19, 1998, pp. 5718–33, DOI : 10.1093 / emboj / 17.19.5718 , PMID 9755172 .
- Hagiwara N, Klewer SE, Samson RA și colab. , Sox6 este o genă candidată pentru miopatie p100H, bloc cardiac și moarte subită neonatală. , în Proc. Natl. Acad. Sci. SUA , vol. 97, nr. 8, 2000, pp. 4180-5, DOI : 10.1073 / pnas.97.8.4180 , PMID 10760285 .
- Yamashita A, Ito M, Takamatsu N, Shiba T, Characterization of Solt, o nouă proteină de legare SoxLZ / Sox6 exprimată în testicul de șoarece adult. , în FEBS Lett. , vol. 481, nr. 2, 2000, pp. 147–51, DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01987-6 , PMID 10996314 .
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA, clonarea ADN utilizând recombinare in vitro specifică site-ului. , în Genome Res. , vol. 10, nr. 11, 2001, pp. 1788–95, DOI : 10.1101 / gr . 143000 , PMID 11076863 .
- Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R și colab. , Către un catalog de gene și proteine umane: secvențierea și analiza a 500 de proteine complete noi care codifică ADNc umane. , în Genome Res. , vol. 11, n. 3, 2001, pp. 422–35, DOI : 10.1101 / dimensiunea 154701 , PMID 11230166 .
- Murakami A, Ishida S, Thurlow J, și colab. , SOX6 leagă CtBP2 pentru a reprima transcrierea din promotorul Fgf-3. , în Nucleic Acids Res. , vol. 29, nr. 16, 2001, pp. 3347–55, DOI : 10.1093 / nar / 29.16.3347 , PMID 11504872 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH și colab. , Generarea și analiza inițială a mai mult de 15.000 de secvențe de ADNc de lungă durată la om și șoarece. , în Proc. Natl. Acad. Sci. SUA , vol. 99, nr. 26, 2003, pp. 16899–903, DOI : 10.1073 / pnas . 242603899 , PMID 12477932 .
- Cohen-Barak O, Yi Z, Hagiwara N și colab. , Reglarea Sox6 a dezvoltării miocitelor cardiace. , în Nucleic Acids Res. , vol. 31, n. 20, 2004, pp. 5941-8, DOI : 10.1093 / nar / gkg807 , PMID 14530442 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T și colab. , Secvențierea completă și caracterizarea a 21.243 ADNc umane de lungime completă. , în Nat. Genet. , vol. 36, n. 1, 2004, pp. 40-5, DOI : 10.1038 / ng1285 , PMID 14702039 .
- Wiemann S, Arlt D, Huber W și colab. , De la ORFeome la biologie: o conductă de genomică funcțională. , în Genome Res. , vol. 14, 10B, 2004, pp. 2136–44, DOI : 10.1101 / dimensiunea 2576704 , PMID 15489336 .
- Ueda R, Yoshida K, Kawakami Y și colab. , Exprimarea unui factor transcripțional, SOX6, în gliomii umani. , în Patologia tumorii cerebrale , vol. 21, n. 1, 2005, pp. 35-8, DOI : 10.1007 / BF02482175 , PMID 15696967 .
- Ueda R, Yoshida K, Kawakami Y și colab. , Analiza imunohistochimică a expresiei SOX6 în tumorile cerebrale umane. , în Patologia tumorii cerebrale , vol. 21, n. 3, 2005, pp. 117-20, DOI : 10.1007 / BF02482186 , PMID 15696972 .
- Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I și colab. , Baza de date LIFEdb în 2006. , în Nucleic Acids Res. , Vol. 34, Ediția bazei de date, 2006, pp. D415–8, DOI : 10.1093 / nar / gkj139 , PMID 16381901 .
- Fernández-Lloris R, Osses N, Jaffray E, și colab. , Reprimarea activității transcripționale SOX6 prin modificare SUMO. , în FEBS Lett. , vol. 580, n. 5, 2006, pp. 1215–21, DOI : 10.1016 / j.febslet . 2006.01.031 , PMID 16442531 .
- Ikeda T, Saito T, Ushita M și colab. , Identificarea și caracterizarea promotorului SOX6 uman. , în Biochem. Biofizi. Rez. Comun. , vol. 357, nr. 2, 2007, pp. 383–90, DOI : 10.1016 / j.bbrc.2007.03.133 , PMID 17433257 .
