Slicer 3D

3DSlicer software

Tip	Prelucrarea digitală a imaginilor Analiza datelor
Dezvoltator	Slicer Brigham and Women's Hospital , Universitatea Harvard , NIH
Ultima versiune	4.6.0 (octombrie 2016 )
Sistem de operare	Multiplatform
Limba	Piton Java Tcl C ++ Qt Java
Set de instrumente	Qt
Licență	Licență BSD ( licență gratuită )
Site-ul web	www.slicer.org/
Editați datele pe Wikidata · Manual

3D Slicer (Slicer) este un pachet software gratuit , open source pentru vizualizare științifică și analiză a imaginii. Slicer vă permite să creați „stive de imagini”, pornind de la imagini DICOM (la fel ca și SPM ), transformându-le în blocuri de date cu trei, patru și cinci dimensiuni (de exemplu, prin afișarea variației simultane a doi parametri, într-un format tridimensional rețea în timp), spre exemplu în filme 3D referitoare la RMN , PET etc.

3DSlicer vă permite, de asemenea, să comparați două sau mai multe scanări RMN ale aceluiași subiect în timp, pentru a determina dacă a apărut o leziune (la individul sănătos), dacă au apărut leziuni noi sau dacă s-au mărit sau s-au redus.

Slicer 3D este utilizat în multe aplicații medicale , inclusiv în studiul autismului , sclerozei multiple , lupus eritematos sistemic , cancer de prostată , schizofrenie , biomecanică ortopedică ,BPOC , boli cardiovasculare , neurochirurgie și radioterapie .

Istorie

Slicer a început în 1998 ca un proiect de teză de masterat între Laboratorul de planificare chirurgicală al Brigham and Women's Hospital și Laboratorul de inteligență artificială al MIT . A doua versiune a 3D Slicer a fost descărcată de pe net de câteva mii de ori. În 2007 a fost disponibilă a treia versiune a Slicer, complet revizuită. Aceste software-uri au permis analiza imaginilor utilizate de multe publicații de cercetare , toate având ca scop îmbunătățirea acestor tehnici de „analiză a imaginii”.

Acest proiect software a fost posibil prin participarea unor departamente ale Institutelor Naționale de Sănătate din SUA , inclusiv comunitățile Alianței Naționale pentru Calculul Imaginii Medicale, Centrul de Analiză Neuroimagistică , Rețeaua de Cercetări în Informatică Biomedică, Centrul pentru Integrarea Medicinii și Tehnologie inovatoare și Centrul Național pentru Terapie Guidată de Imagini. Sprijinul financiar provine dintr-o serie de surse federale, care includ Centrul Național pentru Resurse de Cercetare, Institutul Național de Imagistică Biomedică și Bioinginerie, Institutul Național de Sănătate „Foaie de parcurs”, Institutul Național al Cancerului , Fundația Națională pentru Științe și Departamentul de Apărare .

Caracteristici

Capacitățile Slicer 3D includ:

Capacitatea de a citi și scrie (de a anonimiza) imaginile DICOM și un număr mare de alte formate
Vizualizare interactivă a imaginii, triangularea modelelor de suprafață 3D și redarea volumului .
Editarea manuală.
Fuziunea și co-înregistrarea (fuziunea datelor din două imagini în momente diferite) utilizând algoritmi de transformare rigizi și non-rigizi
Segmentarea automată
Analiza și vizualizarea datelor de difuzie ale tensorului imagistic.
Urmărirea dispozitivului pentru proceduri medicale ghidate prin imagistică.

Slicer este compilat pentru utilizare pe mai multe platforme, inclusiv Windows , Linux și macOS .

Este distribuit sub o licență BSD gratuită, open source. Licența 3D-Slicer nu prevede restricții asupra utilizării software-ului. Cu toate acestea, autorii nu declară oficial că software-ul poate fi util pentru orice sarcină anume. Responsabilitatea respectării legilor și reglementărilor naționale revine în totalitate utilizatorului. Slicer nu a fost niciodată aprobat pentru utilizare clinică în SUA sau în orice altă țară.

Utilizatori

Platforma Slicer oferă funcționalități pentru segmentarea imaginii , comparația cu un registru și vizualizarea tridimensională a datelor rezultate dintr-o distribuție multimodală , precum și algoritmi de analiză a imaginii pentru tensorul de difuzie , rezonanța magnetică funcțională și radioterapia ghidată de imagine. Sunt acceptate multe formate standard de fișiere de imagine , iar aplicația integrează capabilități de interfață pentru software de cercetare biomedicală.

Feliatorul a fost utilizat în mai multe cercetări clinice . În cercetarea terapiei ghidate prin imagine, Slicer este utilizat frecvent pentru a construi și vizualiza colecții de date din RMN care pot fi disponibile ulterior atât pentru planificarea intervenției, cât și în cadrul intraoperator, permițând achiziționarea de coordonate spațiale pentru monitorizarea poziția și lucrul instrumentelor de operare. Într-adevăr, Slicer a fost deja angajat în terapia ghidată de imagini, iar funcțiile sale sunt în prezent îmbunătățite și rafinate de multe echipe de cercetare în colaborare cu ingineri de calculatoare.

În plus față de reconstrucția modelelor 3D din imagini MR convenționale, Slicer a fost folosit și pentru a prezenta informații derivate din fMRI (Imagistica prin rezonanță magnetică funcțională) care constă în utilizarea RMN pentru a calcula fluxul sanguin în diferitele zone ale creierului, în relație către sau nu direcționat către activitatea neuronală a creierului sau a măduvei spinării .

Cel mai avansat domeniu în RMN este cel al studiului tensorului de difuzie "DTI" și "DWI" (folosind RMN pentru a măsura restricțiile sau facilitățile date circulației libere a apei de către fasciculele de țesuturi, permițând astfel reconstrucția structurilor complexe pachete nervoase tridimensionale, nervi, vase cerebrale, mișcarea LCR în ventriculi și apeducte etc.), de asemenea, în asociere cu programe de „ trattologia ” ca TrackVis . Procedurile de difuzie sunt utilizate prin electrocardiografie , chiar și sub stres, pentru a studia spasmele tranzitorii și stenoza arterelor coronare . De exemplu, pachetul DTI integrat în 3D-Slicer permite conversia și analiza imaginilor DTI. Rezultatele acestor analize pot fi integrate cu rezultatele oferite de analize RMN morfologice , angiografie RM și RMN.

Dezvoltare IT și baze

Slicer se bazează pe biblioteca grafică VTK , care oferă un grad ridicat de integrare la interfața OpenGL și un mecanism „pipeline” pentru conectarea filtrelor grafice. Biblioteca este implementată în limbajul C ++ , dar oferă un "wrapper" Tcl pentru a crea și executa metodele sale. Tcl / Tk include restul interfeței 3DSlicer și gestionarea evenimentelor.

Software-ul Slicer permite testarea automată a propriei integrități și folosește o abordare extrem de flexibilă, cu multe versiuni recente realizate pentru a rula în mod expres pe platforme multiple sau specifice. Unele dintre etapele recente includ adăugarea capacității de a accepta formulare externe în modul „ plug-in ”, utilizând o interfață de linie de comandă bazată pe XML .

Site-ul Slicer.org oferă resurse (cod sursă, pdf explicative) pentru cei care doresc să îmbunătățească designul și aplicațiile Slicer. Există diverse tutoriale și instrucțiuni, precum și o mare comunitate de dezvoltatori și unslicerWiki care, pe lângă cele mai frecvente întrebări, poate ajuta la rezolvarea problemelor specifice.

Subprograme utilizate de Slicer

Alte proiecte

Wikimedia Commons conține imagini sau alte fișiere despre 3D Slicer

linkuri externe

( EN ) Slicer , pe slicer.org . Adus la 15 februarie 2010 (arhivat din original la 10 februarie 2010) . * ( EN ).
( EN ) Kit NA-MIC , la wiki.na-mic.org . Adus la 15 februarie 2010 (arhivat din original la 3 iulie 2009) .
( RO ) Informații referitoare la licența pentru slicer , la ohloh.net . Adus la 25 aprilie 2019 (arhivat din original la 21 iunie 2008) .
( RO ) TrackVis , pe trackvis.org .

Portalul Anatomiei

Portalul Medicinii

Portal de software gratuit