Arenaviridae

De la Wikipedia, enciclopedia liberă.
Salt la navigare Salt la căutare
Progetto:Forme di vita/Come leggere il tassoboxCum să citiți caseta
Arenaviridae
Arenaviridae-scheme.jpg
A: Membrana plicului viral

B: Glicoproteine

C: Genom format din 2 ARN-uri liniare monocatenare: segmentul L de 5,7 kb și S de 2,8 kb. Amândoi au o organizare bidirecțională.[1]

D: Nucleoproteine

E: Ribozomi

F: ARNm

Clasificare științifică
Domeniu Riboviria
Regatul Orthornavirae
Phylum Negarnaviricota
Subfilum Poliploviricotină
Clasă Ellioviricete
Ordin Bunyavirales
Familie Arenaviridae
genuri

Arenaviridae este o familie de viruși din ordinul Bunyavirales [2] . Deși virușii din această familie sunt clasificați ca viruși ARN monocatenari negativi (grupa V conform clasificării Baltimore , Negarnaviricota din clasificarea filogenetică ICTV ), genomul lor este de fapt format din două ambisens monocatenare, ceea ce înseamnă că ARNm sunt sintetizate în direcții opuse plecând de la aceeași moleculă de ARN. Până în 2014 a inclus un singur gen, primul care a fost atribuit familiei, Mammarenavirus (pe atunci numit pur și simplu Arenavirus ), când noul gen Reptarenavirus a fost acceptat. [3]

Structura

La microscopul electronic , virionul este sferic sau pleomorf și măsoară 40-200 nm în diametru. Este învelit de o pericapsidă lipidică densă pe suprafața căreia sunt grefați peplomeri tripartiti, constând din două subunități glicoproteice (GP1 și GP2) și, în unele arenavirusuri, și de o subunitate stabilă de peptidă semnal (SSP). Matricea este formată dintr-un strat de proteine ​​care leagă zincul ( degetul de zinc), absent în hartmanivirusuri și antenavirusuri . [4] Virionii conțin un număr variabil de ribozomi de 20-25 nm, [5] cu aspect granular (de unde și originea numelui arena , din latinescul "nisip"), pe care virusul îl încorporează din celula gazdă. Cu toate acestea, astfel de ribozomi nu sunt necesari pentru traducerea proteinelor de virus nou sintetizate. [6] Nucleocapsida este formată din două catene de ARN, strâns asociate separat cu o nucleoproteină (NP) și cu proteina L, o ARN polimerază dependentă de ARN . Complexele care se formează în acest mod se numesc complexe ribonucleoproteice (RNP). [4]

Proteine

Cea mai abundentă proteină structurală este nucleoproteina, o polipeptidă neglicozilată , care încapsulează cele două catene care alcătuiesc genomul ARN al virusului. Proteina L este prezentă într-o măsură mai mică, care este o ARN polimerază dependentă de ARN, necesară pentru replicarea și transcrierea genomului. O altă proteină structurală este degetul de zinc Z, absent în hartmanivirusuri și antenavirusuri , prezente în matricea virionului. [4] Proteinele care alcătuiesc peplomerul sunt sintetizate în două faze proteolitice succesive. În prima, SSP (prezent doar în hartmanivirusuri și mamarenavirusuri ) se obține prin liză din complexul glicoproteic GP1 / 2 rămas (GPC), care, la rândul său, prin intermediul protozei subtilizin-kexin izozim-1 / site-1 ( SKI - celula 1 / S1P ), este clivată în cele două subunități glicoproteice GP1 și GP2. [7] [8]

Genomul

Arenavirusurile au un genom compus din două fire distincte de ARN ambisens, S ( mic ) care are o lungime variabilă între 2 și 3,5 kb și L ( mare ) care măsoară 6-7,5 kb. În antenavirusuri există un al treilea filament, numit M ( mediu ) ambisens, iar filamentul S este în loc de polaritate negativă. [4] ARN-urile nu sunt echipate cu un capac și la capătul 3 'nu posedă o coadă poliadenilată. [9] Capetele 5 'și 3' ale celor două filamente conțin secvențe complementare foarte conservate, care permit filamentului să aibă o formă închisă de "mâner pan", necesară pentru transcrierea și replicarea corectă. [10]

Ca și alți viruși ARN negativi, genomul nu este tradus direct în polipeptide, ci este transcris mai întâi în ARNm din care sunt traduse proteinele virale. Catenă S codifică nucleoproteina NP în secvența antisens și precursorul GPC în secvența de sens . Catenă L codifică în schimb proteina L în genomul sens și, în genurile în care este prezentă, proteina Z din genomul antisens. ORF-urile sunt separate de o regiune intergenică necodificatoare (IGR) care presupune o structură stabilă a acului de păr. În antenavirusurile, catena S codifică numai pentru NP, în timp ce precursorul GPC este codificat de genomul de sens al catenei M. Secvența antisens a lui M produce o proteină necunoscută. [4] [8] [10]

Replicare

Virusul se leaga de receptorul de membrană și intră în celulă prin clathrin- dependentă endocytic ruta. În timpul replicării, proteina L generează ARN genomic și antigenomic. Primele gene virale care trebuie transcrise de polimeraza L sunt cele care codifică L și NP. După asamblare, virușii sunt eliberați prin înmugurire, iar pericapsidul noului virion apare din membrana celulei infectate. [4]

Rezervoare

Distribuția ecologică și geografică a familiei este variată. Virușii din genul Mammarenavirus au fost izolați de rozătoare , lilieci și căpușe , antennavirusurile au fost găsite la pești, iar hartmanivirusurile și reptarenavirusurile infectează reptilele . Distribuția în natură a ultimelor două genuri este necunoscută, deoarece acestea au fost până acum izolate doar de boasele captive. [4]

Taxonomie

Familia include următoarele genuri. [2]

Notă

  1. ^ (EN) Cann, Alan, Principles of molecular virology , Amsterdam, Elsevier Academic Press, 2005, pp. 101 , ISBN 0-12-088787-8 .
  2. ^ a b Taxonomia virușilor: lansarea din 2019 , pe talk.ictvonline.org , Comitetul internațional pentru taxonomia virușilor (ICTV), iulie 2019. Accesat pe 28 iunie 2020 .
  3. ^ Michael J. Buchmeier și colab., Redenumiți un (1) gen și douăzeci și cinci (25) de specii din familia Arenaviridae ( PDF ), pe talk.ictvonline.org , International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV). Adus la 25 iunie 2020 .
  4. ^ a b c d e f g ( EN ) Arenaviridae - Arenaviridae - Bunyavirales , la International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) . Adus pe 28 iunie 2020.
  5. ^ (EN) Arenaviridae - Virusii ARN cu sens negativ - Virusii ARN cu sens negativ (2011) , al Comitetului internațional pentru taxonomia virusurilor (ICTV). Adus pe 28 iunie 2020.
  6. ^ (EN) Benjamin W. Neuman, Brian D. Adair și John W. Burns, Complementarity in the Supramolecular Design of Arenaviruses Retroviruses and Revealed by Electron cryomicroscopy and Image Analysis in Journal of Virology, vol. 79, nr. 6, 15 martie 2005, pp. 3822–3830, DOI :10.1128 / JVI.79.6.3822-3830.2005 . Adus pe 28 iunie 2020.
  7. ^ (EN) Lydia H. Bederka, Cyrille J. Bonhomme și Emily L. Ling, Arenavirus Stable Signal Peptide Is the Keystone Subunit for Glycoprotein Complex Organization , în mBio, vol. 5, nr. 6, 31 decembrie 2014, DOI : 10.1128 / mBio.02063-14 . Adus pe 29 iunie 2020 .
  8. ^ A b Michele T. Jay, Carol Glaser, și Charles F. Fulhorst, The arenaviruses , în Journal of American Medical Association veterinar, vol. 227, nr. 6, 1 septembrie 2005, pp. 904–915, DOI : 10.2460 / javma.2005.227.904 . Adus pe 29 iunie 2020 .
  9. ^ WC Leung, HP Ghosh și WE Rawls, Strandedness of Pichinde virus RNA , în Journal of Virology , vol. 22, n. 1, 1977-04, pp. 235-237. Adus pe 29 iunie 2020 .
  10. ^ a b ( EN ) Jussi Hepojoki, Satu Hepojoki și Teemu Smura, Caracterizarea virusului șarpelui Institutului Haartman-1 (HISV-1) și a virusurilor asemănătoare HISV - Reprezentanții genului Hartmanivirus, familia Arenaviridae , în PLOS Pathogens , vol. 14, n. 11, 14 noiembrie 2018, pp. e1007415, DOI : 10.1371 / journal.ppat.1007415 . Adus pe 29 iunie 2020 .

Alte proiecte

Microbiologie Portalul de microbiologie : Accesați intrările Wikipedia care se ocupă de microbiologie