Citrat (Si) -sintază
| citrat (Si) -sintază | |
|---|---|
 Mecanismul de condensare a oxaloacetatului (roșu) și a acetil-CoA (albastru) | |
| Numărul CE | 2.3.3.1 |
| Clasă | Transferasis |
| Numele sistematic | |
| acetil-CoA: oxaloacetat de C-acetiltransferază (hidrolizează tioesterul, formează (S) -carboximetil) | |
| Alte nume | |
| citrat oxaloacetat-liazei [(pro-3S) -CH2 - coo → acetil-CoA]; citrat sintază; citrat sintetaza; ctrogenaza; oxaloacetat transacetaza | |
| Baze de date | BRENDA , EXPASY , GTD , PPB ( RCSB PPB PDBe PDBj PDBsum ) |
| Sursa: IUBMB | |
Citratul (Si) -sintaza (sau pur și simplu citratul sintazat ) este o enzimă , aparținând clasei transferazelor , care catalizează condensarea oxaloacetatului cu acetil-CoA , pentru a obține citrat .
Această reacție este prima din ciclul Krebs , un proces cheie al respirației celulare .
Este o enzimă stimulatoare cardiacă a ciclului Krebs , care este capabilă să regleze debitul întregului ciclu.
Reacția catalizată de enzimă este următoarea:
- acetil-CoA + oxaloacetat + apă = citrat + CoA -SH
Citratul sintază este situat în matricea mitocondrială .
Cu toate acestea, este codificat de o genă nucleară și nu mitocondrială sintetizată pe ribozomi și transportată pe matrice. Această enzimă este de obicei cuantificată pentru a evalua câte mitocondrii intacte sunt prezente în celulă.
Structura și mecanismul de acțiune
Structura sa cuaternară este formată din două subunități, la care se leagă cele două substraturi.
În situl catalitic (două per enzimă) există un reziduu de aspartat care, împreună cu un reziduu de histidină , ajută la menținerea moleculei de acetil-CoA în loc prin interacțiuni ionice. Aceste reziduuri ajută la activarea moleculei într-un intermediar enolic , făcându-l asemănător cu un centru carbonos al oxaloacetatului. Odată ce legătura a fost creată, printr-un mecanism similar cu o condensare Claisen , hidroliza grupării tioester (CoA) este generată printr-o moleculă de apă. Aceasta este o reacție decisiv exergonică (ΔdG sau > -30 kJ / mol), ceea ce face ca acest pas să fie ireversibil (motiv pentru care reacția este capabilă să regleze întregul ciclu metabolic).
Moleculele de citrat produse prin condensare sunt capabile să lege situl de legare pentru oxaloacetat, inhibând competitiv activitatea enzimei. În ciuda faptului că reacția este extrem de exergonică, prin urmare, citratul sintază poate fi ferm reglat. Acest aspect are o importanță biologică considerabilă, deoarece permite o reglare completă a întregului ciclu Krebs.
Bibliografie
- (EN) Gottschalk, G. Purificarea parțială și unele proprietăți ale (R) -citratului sintază din acizii Clostridium-uric. Eur. J. Biochem. 7 (1969) 301-306. Entrez PubMed 4974734
- ( EN ) Ochoa, S., Stern, JR și Schneider, MC Sinteza enzimatică a acidului citric. II. Enzimă condensatoare cristalină. J. Biol. Chem. 193 (1951) 691-702. Entrez PubMed 14907759
- ( EN ) Stern, transalcetat de oxalacetat JR (enzimă condensatoare, citrogenază). În: Boyer, P, D., Lardy, H și Myrbäck, K. (Eds), The Enzymes, 2nd edn, vol. 5, Academic Press, New York, 1961, pp. 367-380.
- ( EN ) Rault-Leonardon, M., Atkinson, MA, Slaughter, CA, Moomaw, CR și Srere, PA Azotobacter vinelandii citrate sintaza. Biochimie 34 (1995) 257-263. Entrez PubMed 7819205
- ( EN ) Muir, JM, Russell, RJ, Hough, DW și Danson, MJ Citrate sintaza din arheonul hipertermofil, Pyrococcus furiosus. Prot. Ing. 8 (1995) 583–592.
- ( EN ) Russell, RJ, Ferguson, JM, Hough, DW, Danson, MJ și Taylor, GL Structura cristalină a citratului sintază din arheonul hipertermofil Pyrococcus furiosus la o rezoluție de 1,9 Å. Biochimie 36 (1997) 9983–9994. Entrez PubMed 9254593