Dogma Anfinsen
Dogma lui Anfinsen , cunoscută și sub numele de ipoteza termodinamică a lui Anfinsen , este un postulat de biologie moleculară exprimat de premiul Nobel pentru chimie Christian B. Anfinsen . Dogma afirmă că, cel puțin pentru proteinele globulare mici, structura nativă este determinată doar de succesiunea aminoacizilor care alcătuiesc proteina. Aceasta înseamnă că, în condițiile de mediu ( temperatura , concentrația solventului și compoziția etc.) la care are loc plierea proteinelor , structura nativă corespunde unui singur minim de energie liberă , stabilă și accesibilă cinetic .
Analizând cele trei condiții referitoare la minimul de energie liberă:
- Unicitate : necesită ca secvența să nu posede o altă configurație cu energie liberă comparabilă. Prin urmare, minimul de energie liberă trebuie să fie unic.
- Stabilitate : Schimbările mici în mediul înconjurător nu pot produce modificări în configurația minimă a energiei. Aceasta poate fi descrisă ca o suprafață parabolică a energiei libere cu starea nativă corespunzătoare punctului minim; suprafața de energie liberă din vecinătatea stării native trebuie să fie destul de abruptă și înaltă pentru a asigura stabilitate.
- Accesibilitatea cinetică : înseamnă că traseul în suprafața energiei libere de la starea denaturată la starea de răsucire a proteinelor trebuie să fie rezonabil plat sau cu alte cuvinte că plierea lanțului nu trebuie să implice schimbări de formă foarte complexe (cum ar fi noduri sau alte conformații de ordine).
Modul în care proteina realizează această structură intră în studiul plierii proteinelor, care se bazează pe o dogmă înrudită numită paradoxul Levinthal . Paradoxul lui Levinthal afirmă că numărul de posibile conformații disponibile pentru o anumită proteină este astronomic mare. Într-adevăr, acest lucru face predicția de calcul a structurii proteinelor prin evaluarea tuturor configurațiilor posibile impracticabile chiar și pentru proteinele relativ mici.
În plus, unele proteine au nevoie de asistența altei proteine numite chaperonină pentru a face o înfășurare adecvată. S-a sugerat că acest lucru ar contrazice dogma lui Anfinsen. Cu toate acestea, chaperoninele nu par să afecteze starea finală a proteinei, dar par să acționeze în primul rând prin prevenirea agregării diferitelor molecule de proteine înainte ca proteina să fie supusă plierii.
Bibliografie
- Sela, M., FH White Jr și CB Anfinsen, scindarea reductivă a podurilor disulfură în ribonuclează. , în Știință , 125 (1957), pp. 691-2, PMID 13421663 .
- White, Frederick H., Regenerarea structurilor secundare și terțiare native prin oxidarea aerului a ribonucleazei reduse. , în J. Biol. Chem , 236 (1961), pp. 1353–60, PMID 13784818 .
- Anfinsen, CB, Edgar Haber., Studii privind reducerea și reformarea legăturilor de disulfură de proteine. , în J. Biol. Chem , 236 (1961), pp. 1361-3, PMID 13683523 .
- Anfinsen, CB, E. Haber, M. Sela și FH White Jr., Cinetica formării ribonucleazei native în timpul oxidării lanțului polipeptidic redus. , în PNAS , 47 (1961), pp. 1309-14, PMID 13683522 .
- Anfinsen, CB, Principii care guvernează plierea lanțurilor de proteine. , în Știință , 181 (1973), pp. 223-30, PMID 4124164 .
- Moore, Stanford și William H. Stein. Structuri chimice ale ribonucleazei pancreatice și ale dezoxiribonucleazei. , în Știință , 180 (1973), pp. 458–64, PMID 4573392 .
