Farmacofor

Un farmacofor , un termen definit de Paul Ehrlich în 1909 ^[1] , este cea mai mică unitate structurală a unei molecule de medicament responsabile de activitatea sa biologică. Acesta constă dintr-un set de grupuri funcționale (numite și elemente farmacoforice ) dispuse în mod adecvat în cele trei dimensiuni spațiale care interacționează în mod specific cu un receptor sau o țintă biologică dând naștere unui răspuns biologic.

Conceptul de farmacofor

Un exemplu de model farmacoforic pentru situsul de legare a benzodiazepinelor pe receptorul GABA _A.^[2] Atomii din alb reprezintă diazepam , o benzodiazepină, în timp ce verdele este atomidele un compus nucleu non-benzodiazpeinic (CGS-9896). În roșu și albastru heteroatomii de oxigen și azot prezenți în structuri. Sferele roșii etichetate H1 și H2 / A2 sunt, respectiv, siturile legăturilor de hidrogen donor și acceptor , în timp ce literele L denotă interacțiunile hidrofobe .

Analiza structurilor tridimensionale ale numeroșilor complecși ligand / receptor ne-a permis să înțelegem conceptul de farmacofor la nivel molecular. Cunoașterea structurii tridimensionale a farmacoforului este de fapt esențială pentru o proiectare rațională a medicamentelor , printr-o modulare adecvată a proprietăților sterice și electronice ale grupurilor funcționale care fac parte din farmacofor. Uneori, un element farmacoforic nu stabilește interacțiuni la locul de legare, dar este totuși esențial. De exemplu, poate stabiliza izomerul conformațional sau tautomeric recunoscut de enzimă.

Funcțiile implicate în interacțiuni importante cu enzima (de exemplu: legături ionice, legături de hidrogen) se numesc farmacoforice .

Porțiunile care stabilesc interacțiuni slabe cu enzima sunt numite accesorii deoarece îndepărtarea lor se reduce, dar nu desființează activitatea . Nu fac parte din farmacofor .

Grupurile farmacoforice pot fi, de asemenea, generate pe computer pentru utilizare în proiectarea medicamentelor sau tehnici de screening virtual. În acest moment, farmacoforii se pot distinge în farmacofori de prima și a doua generație. În primul caz (prima generație) farmacoforul este descris de atomi, distanțe și unghiuri între ei. În a doua generație, modelul este descris și din punct de vedere chimico-fizic; fiecare grup este identificat printr-o sferă de culoare diferită pe baza proprietăților sale chimico-fizice.

Notă

^ P. Ehrlich (1909). Dtsch. Chem. Iisus , 42 , 17.
^ Madsen U, Bräuner-Osborne H, Greenwood J și colab. , Liganzii receptorilor GABA și glutamat și potențialul lor terapeutic în tulburările SNC , în Drug Discovery Handbook (Pharmaceutical Development Series) , ed. 0, John Wiley & Sons, iunie 2005, p. 1471, ISBN 0-471-21384-5 .