Flavivirusuri patogene umane
Există 32 de specii de flavivirusuri patogene pentru oameni, potrivit EA Gould și T. Solomon Departamentul de Științe Neurologice de la Universitatea din Liverpool ( Lancet 2008). [1]
Virologie
Flavivirusurile folosesc diferite strategii de replicare genomică în cadrul gazdei, de asemenea, deoarece folosesc diferite insecte vector și diferite gazde de mamifere.
În plus față de codificarea proteinelor virale, genomul viral conține semnale speciale în structuri ale propriului ARN care reglează amplificarea componentelor virale și participă la activarea sau evitarea răspunsurilor antivirale. În această perspectivă, structurile ARN prezente în regiunea netradusă ( 3 UTR ) ale genomului flavivirusului își asumă un rol predominant pentru funcțiile specifice adaptării gazdei. [2]
În special, virusul Dengue se adaptează la țânțari sau celule umane prin selectarea diferitelor variante virale. Specializarea gazdă a structurilor ARN prezente în regiunea 3'UTR este asociată cu câștiguri în „sănătatea virală”. De fapt, replicarea elementelor ARN-ului viral implică nevoi contrastante în diferitele tipuri de celule în care apare. [2]
Flavivirusurile aparțin a 4 grupuri cu strategii genomice specifice. Acestea sunt: [2]
- Flavivirusuri suportate de țânțari (Flavivirusuri transportate de țânțari)
- Flavivirusuri specifice insectelor
- Flavivirusuri purtate de căpușe (Flavivirusuri purtate de căpușe)
- Flavivirusuri vectoriale necunoscute
Fiecare dintre aceste grupuri posedă o regiune genomică de tip SLA ( stem-loop A) în care secvența de bază a nucleotidelor și structura tridimensională diferă.
Vectori
Transportatorii tradiționali sunt: [3]
- tantari
- căpușe (în climă mai rece)
Virușii transmiși de țânțari au rate de evoluție mai mari.
Vizitatori
Flavivirusurile au de obicei gazde animale cu o rată reproductivă ridicată, deoarece acestea găsesc întotdeauna gazde naive imunologic. Gazdele naturale ale flavivirusurilor sunt puțin probabil să sufere infecții fatale rapide, deoarece altfel ar exista o dispariție rapidă a răspândirii virusului. Omul, în general care nu suferă viremii mari în propriul său organism (sânge), devine o gazdă terminală sau un „punct mort” pentru virus; excepții fac dengul și febra galbenă, unde oamenii și primatele sunt gazde naturale ale bolii. [3]
Clinica
În mod tradițional, flavivirusurile provoacă trei sindroame clinice cunoscute: [3]
- febră-artralgie-erupție cutanată,
- febră hemoragică virală,
- boli neurologice,
deși pentru unele flavivirusuri acest model de boală se schimbă. Animalul gazdă dezvoltă imunitate pe tot parcursul vieții după infecție. Boala Flavivirus este în general ușoară, de obicei sunt sindroame febrile, deoarece este convenabil ca virusul să nu omoare gazda infectată pentru a avea un procent ridicat de rezervoare virale pentru menținerea nișei ecologice ocupate.
Rezumat
Specii | An prima izolare | Locație prima izolare | Sursă izolare | Distribuție geografic | Specii vector | Specii oaspete | Demonstrație clinică la om | Notă |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Virusul Alkhurma | 1995 | Arabia de Sud | Om | Peninsula Arabică | Ornithodorus savignyi? | Bărbat, oaie, cămilă | Febra hemoragică | |
Virusul Apoi | 1954 | Japonia | Rozătoarele | Japonia | Străin | Rozătoarele? | Encefalită | |
Virusul Bagaza | 1966 | Republica Centrafricană | Culex spp | Africa | Culex spp | Străin | Febră | |
Virusul Banzi | 1956 | Africa de Sud | Om | Africa | Culex spp | Străin | Febră | |
Virusul Bussuquara | 1956 | Brazilia | Alouatta belzebul | Brazilia | Culex spp | Străin | Febră | |
Virusul liliac Dakar | 1962 | Senegal | Băţ | Africa | Străin | Lilieci? | Febră | |
Virusul Dengue 1 | 1944 | Hawaii | Om | Tropice, subtropice | Aedes aegypti | Om | Febra, erupții cutanate, boli vasculare | 390 de milioane de cazuri / an în lume, vaccinul lipsește. [2] |
Virusul Dengue 2 | 1944 | Noua Guinee | Om | Tropice, subtropice | Aedes aegypti | Om | Febra, erupții cutanate, boli vasculare | |
Virusul Dengue 3 | 1957 | Filipine | Om | Tropice, subtropice | Aedes aegypti | Om | Febra, erupții cutanate, boli vasculare | |
Virusul Dengue 4 | 1956 | Filipine | Om | Tropice, subtropice | Aedes aegypti | Om | Febra, erupții cutanate, boli vasculare | |
Virusul Ilheus | 1957 | Brazilia | Aedes și Psorophora | America de Sud și America Centrală | Culex spp? | Păsări | Febră | |
Virusul encefalitei japoneze | 1935 | Japonia | Om | Asia | Culex trita-eniorhynchus | Păsări | Encefalită | În expansiune, epidemiologic cel mai important în ciuda vaccinurilor [3] |
Virusul Koutango | 1969 | Senegal | Tatera kempi | Senegal | Străin | Rozătoarele? | Febră, erupție cutanată | |
Boala pădurii Kyasanur | 1957 | India | Presbytis entellus | India | Haemaphysalis spinigera | Maimuțe | Febra hemoragică | Epidemii localizate, vector bifă [3] |
Virusul Langat | 1956 | Malaezia | Ixodes Granulatus | Malaezia, Thailanda, Siberia | Ixodes granulatus | Străin | Encefalită | |
Louping virusul bolnav | 1929 | Scoţia | Oaie | Marea Britanie, Irlanda | Ixodes spp | Ovine, potârnici, iepuri de câmp | Encefalită | |
Virusul Modoc | 1958 | Statele Unite ale Americii | Peromiscul | Statele Unite ale Americii | Străin | Peromyscus maniculatus | Encefalită | |
Encefalita Murray Valley | 1951 | Australia | Om | Australia, Noua Guinee | Culex annulirostris | Păsări | Encefalită | |
Virusul Ntaya | 1943 | Uganda | Tantarii | Africa | Tantarii | Străin | Febră | |
Virusul febrei hemoragice Omsk | 1947 | Rusia | Om | Siberia de Vest | Dermacentor pictus | Șobolani, rozătoare? | Febra hemoragică | Epidemii localizate, vector de căpușe; transmisă și cu carcase infectate [3] |
Virusul Powassan | 1948 | Rusia, SUA, Canada | Ixodes spp, Dermacentor spp, Haemaphysalis spp | Rusia, SUA, Canada | Ixodes spp | Mamifere mici | Encefalită | |
Virusul Rio Bravo | 1954 | Statele Unite ale Americii | Tadarida brasiliensis mexicana | SUA, Mexic | Străin | Tadarida brasiliensis mexicana | Febră | |
Virusul Rocio | 1975 | Brazilia | Om | Brazilia | Culex spp? | Păsări | Encefalită | |
Virusul encefalitei St Louis | 1933 | Statele Unite ale Americii | Om | America de Sud și Centrală | Culex spp | Păsări | Encefalită | |
Virusul Sepik | 1966 | Noua Guinee | Mansonia septempunctata | Noua Guinee | Tantarii | Străin | Febră | |
Virusul Spondweni | 1955 | Africa de Sud | Mansonia uniformis | Africa | Aedes circumluteolus | Străin | Febră | |
Virusul encefalitei transmisă de căpușe | 1937 | Rusia | Om | Europa, Asia | Ixodes spp | Rozătoarele? | Encefalită | Epidemii localizate, vector de căpușe; transmisă și cu lapte. [3] În primul rând: encefalita rusă de primăvară - vară |
Virusul Usutu | 1956 | Africa de Sud | Culex spp | Africa | Tantarii | Păsări | Febră, erupție cutanată | |
Virusul Wesselsbron | 1955 | Africa de Sud | Oaie | Africa, Asia | Aedes spp | Străin | Străin | |
Virusul West Nile | 1937 | Uganda | Om | La nivel mondial | Tantari, capuse | Păsări | Encefalită | Se extinde [3] |
Febră galbenă | 1927 | Ghana | Om | Africa subsahariană, America de Sud | Aedes spp / Haemagogus spp | Maimuțe | Pantropic | 200.000 de cazuri / an cu 30.000 de decese în întreaga lume. [2] |
virusul Zika | 1947 | Uganda | Mulat macac | Africa, Asia | Aedes spp | Maimuțe? | Febră, erupție cutanată | din 2007 Micronezia, din 2015 America de Sud [4] |
Notă
- ^ Gould EA, Solomon T, Flavivirusuri patogene , în Lancet , vol. 371, nr. 9611, 2008, pp. 500-9, DOI : 10.1016 / S0140-6736 (08) 60238-X , PMID 18262042 .
- ^ a b c d e Villordo SM, Carballeda JM, Filomatori CV, Gamarnik AV, RNA Structure Duplications și Flavivirus Host Adaptation , în Trends Microbiol. , 2016, DOI : 10.1016 / j.tim.2016.01.002 , PMID 26850219 .
- ^ a b c d e f g h Solomon T, Mallewa M, Dengue și alte flavivirusuri emergente , în J. Infect. , vol. 42, n. 2, 2001, pp. 104-15, DOI : 10.1053 / jinf . 2001.0802 , PMID 11531316 .
- ^ Gatherer D, Kohl A, virusul Zika: o pandemie lentă anterior se răspândește rapid prin America , în J. Gen. Virol. , 2015, DOI : 10.1099 / jgv.0.000381 , PMID 26684466 .
Bibliografie
Texte
- Flavivirusurile: detectarea, diagnosticarea și dezvoltarea vaccinului , Academic Press, 18 decembrie 2003, pp. 508–, ISBN 978-0-08-049383-1 .
- Flavivirusurile: patogenie și imunitate , Academic Press, 18 decembrie 2003, pp. 273–, ISBN 978-0-08-049382-4 .
- Flavivirusurile: structură, replicare și evoluție , Academic Press, 18 decembrie 2003, ISBN 978-0-08-049381-7 .
- Pei-Yong Shi, Molecular Virology and Control of Flaviviruses , Horizon Scientific Press, 1 ianuarie 2012, ISBN 978-1-904455-92-9 .
- Paul Shapshak, John T. Sinnott, Charurut Somboonwit și Jens Kuhn, Global Virology I - Identificarea și investigarea bolilor virale , Springer, 13 iulie 2015, pp. 487–, ISBN 978-1-4939-2410-3 .
- Richard A. Kaslow, Lawrence R. Stanberry și James W. Le Duc, Infecții virale ale oamenilor: epidemiologie și control , Springer, 27 septembrie 2014, pp. 405–, ISBN 978-1-4899-7448-8 .
- Dongyou Liu, Detecția moleculară a agenților patogeni virali umani , CRC Press, 23 noiembrie 2010, pp. 314–, ISBN 978-1-4398-1237-2 .
- Infecții cu flavivirus - Progrese în cercetare și tratament: ediția 2012: ScholarlyBrief , ScholarlyEditions, 26 decembrie 2012, pp. 6–, ISBN 978-1-4816-1346-0 .
- Walter R Schlesinge, The Togaviruses: bio, struc, replication , Elsevier, 2 decembrie 2012, pp. 675–, ISBN 978-0-323-13826-0 .
- Subhash Vasudevan Duane J. Gubler, Eng Eong Ooi, Jeremy Farrar, Dengue and Dengue Hemorrhagic Fever, Ediția a II-a , CABI, 29 august 2014, pp. 322–, ISBN 978-1-84593-964-9 .
- Encefalita Arbovirus - Progrese în cercetare și tratament: Ediția 2013: ScholarlyBrief , ScholarlyEditions, 21 iunie 2013, pp. 46–, ISBN 978-1-4816-8522-1 .
- Encefalita japoneză: noi cunoștințe pentru profesioniștii din domeniul sănătății: ediția 2013: ScholarlyPaper , ScholarlyEditions, 22 iulie 2013, pp. 26–, ISBN 978-1-4816-5982-6 .
- Michael W. Scheld, Christina M. Marra și Richard J. Whitley, Infecții ale sistemului nervos central , Lippincott Williams & Wilkins, 2014, pp. 210–, ISBN 978-1-4511-7372-7 .
- Charles H. Calisher și Diane E. Griffin, Emergence and Control of Zoonotic Viral Encephalitides , Springer Science & Business Media, 23 martie 2004, pp. 191– , ISBN 978-3-211-20454-2 .
- Erik De Clercq, Earl R. Kern, Handbook of Viral Bioterrorism and Biodefense , Elsevier, 2003, pp. 129–, ISBN 978-0-444-51326-7 .
- Richard V. Goering, Cedric A. Mims, Hazel Dockrell & Mark Zuckerman, Ivan M. Roitt, Peter L. Chiodini, Mims 'Medical Microbiology, With STUDENT CONSULT Online Access, 5: Mims' Medical Microbiology , Elsevier Health Sciences, 2013, pp. 370–, ISBN 0-7234-3601-0 .
- Debra C. Sellon & Maureen Long, Equine Infectious Diseases , Elsevier Health Sciences, 8 decembrie 2006, pp. 198–, ISBN 1-4377-1061-1 .
- Karl Maramorosch și Frederick A. Murphy, Advances in Virus Research , Elsevier Science, 18 aprilie 2014, ISBN 978-0-12-800400-5 .
Reviste
- Takamatsu K, Kishino W, Suehiro T, Yamano T, Ohno F, apolipoproteina plasmatică H (beta 2-glicoproteina I) frecvențe fenotip la o populație japoneză , în Jinrui Idengaku Zasshi , vol. 34, nr. 4, 1989, pp. 279-83, DOI : 10.1007 / BF01929209 , PMID 2634788 .
- Klema VJ, Padmanabhan R, Choi KH,Complex de replicare flavivirală: coordonare între sinteza ARN și limitarea ARN-ului 51 , în Viruși , vol. 7, nr. 8, 2015, pp. 4640-56, DOI : 10.3390 / v7082837 , PMC 4576198 , PMID 26287232 .
- Jeffries CL, Walker T,Utilizarea potențială a strategiilor de biocontrol dețânțari pe bază de Wolbachia pentru encefalita japoneză , în PLoS Negl Trop Dis , vol. 9, nr. 6, 2015, pp. e0003576, DOI : 10.1371 / journal.pntd.0003576 , PMC 4472807 , PMID 26086337 .
- Wu J, Liu W, Gong P,O prezentare structurală a polimerazelor de ARN dependente de ARN din familia Flaviviridae , în Int J Mol Sci , vol. 16, n. 6, 2015, pp. 12943-57, DOI : 10.3390 / ijms160612943 , PMC 4490480 , PMID 26062131 .
- Blitvich BJ, Firth AE,Flavivirusuri specifice insectelor: o revizuire sistematică a descoperirii lor, a gamei gazdei, a modului de transmitere, a potențialului de excludere a suprainfecției și a organizării genomice , în Virusuri , vol. 7, nr. 4, 2015, pp. 1927-59, DOI : 10.3390 / v7041927 , PMC 4411683 , PMID 25866904 .
- Mezochow AK, Henry R, Blumberg EA, Kotton CN, Transfuzia a transmis infecții în transplantul de organe solide , în Am. J. Transplant. , vol. 15, nr. 2, 2015, pp. 547-54, DOI : 10.1111 / ajt.13006 , PMID 25612502 .
- Das P, actualizarea supravegherii bolilor infecțioase , în Lancet Infect Dis , vol. 4, nr. 8, 2004, p. 481, PMID 15298027 .
- Blitvich BJ, Firth AE,Flavivirusuri specifice insectelor: o revizuire sistematică a descoperirii lor, a gamei gazdei, a modului de transmitere, a potențialului de excludere a suprainfecției și a organizării genomice , în Virusuri , vol. 7, nr. 4, 2015, pp. 1927-59, DOI : 10.3390 / v7041927 , PMC 4411683 , PMID 25866904 .
- Qin XC, Shi M, Tian JH, Lin XD, Gao DY, He JR, Wang JB, Li CX, Kang YJ, Yu B, Zhou DJ, Xu J, Plyusnin A, Holmes EC, Zhang YZ,A segmentată cu căpușe Virusul ARN conține segmente de genom derivate din strămoși virali nesegmentați , în Proc. Natl. Acad. Sci. SUA , vol. 111, nr. 18, 2014, pp. 6744-9, DOI : 10.1073 / pnas.1324194111 , PMC 4020047 , PMID 24753611 .
- Brecher M, Zhang J, Li H,Proteaza flavivirusului ca țintă pentru descoperirea drogurilor , în Virol Sin , vol. 28, nr. 6, 2013, pp. 326-36, DOI : 10.1007 / s12250-013-3390-x , PMC 3927373 , PMID 24242363 .
- Bollati M, Alvarez K, Assenberg R, Baronti C, Canard B, Cook S, Coutard B, Decroly E, de Lamballerie X, Gould EA, Grard G, Grimes JM, Hilgenfeld R, Jansson AM, Malet H, Mancini EJ, Mastrangelo E, Mattevi A, Milani M, Moureau G, Neyts J, Owens RJ, Ren J, Selisko B, Speroni S, Steuber H, Stuart DI, Unge T, Bolognesi M,Structura și funcționalitatea în proteinele NS ale flavivirusului: perspective pentru droguri design , în Antiviral Res. , vol. 87, nr. 2, 2010, pp. 125-48, DOI :10.1016 / j.antiviral .2009.11.009 , PMC 3918146 , PMID 19945487 .
- Wu J, Bera AK, Kuhn RJ, Smith JL,Structura helicazei Flavivirus: implicații pentru activitatea catalitică, interacțiunile proteice și procesarea proteolitică , în J. Virol. , vol. 79, nr. 16, 2005, pp. 10268-77, DOI : 10.1128 / JVI.79.16.10268-10277.2005 , PMC 1182653 , PMID 16051820 .
- Kuno G, Chang GJ, Tsuchiya KR, Karabatsos N, Cropp CB, Filogenia genului Flavivirus , în J. Virol. , vol. 72, nr. 1, 1998, pp. 73-83, PMC 109351 , PMID 9420202 .
- Zanotto PM, Ernest A. Gould, George F. Gao, Paul H. Harvey și Edward C. Holmes, Dinamica populației flavivirusurilor dezvăluite de filogenii moleculare , în Proc Natl Acad Sci US A. , vol. 93, nr. 2, ianuarie 1996, pp. 548-53, Bibcode : 1996PNAS ... 93..548Z , DOI : 10.1073 / pnas.93.2.548 , PMC 40088 , PMID 8570593 .
- Murray CL, Jones CT, Rice CM,Arhitecți de asamblare: rolurile proteinelor nestructurale Flaviviridae în morfogeneza virionului , în Nat. Pr. Microbiol. , vol. 6, nr. 9, 2008, pp. 699-708, DOI : 10.1038 / nrmicro1928 , PMC 2764292 , PMID 18587411 .
Elemente conexe
linkuri externe
- (EN) MicrobiologyBytes: Flavivirus , pe microbiologybytes.com. Adus la 17 ianuarie 2016 (arhivat din original la 23 aprilie 2015) .
- (EN) Zonă virală: Flavivirus , pe expasy.org. Adus la 16 ianuarie 2016 .
- ( EN ) Resurse de baze de date și analize ale virusului patogen (ViPR) - Flaviviridae - Baza de date a genomului cu instrumente de vizualizare și analiză , pe viprbrc.org . Adus pe 9 februarie 2016 .