Izocitrat dehidrogenază

De la Wikipedia, enciclopedia liberă.
Salt la navigare Salt la căutare
Notă despre dezambiguizare.svg Dezambiguizare - Dacă sunteți în căutarea enzimei care utilizează NADPH, consultați Isocitrat dehidrogenază (NADP +) .
izocitrat dehidrogenază (NAD + )
Model tridimensional al enzimei
Model tridimensional al enzimei
Numărul CE 1.1.1.41
Clasă Oxidoreductaza
Numele sistematic
izocitrat: NAD + oxidoreductaza (fosforilarea)
Alte nume
acid izocitric dehidrogenază; izocitrat dehidrogenază (dependentă de NAD); NAD izocitrat dehidrogenază; IDH; nicotinamidă adenină dinucleotidă izocitrat sintază
Baze de date BRENDA , EXPASY , GTD , PPB ( RCSB PPB PDBe PDBj PDBsum )
Sursa:IUBMB
Editați datele pe Wikidata · Manual
Centrul catalitic al enzimei, cu ionul Mg 2+ în contact strâns cu un aspartat de aminoacid specific

Izocitratul dehidrogenază ( NAD + ), numită și IDH , este o enzimă , aparținând clasei oxidoreductazelor , care participă la ciclul Krebs .

Efect

Catalizează următoarea reacție:

izocitrat + NAD + ⇄ -cetoglutarat + CO 2 + NADH

Enzima izocitrat dehidrogenază efectuează a treia reacție a ciclului Krebs (sau ciclul acidului citric) în care eliberează o moleculă de CO2 în urma oxidării și decarboxilării acidului izocitric. Doi hidrogeni sunt eliminați în reacție, primul fiind un ion H-hidrură care, în timpul oxidării, este transferat la NAD +. Celălalt hidrogen este îndepărtat ca H + în timpul decarboxilării.

O altă izoformă a enzimei catalizează aceeași reacție, nu în ciclul Krebs, ci în citosol și mitocondrie și folosește NADP + în loc de NAD + ca cofactor.

Energia liberă Gibbs legată de întreaga reacție este, în ambele cazuri, de -8,4 kJ / mol. De fapt, IDH are K m foarte mică în raport cu isocitrate.

Structura

Structura IDH umană nu a fost încă determinată. Se știe că proteina este compusă din 3 subunități, este reglată alosteric și necesită ionul Mg 2+ sau Mn 2+ ca substrat. Un omolog proteină care are o structură cunoscută este NADP- IDH dependentă de Escherichia coli , care are doar 2 subunități, 13% identitate și 29% similitudine pe baza de aminoacizi secvențe. Din acest motiv, este doar o rudă îndepărtată a IDH umană: structura sa tridimensională nu este fiabilă pentru a prezice cea umană.

Ajustare

Pasul catalizat de IDH, datorită măreției sale , este una dintre reacțiile ireversibile din ciclul Krebs și, prin urmare, trebuie reglată cu atenție pentru a evita dispersia inutilă a izocitratului (și o acumulare consecventă de α-cetoglutarat).

Reacția este stimulată pur și simplu prin abundența substratului (izocitrat, NAD + , Mg 2+ / Ca 2+ ), prin inhibarea produselor (prin NADH și α-cetoglutarat) și prin inhibarea reacției inverse (prin „ ATP ).

Notă


Bibliografie

  • Hathaway, JA și Atkinson, DE Efectul acidului adenilic asupra drojdiei nicotinamidă adenină dinucleotidă izocitrat dehidrogenază, un posibil mecanism de control metabolic. J. Biol. Chem. 238 (1963) 2875-2881. Entrez PubMed 14063317
  • Kornberg, A. și Pricer, WE Di- și trifosfopiridin nucleotid izocitric dehidrogenază în drojdie. J. Biol. Chem. 189 (1951) 123–136. Entrez PubMed 14832224
  • Plaut, GWE Isocitrat dehidrogenaze. În: Boyer, PD, Lardy, H. și Myrbäck, K. (Eds), The Enzymes, 2nd edn, vol. 7, Academic Press, New York, 1963, pp. 105–126.
  • Plaut, GWE și Sung, S.-C. Nucleotidul difosfopiridinic izocitric dehidrogenază din țesuturile animale. J. Biol. Chem. 207 (1954) 305-314. Entrez PubMed 13152105
  • Ramakrishnan, CV și Martin, SM Izocitric dehidrogenază în Aspergillus niger. Arh. Biochem. Biofizi. 55 (1955) 403-407.
  • Vickery, HB O nouă nomenclatură sugerată pentru izomerii acidului izocitric. J. Biol. Chem. 237 (1962) 1739–1741. Entrez PubMed 13925783
  • Camacho, ML, Brown, RA, Bonete, MJ, Danson, MJ și Hough, DW Isocitrate dehidrogenaze din Haloferax volcanii și Sulfolobus solfataricus: purificare enzimatică, caracterizare și secvență N-terminală. FEMS Microbiol. Lett. 134 (1995) 85-90. Entrez PubMed 8593959
  • Kim, YO, Koh, HJ, Kim, SH, Jo, SH, Huh, JW, Jeong, KS, Lee, IJ, Song, BJ și Huh, TL Identificarea și caracterizarea funcțională a unui roman, NAD + dependent de țesut, dependent de izocitrat dehidrogenază β subunitate izoformă. J. Biol. Chem. 274 (1999) 36866–36875. Entrez PubMed 10601238
  • Inoue, H., Tamura, T., Ehara, N., Nishito, A., Nakayama, Y., Maekawa, M., Imada, K., Tanaka, H. și Inagaki, K. Caracterizarea biochimică și moleculară a Izocitrat dehidrogenază dependentă de NAD + din chemolitotrof Acidithiobacillus tiooxidans. FEMS Microbiol. 214 (2002) 127-132. Entrez PubMed 12204383

Elemente conexe

Alte proiecte

linkuri externe

Adus de la „ https://it.wikipedia.org/w/index.php?title=Isocitrato_dehydrogenase&oldid=109148767 ”