SARS-CoV-2 Cluster 5

De la Wikipedia, enciclopedia liberă.
Salt la navigare Salt la căutare

SARS-CoV-2 Cluster 5 , numit și ikeFVI-spike de Statens Serum Institut din Danemarca , este sau a fost o variantă mutantă a SARS-CoV-2 , virusul care cauzează COVID-19 .

A fost descoperit în Iutlanda de Nord , Danemarca și se crede că a fost transmis de la nurcă la oameni prin fermele de nurcă.

La 4 noiembrie 2020, s-a anunțat că populația de nurci din Danemarca va fi sacrificată pentru a preveni posibila răspândire a acestei mutații și pentru a reduce riscul apariției de noi mutații.

Măsuri de izolare și restricții de călătorie au fost introduse în șapte municipalități din Iutlanda de Nord pentru a preveni răspândirea mutației, care ar putea submina răspunsurile naționale sau internaționale la pandemia COVID-19 .

Organizația Mondială a Sănătății (OMS) a declarat că Clusterul 5 „a redus moderat sensibilitatea la anticorpi neutralizanți”. [1]

SSI a avertizat că varianta ar putea reduce efectul vaccinurilor COVID-19 în curs de dezvoltare, chiar dacă este puțin probabil să le facă inutile.

În urma măsurilor de confinare și testarea în masă, SSI a anunțat pe 19 noiembrie 2020 că varianta Cluster 5 a fost, probabil, dispărută. [2]

Numele și mutațiile

În Danemarca , au existat cinci grupuri de variante SARS-CoV-2 rezultate din nurcă; Institutul danez al serului de stat (SSI) le-a desemnat drept cluster 1-5 (danez: cluster 1-5). În grupul 5, denumit, de asemenea, ΔFVI-spike de SSI, [3] au fost confirmate mai multe mutații ale proteinei spike de virus.

Mutațiile specifice includ 69-70 deltaHV (o ștergere a reziduurilor de histidină și valină la pozițiile 69 și 70 în proteină), Y453F (o schimbare de la tirozină la fenilalanină la poziția 453, în domeniul de legare a receptorului proteinei spike), I692V (izoleucină la valină la poziția 692), M1229I (metionină la izoleucină la poziția 1229) și o substituție neconservativă S1147L. [4] [3] [5]

Mutațiile legate de vizon care parțial seamănă cu variantele descoperite în Danemarca, deși fac parte dintr-un grup genomic separat, sunt cunoscute în Olanda. [6] [7]

fundal

Nurcă americană ( Neovison vison )

În 2019, Danemarca a fost cel mai mare producător de blană de nurcă din lume [8], cu majoritatea fermelor situate în nordul și vestul Iutlandiei . [9]

Alături de lilieci , pangolini și oameni, nurcii sunt una dintre multele specii de mamifere care pot fi infectate cu coronavirusuri. [10]

În noiembrie 2020, deoarece rolul pangolinului în răspândirea COVID-19 este treptat eliminat de oamenii de știință, [11] într-un articol din 7 ianuarie al Crizelor [12] , sociologul și jurnalistul Yann Faure prezintă date care atestă posibilitatea că Fermele de nurcă din China ar fi putut juca un rol în apariția COVID-19. [13] [14] [15] [16]

Împreună cu jurnalistul științific Yves Sciama, el efectuează o investigație pentru Reporterre între noiembrie și decembrie 2020, care va fi preluată de numeroase mass-media. [17] [18] [19]

A doua zi, transmiterea de la nurcă la om a virusului și mutațiile legate de nurcă au fost documentate în revista Science [6], iar acest lucru va determina guvernul danez să înainteze o interdicție asupra agriculturii de nurcă planificată să intre la sfârșitul anului 2020. în vigoare în 2024. [20]

În urma descoperirii variantei în Olanda, autoritățile daneze au inițiat un program de supraveghere la scară largă a tuturor fermelor de nurci din țară, cu teste regulate și secvențiere genomică. [21]

Departamentul pentru Agricultură al Statelor Unite (USDA) a confirmat că în august 2020 au fost documentate cazuri de nurcă bolnave COVID-19 în Utah . [22]

Au fost detectate focare suplimentare în Michigan , Wisconsin și Oregon . [23]

Începând cu 29 noiembrie 2020, infecțiile cu COVID-19 la nurci au fost raportate în Danemarca, Italia, Olanda, Spania, Suedia și Statele Unite. [24]

Cronologie

Descoperire

Începând cu 2 noiembrie 2020, institutul de cercetare independent din statul danez Statens Serum Institut (SSI) a detectat variante mutante ale SARS-CoV-2 din care oamenii pot fi infectați și 191 ferme de nurcă pozitive.

Ei raportează acest lucru public pe 3 noiembrie, apelând la variante cu o corelație cunoscută în trei ferme Cluster 5 . [25]

La 4 noiembrie 2020, prim-ministrul danez, Mette Frederiksen, a declarat că un coronavirus mutant era transmis oamenilor prin nurcă, în principal de la fermele de nurcă din Iutlanda de Nord.

Un raport SSI a constatat că au existat 12 infecții umane (8 asociate direct cu fermele de nurcă, 4 în comunitatea vecină) care implică această mutație în Iutlanda de Nord (denumită „Cluster 5”) și răspunsul anticorpilor a fost mai slab.

În timp ce institutul a declarat că mutația nu pare a fi mai periculoasă decât alte coronavirusuri în sine, Kåre Mølbak și Tyra Grove Krause din SSI au avertizat că mutația ar putea reduce efectul vaccinurilor COVID-19 în curs de dezvoltare. era puțin probabil să le facă complet inutile. [26] [27]

Mai mult, s-a demonstrat că răspunsul mai slab al anticorpilor reduce imunitatea dobândită de la o infecție anterioară. [28]

Autoritatea daneză a menționat că, deși Clusterul 5 era oarecum îngrijorat, ei erau îngrijorați și de potențialele mutații viitoare care ar putea apărea la nurcă, ceea ce a dus la recomandarea lor de a închide toate fermele din țară. [29]

Blocarea și uciderea

Ca măsură preventivă, Frederiksen a anunțat că țara își reduce deja populația de nurcă cu aproximativ 14 milioane (rapoartele inițiale de 15-17 milioane s-au bazat pe estimări din anii precedenți, când industria era cea mai mare). [30]

Pentru a preveni răspândirea mutației, s-a anunțat, de asemenea, pe 5 noiembrie că o blocare și restricții de circulație vor fi puse în aplicare în municipiile Brønderslev , Frederikshavn , Hjørring , Jammerbugt , Læsø , Thisted și Vesthimmerland din Iutlanda de Nord, începând cu 6 noiembrie. [31]

Toate instituțiile culturale, cinematografele, teatrele, facilitățile sportive și recreative și restaurantele de luat masa au fost închise și călătoria în sau în afara comunelor a fost interzisă.

Transportul public a fost suspendat pe 9 noiembrie. [32] Testarea în masă a început (Danemarca a avut deja una dintre cele mai mari rate de testare din lume), iar programele de urmărire au fost îmbunătățite în continuare.

OMS a publicat o declarație cu privire la acest grup de variante SARS-CoV-2 pe 6 noiembrie. [33]

În el a explicat că acest grup a avut o combinație de mutații care nu au fost observate anterior. Varianta a avut o sensibilitate moderat redusă la anticorpii neutralizanți, dar ar fi fost necesare studii suplimentare pentru a înțelege implicațiile pentru diagnostice, terapii și vaccinuri. [33]

Acest lucru a fost reluat ulterior într-o evaluare a riscului publicată de Centrul European de Prevenire și Control al Bolilor (ECDC), care a constatat că riscul pentru variantele legate de nurcă este similar cu riscul general COVID-19, menționând, de asemenea, că circulația virusului în fermele de nurcă ar putea pune alte probleme în viitor și să ofere îndrumări pentru gestionarea riscurilor. [34]

Până la sfârșitul lunii noiembrie 2020, mai mult de 10 milioane de nurci fuseseră sacrificate. [35]

Dezvoltări ulterioare

În urma testării în masă, SSI a anunțat pe 19 noiembrie 2020 că nu a găsit cazuri noi ale variantei Cluster 5 și că este cel mai probabil dispărut.

Restricțiile speciale impuse unor municipalități din Iutlanda de Nord au fost ridicate în perioada 19-20 noiembrie (acestea sunt încă supuse restricțiilor standard COVID-19 care acoperă întreaga țară și nu sunt legate de variantele nurcilor). [2]

Consecințe politice

La sfârșitul lunii noiembrie a fost dezvăluit că ministrul Agriculturii Mogens Jensen și alți cinci miniștri au fost informați în septembrie că tăierea întregii populații de nurci din țară, mai degrabă decât a celor din zonele infectate, ar fi ilegală.

În fața cererilor de demisie din partea opoziției parlamentare și a criticilor dure ale publicului, [36] premierul Frederiksen a recunoscut că ordinul de doborâre a tuturor nurcilor era ilegal și Jensen a demisionat pe 18 noiembrie. [37]

Ulterior s-a ajuns la un acord pentru ca ordinul guvernamental să fie legal retroactiv. [38]

La 21 decembrie 2020, în Parlamentul danez, guvernul și partidele de stânga ale parlamentului au aprobat un proiect de lege care interzice producția de nurcă pentru întregul 2021. [39]

La 25 ianuarie 2021, majoritatea parlamentului danez a ajuns la un acord pentru a compensa fermierii danezi de nurcă și alții care își câștigă existența din agricultura de nurcă în valoare de 15,6 până la 18,8 DKK (aproximativ 2, 1 miliard EUR - 2,5 miliarde EUR). [40]

Implicații pentru sănătatea umană

Pe 5 noiembrie, BBC News a raportat că 12 variante de infecție umană au fost detectate cu varianta Cluster 5 . [41]

O săptămână mai târziu, un raport de evaluare rapidă a riscului ECDC a indicat faptul că au apărut 214 de cazuri umane legate de nurcă, cu toate acestea, câteva dintre acestea, dacă există, se crede că au fost cazuri suplimentare legate de focarul de cluster . [42]

Începând cu 20 noiembrie, nu au mai fost detectate alte cazuri umane de tulpină Cluster 5, în ciuda secvențierii genetice pe scară largă, care a dezvăluit 750 de cazuri legate de nurcă și s-a estimat că varianta Cluster 5 nu mai circula la oameni. [43]

Reacții internaționale

Pe 6 noiembrie, Marea Britanie a anunțat că Danemarca va fi eliminată de pe lista albă a țărilor din care călătorii se pot întoarce fără autoizolare timp de 14 zile, citând varianta Cluster 5 . [44]

Pe 7 noiembrie, Marea Britanie a anunțat că va interzice, de asemenea, intrarea nerezidenților care călătoresc din Danemarca și nerezidenților care au fost în Danemarca în ultimele 14 zile. Cetățenilor britanici li se va mai permite să se întoarcă acasă, dar aceștia, precum și toți ceilalți membri ai familiei lor, vor trebui să se izoleze timp de 14 zile. Această interdicție de călătorie a trebuit să fie reexaminată după o săptămână. [45] [46]

Restricțiile vor fi în cele din urmă ridicate pe 28 noiembrie. [47]

Notă

  1. ^ (EN) AFP, 6 țări găsesc coronavirus la fermele de nurcă; temerile mutației ar putea împiedica vaccinul , la www.timesofisrael.com . Adus la 20 februarie 2021 .
  2. ^ a b ( DA ) De fleste restriktioner lempes i Nordjylland , su sum.dk. Adus la 20 februarie 2021 .
  3. ^ a b files.ssi.dk , https://files.ssi.dk/Mink-cluster-5-short-report_AFO2 .
  4. ^ (EN) Rapid Risk Assessment: Detection of new SARS-CoV-2 variants related to nurk , of European Center for Disvention Prevention and Control, 12 noiembrie 2020. Accesat la 20 februarie 2021.
  5. ^ ( DA ) nume, Mutationer i minkviruses , la www.ssi.dk. Adus la 20 februarie 2021 .
  6. ^ a b ( EN ) Bas B. Oude Munnink, Reina S. Sikkema și David F. Nieuwenhuijse, Transmission of SARS-CoV-2 on nurch farms between humans and nurk and back to humans , în Science , vol. 371, nr. 6525, 8 ianuarie 2021, pp. 172–177, DOI : 10.1126 / science.abe5901 . Adus la 20 februarie 2021 .
  7. ^ ecdc.europa.eu , https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/RRA-SARS-CoV-2-in-mink-12-nov-2020.pdf .
  8. ^ Aboneaza - te pentru a citi | Financial Times , la www.ft.com. Adus la 20 februarie 2021 .
  9. ^ ( DA ) Aflivninger rammer hårdt i minkland: - Jeg har mistet alt det, jeg har arbejdet på de sidste 33 år - TV 2 , pe nyheder.tv2.dk , 5 noiembrie 2020. Adus pe 20 februarie 2021 .
  10. ^ (EN) Olandeză Minks Contract COVID-19 - și apar pentru a infecta oamenii , pe NPR.org. Adus la 20 februarie 2021 .
  11. ^ ( FR ) Covid-19: le pangolin est-il vraiment responsable de l'épidémie? , în Sciences et Avenir . Adus la 20 februarie 2021 .
  12. ^ ( FR ) Origin du Sars-Cov2: Vers une enquête à «rebrousse-poil» de l'OMS en Chine? - par Yann Faure , pe Les-Crises.fr , 7 ianuarie 2021. Adus pe 20 februarie 2021 .
  13. ^ ( FR ) Les élevages de visons ont un rôle dans la pandémie de Covid-19 , in Reporterre, le quotidien de l'écologie . Adus la 20 februarie 2021 .
  14. ^ ( FR ) EXCLUSIF - Les élevages de visons sont-ils la source du Covid en Europe? , în Reporterre, quotidien de l'écologie . Adus la 20 februarie 2021 .
  15. ^ ( FR ) Malgré les risques de Covid, les États rechignent à arrêter l'élevage de visons , in Reporterre, le quotidien de l'écologie . Adus la 20 februarie 2021 .
  16. ^ ( FR ) Montarea dovezilor sugerează că fermele de nurci din China ar putea fi leagănul Covid-19 , su Reporterre, le quotidien de l'écologie . Adus la 20 februarie 2021 .
  17. ^ ( FR ) Par Emilie Torgemen Le 9 Janvier 2021 à 21h05, Modifié Le 12 Janvier 2021 à 08h48, Covid-19: et si le vison était le chaînon manquant? , pe leparisien.fr , 9 ianuarie 2021. Adus 20 februarie 2021 .
  18. ^ ( FR ) Amélie Poinssot și François Bougon, Emergence du SARS-CoV-2: les soupçons sur les élevages d'animaux à fourrure s'accumulent , on Mediapart . Adus la 20 februarie 2021 .
  19. ^ ( FR ) Covid-19: le vison dans le viseur des chercheurs chinois , pe Franceinfo , 11 ianuarie 2021. Adus 20 februarie 2021 .
  20. ^ Covid-19 termină cultivarea nurcă a olandezilor , în The Economist , 5 septembrie 2020. Adus pe 20 februarie 2021 .
  21. ^ ( DA ) Întrebări frecvente despre supraveghere și testare la nurcă , la www.foedevarestyrelsen.dk . Adus la 20 februarie 2021 (Arhivat din original la 27 noiembrie 2020) .
  22. ^ (EN) Eli CahanAug. 18, 2020, 10:55 AM, COVID-19 ajunge la fermele de nurcă din SUA după ce au rupt prin Europa , în Știința | AAAS , 18 august 2020. Adus pe 20 februarie 2021 .
  23. ^ Alaa Elassar CNN, o fermă de nurcă din Oregon a raportat un focar Covid-19 , pe CNN . Adus la 20 februarie 2021 .
  24. ^ (EN) Israelienii pot fi infectați cu o nouă tulpină de coronavirus de la Denmark Minks , de la The Jerusalem Post | JPost.com . Adus la 20 februarie 2021 .
  25. ^ Wayback Machine ( PDF ), pe web.archive.org , 5 decembrie 2020. Accesat la 20 februarie 2021 (arhivat din original la 5 decembrie 2020) .
  26. ^ (EN) James Gorman, Danemarca va ucide toate fermele de vizon, citând infecțiile cu coronavirus , în The New York Times, 4 noiembrie 2020. Accesat la 20 februarie 2021.
  27. ^ dr.dk , https://www.dr.dk/drtv/se/tv-avisen-ekstra_-myndighederne-holder-coronapressemoede-om-smitte-blandt-mink_221286 .
  28. ^ Copie arhivată ( PDF ), pe coronasmitte.dk . Adus la 20 februarie 2021 (arhivat din original la 5 decembrie 2020) .
  29. ^ ( DA ) Seruminstituttet bakker op om nedslagtning: Vil undgå nye minkvarianter af coronavirus , on DR , 7 noiembrie 2020. Adus pe 20 februarie 2021 .
  30. ^ (EN) Danemarca va ucide până la 17 milioane de nurci în temerile coronavirusului , în BBC News, 5 noiembrie 2020. Adus pe 20 februarie 2021.
  31. ^ www.thelocal.dk , https://www.thelocal.dk/20201105/how-serious-is-denmarks-mink-coronavirus-mutation-and-outbreak . Adus la 20 februarie 2021 .
  32. ^ ( DA ) OVERBLIK: Her er de nye restriktioner i Nordjylland , la TV2 Nord . Adus la 20 februarie 2021 .
  33. ^ a b OMS | SARS-CoV-2 tulpină variantă asociată nurcii - Danemarca , pe OMS . Adus la 20 februarie 2021 .
  34. ^ (EN) Agenția UE: răspândirea Coronavirus în Minks ar putea accelera mutațiile , pe medicalxpress.com. Adus la 20 februarie 2021 .
  35. ^ (RO) Mii de nurci sacrificate din cauza temerilor COVID se ridică dintr-un mormânt comun din Danemarca , pe www.cbsnews.com. Adus la 20 februarie 2021 .
  36. ^ (RO) Thomas Erdbrink și Marc Santora, sacrificarea Minks în Danemarca determină o criză politică. , în The New York Times , 19 noiembrie 2020. Adus pe 20 februarie 2021 .
  37. ^ (EN) Ministrul danez al Agriculturii demisionează pe fondul criticilor pentru comanda Mink Cull , pe NPR.org. Adus la 20 februarie 2021 .
  38. ^ Ministrul fermei daneze renunță la scandalul nurcii - POLITICO , pe web.archive.org , 21 noiembrie 2020. Accesat la 20 februarie 2021 (arhivat din original la 21 noiembrie 2020) .
  39. ^ ft.dk , https://www.ft.dk/ripdf/samling/20201/lovforslag/l77/20201_l77_som_vedtaget.pdf .
  40. ^ ( DA ) Sådan ser minkavlernes erstatning ud: 'De fleste vil få en større erstatning, end de har gæld' , pe DR , 26 ianuarie 2021. Adus pe 20 februarie 2021 .
  41. ^ (EN) Coronavirus: Danemarca impune blocaje de vizon covid în temeri în BBC News, 5 noiembrie 2020. Adus pe 20 februarie 2021.
  42. ^ (EN) R. Prasad, Nu există dovezi care să sugereze varianta de coronavirus găsită în clusterul 5 Minks Crește transmisibilitatea virusului, severitatea bolii , în The Hindu, 7 noiembrie 2020. Adus pe 20 februarie 2021.
  43. ^ CINE | SARS-CoV-2 tulpină variantă asociată nurcii - Danemarca , pe OMS . Adus la 20 februarie 2021 .
  44. ^ (EN) Covid: Danemarca eliminată de pe lista coridorului de călătorie din Marea Britanie , în BBC News, 6 noiembrie 2020. Adus pe 20 februarie 2021.
  45. ^ (EN) Coronavirus: Marea Britanie interzice vizitatorii asupra temerilor din Danemarca, de la Covid-19 , în BBC News, 8 noiembrie 2020. Adus pe 20 februarie 2021.
  46. ^ (RO) Simon Murphy și Peter Beaumont, Călătoria în Marea Britanie din Danemarca a interzis pe fondul îngrijorărilor legate de Covid în nurcă , în The Guardian, 7 noiembrie 2020. Adus pe 20 februarie 2021.
  47. ^ legislative.gov.uk , https://www.legislation.gov.uk/uksi/2020/1360/made .

Elemente conexe

Estratto da " https://it.wikipedia.org/w/index.php?title=SARS-CoV-2_Cluster_5&oldid=122464283 "