În sezonul 1948-1949 Pavia este admisă în noua serie C, patru grupe la nivel național din seria a treia, Pavia contestă grupa B formată în principal din echipe din Veneto și Romagna. Cu 39 de puncte în clasament, el ocupă locul 11. Turneul care include o singură promovare a fost câștigat de Udinese cu 54 de puncte care crește în Serie B, înaintea surprizei Libertas Trieste pe locul doi cu 54 de puncte.
La conducerea Granatei Pavesi se află în dublul rol de jucător și antrenor Carlo Alberto Quario , proaspăt din patru campionate de Serie A cu Napoli, cu Ambrosiana și cu Brescia, după ce a făcut primii pași de fotbal la Pavia. Pe lângă blocul de jucători confirmați, ajung și Manlio Cipolla de la Inter, Luciano Alghisi de la Varese, Renzo Gottardo de la Acqui și Mario De Prati de la Medese. În ciuda unui început dificil și a unui campionat discontinuu, Pavia rămâne întotdeauna departe de mlaștina clasamentului scăzut. Printre notele pozitive ale sezonului, cele 22 de goluri marcate în campionat de Manlio Italo Cipolla, cele șase victorii în deplasare pe terenurile de la Bolzano, Rimini, Rovigo, Centese, Bondenese și Mantua și runda (8-0) aplicată lui Marzotto în finala campionatului.