Virusul hepatitei E.
| Orthohepevirus A | |
|---|---|
 | |
| Clasificare științifică | |
| Domeniu | Riboviria |
| Regatul | Orthornavirae |
| Phylum | Kitrinoviricota |
| Clasă | Alsuviricete |
| Ordin | Hepelivirale |
| Familie | Hepeviridae |
| Tip | Orthohepevirus |
| Specii | Orthohepevirus A |
| Denumiri comune | |
Virusul hepatitei E. | |
Virusul hepatitei E ( HEV ) este agentul cauzal al hepatitei E. Aparține speciei Orthohepevirus A. O denumire anterioară a speciei era virusul hepatitei E. [1] [2]
Povara globală a infecțiilor din cele două genotipuri principale (1 și 2) este estimată la 20 de milioane pe an, rezultând 70.000 de decese și 3.000 de avorturi. [3]
Particula virală a fost observată pentru prima dată în 1983 [4], dar a fost clonată molecular abia în 1989. [5]
Taxonomie
A fost clasificat anterior în familia Caliciviridae . Cu toate acestea, genomul său seamănă mai mult cu virusul rubeolei . Acesta este acum clasificat ca membru al Orthohepevirus genului în Hepeviridae familie. [2]
Structura
Particulele virale au un diametru cuprins între 27 și 34 nanometri și nu au pericapsidă . [2] [4]
Genom și proteom
Ortohepevirusul A poate fi clasificat în opt genotipuri diferite, aparținând unor regiuni geografice diferite: genotipul 1 ( Asia ), genotipul 2 ( Africa și Mexic ), genotipul 3 ( Europa și America de Nord ), genotipul 4 ( Asia ); genotipurile 5 și 6 au fost detectate la mistrețul asiatic și genotipurile 7 și 8 la cămile . [2] [6]
Genomul viral constă dintr-o singură catenă de ARN cu sens pozitiv care are o lungime de aproximativ 7200 de baze . Cele trei cadre de citire deschisă (ORF1, ORF2 și ORF3) codifică trei proteine (O1, O2, O3), dintre care două sunt poliproteine, adică sunt împărțite în fragmente care îndeplinesc funcțiile reale ale virusului. Proteina O1 constă din șapte dintre aceste fragmente, și anume Met ( metiltransferază ), Y (domeniu Y), Plp ( protează asemănătoare papainei ), V (regiune variabilă bogată în prolină ), X (domeniu X, domeniu macro), Hel ( helicază) ) și Rdrp ( ARN polimerază dependentă de ARN ). Domeniul Pvx este o proteină de fuziune formată din domeniile Plp, V și X. Proteina O3 este codificată de un singur cadru de citire deschis (ORF3). Proteina O2 codifică capsida , care este compusă din trei domenii, și anume domeniul shell (S) și două domenii proeminente (P1, P2). [7] Numerele din figură indică pozițiile din secvența ARN.
Interactom
Interacțiunea proteină-proteină dintre proteinele Orthohepevirus A a fost cartografiată în 2015 de Osterman și colab., Care au găsit 25 de interacțiuni dintre cele 10 proteine studiate. Aproape toate aceste interacțiuni (24) au fost considerate de „înaltă calitate”. [8]
Evoluţie
Tulpinile de HEV care există astăzi ar putea fi derivate dintr-un strămoș comun datând de la 536 la 1344 de ani în urmă. [9] O altă analiză datează originea hepatitei E cu aproximativ 6.000 de ani în urmă, sugerând că a fost asociată cu domesticirea porcilor . [10] La un moment dat, două clade s- ar fi putut îndepărta, o formă antropotropă și o formă enzootică, care au evoluat ulterior în genotipurile 1 și 2 și respectiv 3 și 4. [11]
În timp ce genotipul 2 rămâne mai puțin detectat decât alte genotipuri, analizele genetice evolutive sugerează că genotipurile 1, 3 și 4 s-au răspândit considerabil în ultimii 100 de ani. [12]
Notă
- ^ (EN) Michael A. Purdy, Schema nouă de clasificare pentru Hepeviridae ( PDF ), în International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) , iunie 2014. Adus 1 mai 2019 .
„Speciile virusului hepatitei E vor fi redenumite Orthohepevirus A , iar speciile virusului hepatitei E aviare vor fi redenumite Orthohepevirus B. ” . - ^ a b c d ictv.global , http://www.ictv.global/report/hepeviridae .
- ^ Rein, DB, Stevens, GA, Theaker, J., Wittenborn, JS & Wiersma, ST (2012) Sarcina globală a genotipurilor 1 și 2 ale virusului hepatitei E în 2005. Hepatologie 55, 988-97
- ^ a b Dovezi pentru un virus în hepatita non-A, non-B transmisă pe calea fecal-orală , în Intervirology , vol. 20, nr. 1, 1983, pp. 23-31, DOI : 10.1159 / 000149370 , PMID 6409836 .
- ^ Izolarea unui ADNc de virusul responsabil pentru hepatita non-A, non-B transmisă enteric , în Știința , vol. 247, nr. 4948, 1990, pp. 1335-9, Bibcode : 1990Sci ... 247.1335R , DOI : 10.1126 / science.2107574 , PMID 2107574 .
- ^ Schlauder, GG și Mushahwar, IK (2001) Heterogenitatea genetică a virusului hepatitei E. J Med Virol 65, 282-92
- ^ Virologia moleculară a virusului hepatitei E , în Virus Res. , Vol. 161, n. 1, 2011, pp. 47-58, DOI : 10.1016 / j.virusres.2011.02.011 , PMID 21345356 .
- ^ Interactomul intraviral al virusului hepatitei E , în Sci Rep , vol. 5, 2015, p. 13872, Bibcode : 2015NatSR ... 513872O , DOI : 10.1038 / srep13872 , PMID 26463011 .
- ^ (EN) Yury Khudyakov E. și Michael A. Purdy, Istorie evolutivă și dinamica populației virusului hepatitei E , în PLOS ONE, vol. 5, nr. 12, 17 decembrie 2010, pp. e14376, Bibcode : 2010PLoSO ... 514376P , DOI : 10.1371 / journal.pone.0014376 , ISSN 1932-6203 , PMID 21203540 .
- ^ Sarra Baha, Nouredine Behloul și Zhenzhen Liu, Analiza cuprinzătoare a caracteristicilor genetice și evolutive ale virusului hepatitei E , în BMC Genomics , vol. 20, nr. 1, 29 octombrie 2019, p. 790, DOI : 10.1186 / s12864-019-6100-8 , ISSN 1471-2164 , PMID 31664890 .
- ^ Mirazo S, Mir D, Bello G, Ramos N, Musto H, Arbiza J, New insights into the hepatitis E virus genotype 3 filodynamics and evolutionary history , în Infect Genet Evol , vol. 43, 2016, pp. 267-73, DOI : 10.1016 / j.meegid.2016.06.003 , PMID 27264728 .
- ^ Izopet J, Abravanel F, Dalton H, Nassim RK (2014) Infecția cu virusul hepatitei E. Clin Micro Reviews 27 (1) 116–138
linkuri externe
- ictv.global , http://www.ictv.global/report/hepeviridae .
- (EN) Virusul hepatitei E în rubricile subiectului medical (MeSH), Biblioteca Națională de Medicină , 2009.
- viprbrc.org , http://www.viprbrc.org/brc/home.do?decorator=hepe .
