Markeri genetici

Doi pui pe figura unei hărți genetice a unui pui . Un genom de pui are 39 de perechi de cromozomi , în timp ce genomul uman conține 23 de perechi

Un marker genetic este o secvență de ADN cunoscută care poate fi identificată printr-un test simplu. Un marker genetic poate fi constituit printr-o secvență scurtă de ADN, cum ar fi secvența care înconjoară un singur polimorfism nucleotidic (polimorfism nucleotidic unic), sau printr-o secvență lungă, cum ar fi microsateliții . Mulți ani, cartografierea genetică a fost limitată în multe organisme la markeri genetici tradiționali care includ gene care codifică caracteristici ușor de observat, cum ar fi sângele sau semințele. Numărul insuficient al acestor tipuri de caracteristici, în multe organisme, a limitat posibila cartografiere ^[1] .

Tipuri

Principiile descoperirii SFP

Unele tipuri de markeri genetici frecvent utilizați sunt:

RFLP ( Restriction Fragment Length Polymorphism )
VNTR ( număr variabil de repetare tandem )
SNP ( polimorfism unic nucleotidic )
STR ( repetare scurtă în tandem )
SSLP ( polimorfism de lungime simplă a secvenței )
AFLP ( polimorfism de lungime a fragmentului amplificat )
RAPD ( Amplificarea aleatorie a ADN-ului polimorf )
Microsateliți ( polimorfism ), SSR ( repetare simplă a secvenței )
SFP ( polimorfism cu caracteristică unică )
DArT ( Diversity Arrays Technology )
RAD ( markeri ADN asociați site-ului de restricție )
I-SSR ( Repetare inter-simplă a secvenței )
STS ( Site-uri marcate cu secvențe )

Pot fi clasificate în continuare ca dominante sau co-dominante. Dominanții permit analiza mai multor loci la un moment dat, cum ar fi RAPD . Un primer amplifică un marker dominant permițând mulți loci într-o singură probă de ADN cu o reacție PCR . Co-dominanții analizează câte un locus la un moment dat. Un primer amplifică un marker co-dominant pe un produs țintă. Markerii dominanți, cum ar fi RAPD și markerii de înaltă eficiență ( AFLP , SMPL ), permit analiza mai multor loci pe experiment fără a cunoaște informații prealabile despre succesiunea lor. Markerii co-dominanți ( RFLP , microsateliți etc.) permit analiza unui singur locus pe experiment, deci sunt mai bogați în informații deoarece se pot distinge variațiile alelice ale locusului. În consecință, este posibil să se identifice grupuri de legătură între diferite hărți genetice, dar, pentru dezvoltare, este necesar să se cunoască secvența (punctul foarte scump și slab al tehnicii).

Utilizări

Markerii genetici pot fi utilizați pentru a studia relația dintre o boală moștenită și cauza genetică a acesteia (de exemplu, o mutație specială într-o genă care generează o proteină defectă). Se știe că părți ale ADN-ului care se află aproape între ele pe un cromozom sunt moștenite împreună. Această proprietate favorizează utilizarea markerilor, care pot fi apoi folosiți pentru a determina modul precis în care este moștenită gena care nu este încă exact localizată. Markerii genetici trebuie să fie ușor de identificat, asociați cu un locus specific și foarte polimorf . Identificarea markerilor are loc direct prin secvențierea ADN-ului sau indirect prin utilizarea alozimelor .

Notă

^ Pierce, Benjamin A. Genetica: o abordare conceptuală. Ediția a II-a.

Bibliografie

de Vicente, C., T. Fulton, Module de învățare a markerului molecular - Vol. 1. ^{[ link broken ]} , IPGRI, Roma, Italia și Institute for Genetic Diversity, Ithaca, New York, SUA., 2003.
de Vicente, C., T. Fulton, Molecular Marker Learning Modules - Vol. 2. , IPGRI, Roma, Italia și Institute for Genetic Diversity, Ithaca, New York, SUA., 2004. Accesat la 21 noiembrie 2012 (depus de „ adresa URL originală la 14 august 2013) .
de Vicente, C., JC. Glaszmann, editori, Molecular Markers for Allele Mining , AMS (Bioversity's Regional Office for the Americas), CIRAD, GCP, IPGRI, MS Swaminathan Research Foundation, 2006. Accesat la 21 noiembrie 2012 (arhivat din original la 4 decembrie 2007) . 85 p.
Spooner, S., R van Treuren și MC de Vicente, Markeri moleculari pentru managementul băncii genetice , CGN, IPGRI, USDA, 2005. Accesat la 21 noiembrie 2012 (arhivat din original la 3 mai 2008) . 126 p.
Ce este un marker genetic? , pe bostonpaternity.com .