Repetarea tandem
În genetică și biologie moleculară , repetările în tandem sunt definite ca toate regiunile ADN constând din secvențe de două sau mai multe nucleotide repetate una după alta.
Descriere
Repetițiile tandem sunt utilizate pe scară largă în aplicațiile genetice care vizează determinarea trăsăturilor genetice individuale. Prin urmare, ele pot fi utilizate, în diferite moduri, în comparația dintre o probă de ADN și un individ. Astfel de repetări pot fi, de asemenea, foarte utile pentru determinarea rudeniei.
De exemplu secvența
- ATTCG ATTCGATTCGATTCG
este o repetare în tandem a ATTCG (repetată de patru ori).
Repetițiile în tandem scurt ( repetări scurte în tandem ) sunt utilizate pentru ADN-ul diferitelor teste de efectiv. ADN-ul este examinat pornind de la microsateliții din interiorul cromozomului : PCR-ul acestor regiuni se efectuează în toate organismele examinate, apoi rulează amplificatoarele într-un gel electroforetic . Pe baza corespondenței sau nu între benzile obținute din cursă, este posibil să se determine rudenia sau identitatea probelor analizate.
Elemente conexe
linkuri externe
- Exemple:
- VNTR - informații și exemple animate
- Bază de date:
- Baza de date a microorganismelor în tandem repetă , pe minisatellites.u-psud.fr .
- Baza de date Short Tandem Repeats , la cstl.nist.gov .
- Baza de date Tandem Repeats (TRDB) , pe tandem.bu.edu .
- Instrumente de cercetare:
- Tandem Repeats Finder , pe tandem.bu.edu .
- Mreps , pe bioinfo.lifl.fr .
- STAR , pe atgc.lirmm.fr .
- Tred pe sci.brooklyn.cuny.edu.
- TandemSWAN , pe strand.imb.ac.ru . Adus la 10 februarie 2008 (arhivat din original la 12 iulie 2006) .
- Microsatellite repetă căutarea , la biophp.org . Adus la 10 februarie 2008 (arhivat din original la 9 iulie 2006) .
- JSTRING - Căutare Java pentru repetări tandem în genomi , pe bioinf.dms.med.uniroma1.it . Adus la 10 februarie 2008 (arhivat din original la 4 aprilie 2006) .
- Phobos - un instrument de căutare repetată în tandem pentru repetări perfecte și imperfecte - dimensiunea maximă a modelului depinde doar de puterea de calcul , su rub.de.
