Microsateliți
Definim microsateliții (sau Short Tandem Repeats sau STR , de asemenea, cunoscut sub numele de Simple Sequence Repeats sau SSR , sau ca Short Tandem Repeat Polymorphism sau STRP ) secvențe repetate de ADN necodificator format din unități de repetare foarte scurte (1-5 bp ) aranjate conform la o repetare în tandem , utilizabilă ca markeri moleculari de loci . Prezența lor în genomul uman nu afectează mai mult de 3%, dar se crede că în orice caz îndeplinesc o funcție esențială pentru structura cromozomilor .
Microsateliții prezintă un nivel ridicat de polimorfism și sunt markeri informativi în studiile de genetică a populației , incluzând perspective de la nivelul individual la cel al speciilor strâns înrudite și în genetica criminalistică.
De fapt, datorită studiului microsateliți, este posibil să se creeze un ADN profil (ADN profilare sau amprenta genetica ) , datorită cărora se identifică un subiect. Comparația genetică poate fi realizată prin compararea lungimii diferite a microsateliților prezenți la diferiți indivizi. Astfel de diferențe caracterizează repetarea polimorfismului .
Ele sunt, de asemenea, utilizate ca markeri moleculari în duplicarea genei sau eliminarea genelor și studii de selecție asistată de markeri .
Analiza microsatelitelor
În SUA există o bază de date ADN criminalistică, numită CODIS ( COmbined Dna Indexing System ), care implică analiza a 13 STR prezente pe 11 din cei 23 de cromozomi. Lociurile STR utilizate în CODIS, 13 din 11 cromozomi, sunt:
| STR | Cromozom | Numărul de repetări |
| TAGA | 5 | De 5 până la 16 ori |
| TCAT | 11 | De 3 până la 14 ori |
| GAAT | 2 | De 4 până la 16 ori |
| CTTT | 4 | De 12 până la 51 de ori |
| TCTG / TCTA | 12 | De 10 până la 25 de ori |
| TCTG / TCTA | 3 | De 8 până la 21 de ori |
| TCTG / TCTA | 8 | De 7 până la 20 de ori |
| TCTG / TCTA | 21 | De 12 până la 41 de ori |
| AGAT | 5 | De 7 până la 18 ori |
| GATA | 7 | De 5 până la 16 ori |
| TACT | 13 | De 13 până la 16 ori |
| GATA | 18 | De 5 până la 16 ori |
| AGAA | 18 | De 7 până la 39 de ori |
Un alt marker, amelogenina (AMEL) identifică sexul individului, deoarece gena este flancată de secvențe ușor diferite pe heterocromozomii X și Y și, determinându-le, sexul poate fi apoi urmărit.
Toate diferitele STR sunt precedate și urmate de secvențe specifice pentru fiecare STR și identice la diferiți indivizi, cu excepția posibilelor mutații rare. Hibridizând aceste secvențe cu primeri, special concepuți să nu interfereze unul cu celălalt și să evidențieze diferențele de lungime ale diferitelor STR, acesta suferă PCR.
După ce a obținut astfel o cantitate adecvată de STR, electroforeza capilară va da o serie de benzi corespunzătoare diferitelor lungimi ale STR-urilor. Comparând aceste benzi din ADN-ul unui suspect cu cele din ADN găsite la locul faptei, se poate ajunge la o atribuire sau o excludere a responsabilității.
Rețineți că cromozomii omologi materni și paterni pot fi homozigoți sau heterozigoți pentru secvența STR: în primul caz vom avea o singură bandă pentru marker, în al doilea în loc de două eșalonate, (și poate puțin mai puțin marcate), deoarece diferit este numărul repetițiilor respective la omologii paterni și materni.
Bibliografie
- David Caramelli, Antropologie moleculară , Firenze University Press, 2009, ISBN 978-88-8453-696-9 .
Elemente conexe
Alte proiecte
-
Wikimedia Commons conține imagini sau alte fișiere pe microsatelite
linkuri externe
- Site-ul oficial , pe sequenceontology.org .
- ( EN ) Microsateliți , în Encyclopedia Britannica , Encyclopædia Britannica, Inc.
| Controlul autorității | LCCN ( EN ) sh98007300 |
|---|
