Orthocoronavirinae

De la Wikipedia, enciclopedia liberă.
Salt la navigare Salt la căutare
Notă despre dezambiguizare.svg Dezambiguizare - "coronavirus" se referă aici. Dacă sunteți în căutarea virusului responsabil pentru pandemia COVID-19 2019-2021 , consultați SARS-CoV-2 .
Progetto:Forme di vita/Come leggere il tassoboxCum să citiți caseta
Orthocoronavirinae
Coronavirusuri 004 lores.jpg
Virionii coronavirusului aviar la microscopul electronic de transmisie
Gama geologică
Cambrian - Neogen
Clasificare științifică
Domeniu Riboviria
Regatul Orthornavirae
Phylum Pisuviricota
Clasă Pisoniviricete
Ordin Nidovirale
Subordine Cornidovirineae
Familie Coronaviridae
Subfamilie Orthocoronavirinae

Orthocoronavirinae este un virus subfamilial, cunoscut și sub numele de coronavirus, familia Coronaviridae , subordinea Cornidovirineae , ordinul nidovirale . [1] În trecut a fost clasificat ca gen .

Împărțite în genuri (în subgenurile din trecut) Alphacoronavirus , betacoronavirus , Gammacoronavirus și Deltacoronavirus , acestea includ genogrupuri compacte filogenetic de ARN învelit, cu sens pozitiv și cu o nucleocapsidă de simetrie elicoidală. Alphacoronavirus și betacoronavirus derivat din grupul de gene al liliecilor .

„Mărimea genomului” coronavirusurilor variază de la aproximativ 26 la 32 kilobaze , extraordinar de mari pentru un virus ARN . [2] [3] Numărul lor crește rapid cu mai multe coronavirusuri noi descoperite recent, inclusiv SARS-CoV-1 descoperit în 2002, MERS-CoV în 2012 și SARS-CoV-2 descoperit în 2019 în Wuhan , China .

Numele de "coronavirus" este derivat din latinescul "corona", el însuși derivat din grecescul κορώνη (Korona, "Ghirlandă"), care înseamnă "coroană" sau "halo". Aceasta se referă la spinula [4] [5] (proteina S) formată din virioni (forma infecțioasă a virusului) vizibile în microscopul electronic , care prezintă o serie de glicoproteine ​​de suprafață care dau o imagine care amintește de o coroană regală sau o coroană solară . Această morfologie se datorează spinulei peplomeri virali, care sunt proteine care populează suprafața virusului și determină gazda tropismului .

Se crede că primul caz raportat de coronavirus se datorează medicilor veterinari germani care, în 1912, au descris cazul unei pisici febrile cu o burtă imensă mărită. Dar abia în anii 1960 un virus asemănător coroanei care a cauzat răceli comune a fost izolat și asociat cu fenomenul, inclusiv alții găsiți la o varietate de animale. Cercetătorii au crezut că coronavirusul este capabil să provoace doar simptome ușoare la oameni, până când nu a existat un focar de SARS în 2003 [6] .

Coronavirusurile sunt responsabile de diferite boli la mamifere și la păsări : apariția diareei la bovine și porci și boli respiratorii ale căilor respiratorii superioare la găini . Omul lui Nell, care provoacă infecții ale căilor respiratorii, adesea minore ca răceala obișnuită , dar în cazuri rare care pun viața în pericol, cum ar fi pneumonia și bronșita .

Coronavirusul a fost responsabil pentru focare grave de SARS în noiembrie 2002, respectiv MERS 2012 și noua pandemie COVID-19 .

Structura

Modelul de coronavirus văzut în secțiune

Coronavirusurile sunt virusuri ARN cu diametru pozitiv de aproximativ 80-160 nm , făcându-le printre cei mai mari viruși care atacă ființa umană. Cu 30.000 de baze genetice, coronavirusurile au cel mai mare genom al virusurilor ARN și este unul dintre puținii virusuri ARN care au un mecanism de corecție a citirii genetice care previne acumularea mutațiilor. Numele virusului vine de la o formă clasică valoroasă la microscopul electronic de transmisie în „coroană”. Acest aspect este dat de prezența spinulei reprezentată de glicoproteina care se întinde pe pericapsidă , ajungând la acoperirea proteică , proteina spinula menționată sau proteina S, cu proprietăți de hemaglutinare și topire. Structura virusului este aceea mai mult sau mai puțin tipică pentru virusurile învelite: de aceea prezintă o nucleocapsidă cu simetrie elicoidală și o pericapsidă constă dintr-o bistrată fosfolipidică de origine celulară; între aceste două straturi se interpune un strat proteic format din proteina M (matrice). În nucleocapsid găsește genomul constă dintr-un ssRNA + (o catenă de ARN unic polaritate pozitivă) de la 27-30 kilograme bazând coduri pentru 7 proteine ​​virale și este asociat cu proteina N.

Coronavirusul se atașează de membrana celulară a celulelor țintă datorită proteinelor S care interacționează cu „ aminopeptidaza N a membranei. Unele coronavirusuri pot lega „ acidul N-acetil neuraminic datorită expresiei glicoproteinei E3 . Nu este clar dacă pătrunderea celulei se efectuează prin fuziunea pericapsidului cu membrana plasmatică sau endocitoză . În interiorul citoplasmei coronavirusului celular eliberează ARN - ul său unic catena pozitivă care se atașează la ribozom , unde este tradus . Traducerea implică producerea unui ARN-polimerază dependent de ARN ( proteina L ) care transcrie o catenă ARN negativă din care este posibil să se obțină o nouă catenă ARN pozitivă a coronavirusului, precum și cele șapte proteine ​​pe care le codifică. La fiecare nouă catena pozitivă ARN este asociat cu proteina N, în timp ce proteinele pericapsidice sunt integrate în membrana reticulului endoplasmatic . Un mutant transferă noi nucleocapside în lumenul reticulului endoplasmatic ; ulterior din această gemmano vezicule care constituie noii virioni care pot fi eliberați pentru exocitoză .

genuri

Familia coronavirusului a fost împărțită în patru tipuri distincte: [7] [8]

Genul alphacoronavirus (cunoscut anterior sub numele de Coronavirus grup 1 , CoV-1) cuprinde subgrupurile 1a și 1b, care sunt prototipate de coronavirusul uman 229E ( HCoV-229E ) și HCoV-NL63 , precum și de noua specie de alfacoronavirus 1 (inclusiv virusul a gastroenteritei transmisibile porcine, TGEV), respectiv.

Genul betacoronavirus (anterior coronavirus grup 2, Cov-2) cuprinde mai multe subgrupuri, cu cele mai importante (subgrupuri 2a și 2b) prototipate de specii coronavirus murin (inclusiv virusul hepatitei de șoarece , MHV) și coronavirus legat de SARS . Este împărțit în subgenuri Embecovirus , Hibecovirus , Merbecovirus , Nobecovirus și Sarbecovirus .

Genul include gammacoronavirus, toate coronavirusurile aviare identificate până în 2009.

Coronavirus de interes uman

Această ilustrație, creată de Centrele pentru Controlul și Prevenirea Bolilor (CDC), SUA , relevă morfologia ultrastructurală afișată de „ SARS-CoV-2 ”. Rețineți tachelele care punctează suprafața exterioară a virusului și care îi conferă aspectul unei coroane care înconjoară virionul , având în vedere microscopul electronic . Acest virus a fost identificat ca fiind cauza unei pandemii de boli respiratorii înregistrate pentru prima dată în Wuhan , în China .

Coronavirusul a fost descoperit în anii șaizeci din cavitățile nazale ale pacienților cu răceală obișnuită . [9] Aceste virusuri au fost numite ulterior coronavirus uman 229E (HCoV-229E) și coronavirus uman OC43 (HCoV-OC43). [10] au identificat alți doi membri ai acestei familii ( coronavirus uman NL63 , HCoV-NL63, în 2004; Coronavirus uman HKU1 , HCoV-HKU1, în 2005) și au fost implicați în infecții ale căilor respiratorii mai severe.

Nu există vaccinuri sau medicamente antivirale considerate valabile de comunitatea științifică pentru prevenirea sau tratamentul bolilor induse.

Se crede că coronavirusurile provoacă un procent semnificativ din toate răcelile frecvente la adulți și copii. Simptomele care apar mai frecvent sunt febra și adenoidita acută cu incidență mai mare în timpul iernii și la începutul primăverii. [11] În multe cazuri coronavirusurile pot provoca pneumonie , pneumonie virală directă sau pneumonie bacteriană secundară; De asemenea, pot duce la dezvoltarea bronșitei , bronșitei virale directe sau bronșitei bacteriene secundare. [12]

Tulpinile din cauza principalelor boli care afectează oamenii aparțin genului betacoronavirus. [13]

Coronavirusul uman descoperit în 2003, SARS-CoV-1 , provoacă sindrom respirator acut sever (SARS) și are o patogeneză unică, deoarece provoacă infecții ale tractului respirator superior și inferior. [12]

Varianta SARS a coronavirusurilor, care a apărut pentru prima dată în China în provincia Guangdong în noiembrie 2002 și izolată pentru prima dată în anul următor , are exact aceleași caracteristici morfologice ca și celelalte coronavirusuri, dar pare a fi o specie complet nouă, probabil derivată dintr-un rezervor de animale (încă nu se știe) care s-a adaptat bine la om. Printre factorii pe care virusul SARS îi folosește pentru a-și crește dramatic virulența decât alte coronavirusuri, este un sistem de inhibare puternic al interferonului .

Un alt focar periculos cauzat de o altă tulpină de coronavirus a început în iunie 2012 în Arabia Saudită . Boala a primit astfel denumirea de sindrom respirator din Orientul Mijlociu Coronavirus sau MERS ( acronimul dall 'în engleză ). Au fost evaluați prin teste de laborator cel puțin 2.000 de cazuri la nivel mondial, dintre care mai mult de 3/4 în Arabia Saudită ; [14] până în iunie 2015 au existat peste 500 de decese (din aproximativ 1500 de cazuri înregistrate până la acea dată). [15]

31 decembrie 2019 a fost raportată o nouă tulpină a acestui virus în Wuhan , în China , [16] identificată ca o nouă tulpină de β-CoV din grupa 2B cu o asemănare genetică de aproximativ 70% comparativ cu SARS-CoV-1 . Ca rezultat, noua tulpină a fost denumită SARS-CoV-2 .

Din ianuarie 2020, sunt cunoscute 7 tulpini de coronavirus care pot infecta oamenii:

  1. Coronavirus uman 229E (HCoV-229E)
  2. Coronavirus uman OC43 (HCoV-OC43)
  3. Coronavirus uman NL63 (HCoV-NL63)
  4. HKU1 Coronavirus uman (HCoV-HFU1) [3]
  5. Coronavirus sindrom respirator acut sever (SARS-CoV-1)
  6. Coronavirusul sindromului respirator din Orientul Mijlociu (MERS-CoV), cunoscut și sub numele de Novel Coronavirus 2012 (2012-nCoV)
  7. Coronavirus 2 din sindromul respirator acut sever (SARS-CoV-2), [17] [18] cunoscut și sub numele de Novel Coronavirus 2019 (2019-nCoV) sau Coronavirus Wuhan. [19]

Transmiterea coronavirusului între oameni se face în principal prin picături respiratorii emise de la un individ infectat prin tuse sau strănut , care sunt apoi inhalate de o persoană sănătoasă care se află în apropiere. S-ar părea că este posibil să se infecteze chiar și după ce ați atins suprafețe sau obiecte unde este prezent virusul și apoi a adus mâinile către gura cuiva sau spre nas sau ochi. [20]

Deși virusurile respiratorii sunt de obicei transmise atunci când pacientul subiect prezintă și simptomele , coronavirusul SARS-CoV-2 se poate răspândi și cu ocazia unui contact strâns cu un pacient infectat asimptomatic. [20]

Taxonomie

Noile coronavirusuri

Cu nCoV inițialele sunt menționate în mod generic la noi specii sau tulpini de coronavirus care nu au fost identificate anterior la om. [21]

Notă

  1. ^ Navigator de taxonomie (Orthocoronavirinae) pe www.ncbi.nlm.nih.gov. Adus pe 14 martie 2020.
  2. ^ De Groot RJ, Baker SC, Baric R, Enjuanes L, Gorbalenya AE, Holmes KV, Perlman S, Poon L, Rottier PJ, PJ Talbot, Woo PC, Ziebuhr J, Family Coronaviridae În AMQ King, E Lefkowitz, MJ Adams și EB Carstens (eds), al nouălea raport al Comitetului internațional pentru taxonomia virusurilor, Elsevier, Oxford, 2011, pp. 806-828, ISBN 978-0-12-384684-6 .
  3. ^ A b International Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV Master Species List 2009 - v10 (XLS), pe talk.ictvonline.org, 24 august 2010.
  4. ^ Spìnula in Vocabulary - Treccani
  5. ^ Actualizări privind contagiunea lexicală a virușilor coronii | Să spunem în italiană
  6. ^ Nature.com, https://www.nature.com/articles/d41586-020-01315-7
  7. ^ (EN) Taxonomie , pe ICTV. Adus pe 19 ianuarie 2020.
  8. ^ Navigator de taxonomie (Orthocoronavirinae) , al Centrului Național pentru Informații despre Biotehnologie. Adus la 13 martie 2020 .
  9. ^ Jeffrey S. Kahn și Kenneth McIntosh, Istorie și progrese recente în descoperirea coronavirusului , în The Pediatric Infectious Disease Journal, vol. 24, 11 Suppl, 2005-11, pp. S223-227, S226 discuție, DOI : 10.1097 / 01.inf.0000188166.17324.60 . Adus pe 14 martie 2020.
  10. ^ Geller C, M Varbanov, Duval RE, Coronavirus uman: informații despre rezistența la mediu și influența lor asupra dezvoltării de noi strategii antiseptice, viruși.
  11. ^ (EN) Liu P, Shi L, Zhang W, He J, Liu C, Zhao C, Kong SK, Loo JF, Gu D, Hu L,Prevalența și analiza diversității genetice a coronavirusurilor umane în rândul copiilor transfrontalieri , în Virologie Jurnal, vol. 14, n. 1, noiembrie 2017, p. 230 DOI : 10.1186 / s12985-017-0896-0 , PMC 5700739 , PMID 29166910 .
  12. ^ A b (EN) Forgie S, Marrie TJ, Pneumonie atipică asociată asistenței medicale , în seminarii în medicina de îngrijire respiratorie și critică, vol. 30, n. 1, februarie 2009, pp. 67-85, DOI : 10.1055 / s-0028-1119811 , PMID 19199189 .
  13. ^ (EN) Cluster de cazuri de pneumonie cauzate de un nou coronavirus, Wuhan, China (PDF) pe ECDC (Centrul European pentru Prevenirea și Controlul Bolilor), 17 ianuarie 2020. Accesat la 19 ianuarie 2020.
  14. ^ (EN) WHO MERS-CoV Global Summary and Assessment of Risk (PDF) of WHO [Organizația Mondială a Sănătății], 2017. Accesat la 19 ianuarie 2020.
  15. ^ (EN) Actualizare epidemiologică: coronavirusul sindromului respirator din Orientul Mijlociu (MERS-CoV) privind legea ECDC (Centrul European pentru Prevenirea și Controlul Bolilor), 2015. Accesat la 19 ianuarie 2020.
  16. ^ Noul coronavirus, explicat bine , din The Post, 27 ianuarie 2020. Adus pe 27 ianuarie 2020.
  17. ^ (EN) Testarea în laborator a cazurilor suspectate de infecție cu coronavirus (nCoV). Ghid interimar, 10 ianuarie 2020 (PDF), pe apps.who.int. Adus la 14 ianuarie 2020 ( depus la 20 ianuarie 2020).
  18. ^ (EN)Novel Coronavirus 2019, Wuhan, China | CDC , cdc.gov la 23 ianuarie 2020. Accesat la 23 ianuarie 2020 ( depus la 20 ianuarie 2020).
  19. ^ Pneumonie de cauze necunoscute - China , on who.int, Organizația Mondială a Sănătății, 5 ianuarie 2020. Accesat la 23 ianuarie 2020 ( depus la 7 ianuarie 2020).
  20. ^ A b (EN) Transmission of Novel Coronavirus (2019-nCoV) | CDC pe cdc.gov, 31 ianuarie 2020. Adus la 1 februarie 2020.
  21. ^ Ministerul Sănătății, FAQ - Întrebări și răspunsuri Covid-19 pe www.salute.gov.it. Adus de o iunie 2020.

Bibliografie

Elemente conexe

Alte proiecte

linkuri externe