ADN nucleotidil-exotransferaza
ADN nucleotidil-exotransferaza (Transfer la terminal) | |
---|---|
ADN uman nucleotidylexotransferaza 19-125 aminoacizi. Redarea PDB bazată pe 2coe. | |
Numărul CE | 2.7.7.31 |
Clasă | Transferasis |
Numele sistematic | |
TDT: Deoxinucleotidă transferază terminală | |
Alte nume | |
Deoxinucleotidil transferază terminală Enzimă de adăugare terminală | |
Baze de date | BRENDA , EXPASY , GTD , PPB ( RCSB PPB PDBe PDBj PDBsum ) |
Sursa:IUBMB | |
Enzima nucleară ADN nucleotidil-exotransferază , cunoscută în mod obișnuit ca transferază terminală (în engleză : deoxinucleotidil transferază terminală , abrevierea TDT , sau, de asemenea, ca ADN nucleotidylexotransferază , DNTT ), este o ADN polimerază exprimată în celule limfoide imature, pre-B și în acută leucemia limfoblastică și celulele limfomului .
Funcția TdT este de a adăuga nucleotide la capătul amino terminal pe exonii de variabilitate, diversitate și joncțiune în timpul recombinării V (D) J. La om, transferaza terminală este codificată de gena DNTT . [1] [2]
Funcţie
TdT catalizează adăugarea de nucleotide la capătul terminal 3 'al moleculei de ADN . Spre deosebire de majoritatea ADN polimerazelor, nu necesită un șablon . Substratul preferat pentru această enzimă este capătul 3 'al ADN-ului, dar este capabil să adauge nucleotide la capetele 3' tăiate sau rupte. Are nevoie de cobalt ca cofactor , însă enzima este capabilă să catalizeze reacția in vitro chiar și cu administrarea de mangan și / sau magneziu .
Utilizări
Transferaza terminală are aplicații în biologia moleculară . Poate fi utilizat în procedura RACE pentru a adăuga nucleotide care pot fi utilizate ca șablon pentru un primer în următoarea procedură de reacție în lanț a polimerazei (PCR). Poate fi, de asemenea, utilizat pentru a adăuga nucleotide marcate cu izotopi radioactivi , de exemplu în testul biochimic cunoscut sub numele de test TUNEL ( T erminal deoxinucleotidil transferază d U TP N ick E nd L abeling) pentru demonstrarea apoptozei (procesul programat de moarte celulară, care în parte este caracterizat de ADN fragmentat).
Transferaza terminală poate fi utilizată și în testele de imunofluorescență pentru diagnosticarea leucemiei limfoblastice acute [3] și prezintă caracteristici promițătoare pentru producerea de ADN artificial mai lung de 200 de baze [4] .
Genetica
ADN nucleotidylexotransferaza ( Homo sapiens ) | |
---|---|
Gene | |
Locus | Chr. 10 q23-24 |
Proteină | |
UniProt | P04053 |
PDB | 2coe |
Gena DNTT umană pentru proteina TDT este localizată în cromozomul 10 , brațul q23-q24, aproape de alte kinaze, cum ar fi hexokinaza 1, care este localizată pe același cromozom în poziția q-22.
Notă
- ^ Isobe M, Huebner K, Erikson J, Peterson RC, Bollum FJ, Chang LM, Croce CM, localizarea cromozomială a genei pentru deoxinucleotidiltransferaza terminală umană la regiunea 10q23-q25 , în Proc. Natl. Acad. Sci. SUA , vol. 82, nr. 17, septembrie 1985, pp. 5836–40, PMC 390648 , PMID 3862101 .
- ^ Yang-Feng TL, Landau NR, Baltimore D, Francke U, Gena terminală deoxinucleotidiltransferază este localizată pe cromozomul uman 10 (10q23-q24) și pe cromozomul șoarece 19 , în Cytogenet. Cell Genet. , vol. 43, nr. 3-4, 1986, pp. 121-6, PMID 3467897 .
- ^ Faber J, Kantarjian H, Roberts MW, Keating M, Freireich E, Albitar M, Terminal deoxinucleotidil transferază-leucemie limfoblastică acută negativă , în Arch. Pathol. Lab. Med. , Vol. 124, nr. 1, ianuarie 2000, pp. 92-7 , PMID 10629138 .
- ^ O nouă metodă de a produce ADN artificial , pe lescienze.it .
Bibliografie
- O'Malley DP, Orazi A, celule terminale deoxinucleotidil transferază pozitive în splină, apendice și chisturi rupte branțiale la copii și adolescenți. , în Haematologica , vol. 91, nr. 8, 2006, pp. 1139-40, PMID 16885057 .
- Yamashita N, Shimazaki N, Ibe S și colab. Deoxinucleotidiltransferaza terminală interacționează direct cu o nouă proteină nucleară omologă cu p65. , în Genes Cells , vol. 6, nr. 7, 2001, pp. 641-52, PMID 11473582 .
- Chang LM, Bollum FJ, Biologia moleculară a transferazei terminale. , în CRC Crit. Pr. Biochem. , vol. 21, n. 1, 1986, pp. 27-52, PMID 3524991 .
- Maezawa S, Hayano T, Koiwai K și colab. , Bood POZ conținând gena de tip 2 este un omolog om al drojdiei Btb3p și promovează degradarea deoxinucleotidiltransferazei terminale. , în Genes Cells , vol. 13, n. 5, 2008, pp. 439-57, DOI : 10.1111 / j.1365-2443.2008.01179.x , PMID 18429817 .
- Taplin ME, Frantz ME, Canning C și colab. , Dovezi împotriva dezvoltării celulelor T în mucoasa intestinală umană adultă bazată pe lipsa expresiei terminale a deoxinucleotidiltransferazei. , în Imunologie , vol. 87, nr. 3, 1996, pp. 402-7, PMID 8778025 .
- Grupe A, Li Y, Rowland C și colab. , O scanare a cromozomului 10 identifică un locus nou care arată o asociere puternică cu boala Alzheimer cu debut tardiv. , în Am. J. Hum. Genet. , vol. 78, nr. 1, 2006, pp. 78-88, DOI : 10.1086 / 498851 , PMID 16385451 .
- Dworzak MN, Fritsch G, Fröschl G și colab. , Investigație citometrică cu flux de patru culori a precursorilor limfoizi pozitivi ai deoxinucleotidil transferazei terminale în măduva osoasă pediatrică: expresia CD79a precede CD19 în ontogenia timpurie a celulelor B. , în Sânge , vol. 92, nr. 9, 1998, pp. 3203-9, PMID 9787156 .
- Fujita K, Shimazaki N, Ohta Y și colab. Deoxinucleotidiltransferaza terminală formează un complex ternar cu o nouă proteină de remodelare a cromatinei cu 82 kDa și histonă de bază. , în Genes Cells , vol. 8, nr. 6, 2003, pp. 559-71, PMID 12786946 .
- Kubota T, Maezawa S, Koiwai K și colab. , Identificarea domeniilor funcționale în TdIF1 și mecanismul său inhibitor pentru activitatea TdT. , în Genes Cells , vol. 12, nr. 8, 2007, pp. 941-59, DOI : 10.1111 / j.1365-2443.2007.01105.x , PMID 17663723 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K și colab. , Construcția și caracterizarea unei biblioteci de cADN-uri îmbogățite pe toată lungimea și a unei 5-capete îmbogățite. , în Gene , vol. 200, n. 1-2, 1997, pp. 149-56, PMID 9373149 .
- Bridges SL, adiție frecventă de N și corelație clonală între lanțurile ușoare de imunoglobulină lambda exprimate în sinovii de poliartrită reumatoidă și PBL și influența utilizării segmentului genei V lambda pe lungimea CDR3. , în Mol. Med. , Vol. 4, nr. 8, 1998, pp. 525-53, PMID 9742508 .
- Liu L, McGavran L, Lovell MA și colab. , Deoxinucleotidil transferază terminală nepozițională în leucemia limfoblastică B precursor pediatric. , în Am. J. Clin. Pathol. , vol. 121, nr. 6, 2004, pp. 810-5, DOI : 10.1309 / QD18-PPV1-NH3T-EUTF , PMID 15198352 .
- Yang B, Gathy KN, Coleman MS, Analiza mutațională a reziduurilor în domeniul de legare a nucleotidelor de deoxinucleotidil transferază umană terminală. , în J. Biol. Chem. , vol. 269, nr. 16, 1994, pp. 11859-68, PMID 8163485 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA și colab. , Starea, calitatea și extinderea proiectului NIH de lungă durată ADNc: Mammalian Gene Collection (MGC). , în Genome Res. , vol. 14, 10B, 2004, pp. 2121-7, DOI : 10.1101 / dimensiunea 2596504 , PMID 15489334 .
- Thai TH, Kearney JF, Activități distincte și opuse ale variantelor de îmbinare deoxinucleotidiltransferază terminală umană. , în J. Immunol. , vol. 173, nr. 6, 2004, pp. 4009-19, PMID 15356150 .
- Shimazaki N, Fujita K, Koiwai O, [Exprimarea și funcția deoxinucleotidil-transferazei terminale și descoperirea ADN polimerazei mu] , în Seikagaku , vol. 74, nr. 3, 2002, pp. 227-32, PMID 11974916 .
- Mahajan KN, Mitchell BS, Rolul Pso4 uman în repararea ADN-ului mamiferelor și asocierea cu deoxinucleotidil transferaza terminală. , în Proc. Natl. Acad. Sci. SUA , vol. 100, nr. 19, 2003, pp. 10746-51, DOI : 10.1073 / pnas.1631060100 , PMID 12960389 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH și colab. , Generarea și analiza inițială a mai mult de 15.000 de secvențe de ADNc de lungă durată la om și șoarece. , în Proc. Natl. Acad. Sci. SUA , vol. 99, nr. 26, 2002, pp. 16899-903, DOI : 10.1073 / pnas . 242603899 , PMID 12477932 .
- Mahajan KN, Gangi-Peterson L, Sorscher DH și colab. , Asocierea deoxinucleotidil transferazei terminale cu Ku. , în Proc. Natl. Acad. Sci. SUA , vol. 96, nr. 24, 1999, pp. 13926-31, PMID 10570175 .
- Ibe S, Fujita K, Toyomoto T și colab. , Deoxinucleotidiltransferaza terminală este reglată negativ prin interacțiunea directă cu antigenul nuclear celular proliferant. , în Genes Cells , vol. 6, nr. 9, 2001, pp. 815-24, PMID 11554927 .
Elemente conexe
linkuri externe
- ( EN ) 1kdh , în Proteopedia ,OCLC 732695773 .
- (EN) Deoxiribonucleotidiltransferază terminală în rubricile subiectului medical (MeSH), Biblioteca Națională de Medicină , 2009.