Factorul de alungire
Un factor de alungire este o proteină care cooperează cu ribozomul și facilitează alungirea procesului de translare a proteinelor, care începe de la formarea primei legături peptidice până la ultima.
Rolul biologic
Familia factorilor de alungire a traducerii este alcătuită din mai multe proteine, fiecare dintre ele având roluri specifice în sinteza proteinelor [1] (așa-numitele funcții canonice ), dar și roluri secundare în alte procese biologice (așa-numitele non-canonice funcții sau funcții de lună [2] [3] ). Mai mult, mulți dintre acești factori de alungire sunt proteine G ( proteine G ), adică proteine cu activitate GTPază care verifică complementaritatea ( potrivirea) corectă dintre codon ( codon ) și anticodon ( anticodon ) atunci când ARN-ul de transfer ( ARNt ) intră în locul A a ribozomului [4] . În eucariote au localizare celulară citosolică, deși unii dintre acești factori pot fi identificați în alte compartimente celulare, cum ar fi nucleul, unde îndeplinesc alte funcții.
Intinderea este cel mai rapid pas în sinteza proteinelor :
- în procariote se desfășoară cu o rată de 15 până la 20 de aminoacizi adăugați pe secundă (aproximativ 60 de nucleotide pe secundă)
- în eucariote rata este de aproximativ doi aminoacizi pe secundă.
Factorii de alungire joacă un rol în reglarea evenimentelor acestui proces și în asigurarea acurateței traducerii la această viteză.
Factorii de alungire din procariote
Familia factorilor de alungire din procariote este compusă din următoarele proteine:
Factori de alungire în eucariote
Familia factorilor de alungire din eucariote este compusă din următoarele proteine:
- familia EF1 [6] [7] , care grupează:
- factorul de alungire a traducerii 1A sau eEF1A [7] ( factorul de alungire a traducerii eucariote 1 alfa ), care este prezent în două izoforme principale: eEF1A1 și eEF1A2
- factorul de alungire a traducerii 1B sau eEF1B2 [7] ( factorul de alungire a traducerii eucariote 1 beta 2)
- factorul de alungire a traducerii 1D sau eEF1D [7] ( factorul de alungire a traducerii eucariote 1 delta )
- factorul de alungire a traducerii 1G sau eEF1G [7] ( factorul de alungire a traducerii eucariote 1 gamma )
- factorul de alungire a traducerii 2 sau eEF2 [8] [1] [6] ( factorul de alungire a traducerii eucariote 2)
Proteinele eEF1A, eEF1B2, eEF1D, eEF1G interacționează între ele pentru a forma un complex macromolecular tranzitoriu numit complex eEF1B2GD [2] ( complex eEF1B2GD ). Interacțiunea complexului, de asemenea, cu factorul valil t-ARN sintetază (Val-RS) creează complexul macromolecular cunoscut sub numele de eEF1H [9] [10] [3] sau EF1 ( complex eEF1H ).
Interacțiuni biologice
Factorii de alungire sunt, de asemenea, o țintă pentru agenții patogeni. Corynebacterium diphtheriae produce o toxină care modifică funcția proteinei din gazdă prin inactivarea factorului de alungire EF-2.
Notă
- ^ a b CG Proud, alungirea lanțului peptidic în eucariote , în Molecular Biology Reports , vol. 19, nr. 3, 1994-5, pp. 161-170. Accesat 18 iulie 2019.
- ^ a b c d Shin-ichiro Ejiri, Moonlighting functions of polypeptide allongation factor 1: from actin bundling to zinc finger protein R1- related localization nuclear , in Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry , vol. 66, nr. 1, 2002-1, pp. 1–21, DOI : 10.1271 / bbb.66.1 . Accesat 18 iulie 2019.
- ^ a b Arjun N. Sasikumar, Winder B. Perez și Terri Goss Kinzy, Multe roluri ale complexului factorului de alungire eucariotă 1 , în recenziile interdisciplinare Wiley. ARN , vol. 3, nr. 4, 2012-7, pp. 543–555, DOI : 10.1002 / wrna.1118 . Accesat 18 iulie 2019.
- ^ a b RK Agrawal, P. Penczek și RA Grassucci, Vizualizarea factorului de alungire G pe ribozomul Escherichia coli 70S: mecanismul translocației , în Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America , vol. 95, nr. 11, 26 mai 1998, pp. 6134-6138, DOI : 10.1073 / pnas.95.11.6134 . Accesat 18 iulie 2019.
- ^ H. Stark, MV Rodnina și J. Rinke-Appel, Vizualizarea factorului de alungire Tu pe ribozomul Escherichia coli , în Nature , vol. 389, nr. 6649, 25 septembrie 1997, pp. 403–406, DOI : 10.1038 / 38770 . Accesat 18 iulie 2019.
- ^ a b B. Riis, SI Rattan și BF Clark, factori de alungire a proteinelor eucariote , în Tendințe în științe biochimice , vol. 15, nr. 11, 1990-11, pp. 420-424. Accesat 18 iulie 2019.
- ^ a b c d și Gareth J. Browne și Christopher G. Proud, Regulamentul alungirii lanțului peptidic în celulele mamiferelor , în European Journal of Biochemistry , vol. 269, nr. 22, 2002-11, pp. 5360-5368, DOI : 10.1046 / j.1432-1033.2002.03290.x . Accesat 18 iulie 2019.
- ^ Gautam Kaul, Gurulingappa Pattan și Towseef Rafeequi, Eucaryotic elongation factor-2 (eEF2): regularea și alungirea lanțului peptidic , în Cell Biochemistry and Function , vol. 29, nr. 3, 2011-4, pp. 227-234, DOI : 10.1002 / cbf.1740 . Accesat 18 iulie 2019.
- ^ GM Janssen, HT van Damme și J. Kriek, Structura subunității factorului de alungire 1 din Artemia. De ce două lanțuri alfa din acest complex? , In Journal of Biological Chemistry, voi. 269, nr. 50, 16 decembrie 1994, pp. 31410-31417. Accesat 18 iulie 2019.
- ^ Francisco Mansilla, Irene Friis și Mandana Jadidi, Mapping the translation translation alongation factor eEF1H complex using the drojdie two-hybrid system , în The Biochemical Journal , vol. 365, Pt 3, 1 august 2002, pp. 669–676, DOI : 10.1042 / BJ20011681 . Accesat 18 iulie 2019.
