Purificare

De la Wikipedia, enciclopedia liberă.
Salt la navigare Salt la căutare

Purificarea se referă la pierderea unei baze azotice purinice ( adenină sau guanină ) dintr-o nucleotidă prin ruperea unei legături glicozidice . De obicei, procesul are loc în nucleotide inserate într-un lanț de acid nucleic, cum ar fi ADN sau ARN : reacția părăsește un sit numit "apurinic" sau mai general "abasic", adică un sit în care este prezent doar "scheletul" de zahăr - fosfat. a acidului nucleic și, în poziția 1 'a zahărului ( dezoxiriboză în ADN, riboză în ARN), o grupă hidroxil va rămâne în locul bazei eliminate.

Reacția poate apărea spontan prin hidroliză , deși foarte rar. Cu toate acestea, purificarea poate fi indusă și de agenți mutageni precum aflatoxina B sau alți metaboliți endogeni. Aproximativ 10.000 de purine se pierd astfel în fiecare zi într-o celulă tipică de mamifer , cifră care poate fi obținută indirect din numărul de situri abasice (AP) a căror formare este în mare parte responsabilă pentru purificare. O estimare a numărului de situri AP pe celulă a fost furnizată de Nakamura J. și colab. Cancer Res. 1998 15 ianuarie; 58 (2): 222-5.

Fenomenul poate provoca mutații genetice în celula în care apare. În special, dacă nu este reparat mai întâi de sistemele de reparații (bazate pe o endonuclează AP, ADN polimerază și ligază), acesta creează probleme în timpul replicării ulterioare a ADN-ului care conține situl apurinic : ADN polimeraza din fața acestui sit nu este capabil să-și continue reacția. În aceste cazuri, anumite sisteme de reparare a ADN-ului , cum ar fi polimerazele care repară tranzițiile, sunt adesea implicate pentru a evita blocarea replicării cu daune extinse, care totuși nu sunt de înaltă fidelitate și pot introduce mutații, inclusiv ștergeri.