Cutie Pribnow
În biologia moleculară, cutia Pribnow (sau cutia Pribnow-Schaller , din cutia engleză = box ) este definită ca secvența a șase nucleotide TATAAT care formează o parte esențială a promotorului genelor organismelor procariote . Această secvență este astfel definită în urma studiilor ample pe acest subiect de David Pribnow și Heinz Schaller [1] [2] Este o secvență consens (adică o secvență care apare într-un număr foarte mare de promotori analizați) plasată la zece nucleotide din site-ul de început al transcrierii (motiv pentru care se mai numește și secvența -10 ).
Cutia Pribnow are funcții similare cu cutia TATA prezentă la promotorii eucariote : este de fapt recunoscută de o subunitate a ARN polimerazei în faza de inițiere a transcrierii. Această regiune este, de asemenea, prima care permite deschiderea transcrierii în sine: prezența ridicată a adeninei și timinei este fundamentală, deoarece, spre deosebire de cea dintre citozină și guanină , legătura dintre aceste două nucleotide este mai slabă (are două legături de hidrogen în loc de trei) iar helica dublă se va putea deschide mai ușor decât o secvență care prezintă cele 4 baze într-o secvență aleatorie și chiar mai mult decât una care prezintă multe asociații citozină-guanină (CG).
Secvența este conservată în special în cazul secvențelor consensuale ale promotorilor puternici , care pot prezenta, de asemenea, un alt site în poziția -35 (în raport cu poziția +1 de la începutul transcripției) care favorizează începerea corectă a transcripției.
Cele șase nucleotide din secvență nu sunt toate la fel de probabil să fie prezente. Cele mai probabile sunt primele două și ultima, în timp ce cele trei poziții intermediare au un grad mai mare de variabilitate [3]
| T. | LA | T. | LA | LA | T. |
| 82% | 89% | 52% | 59% | 49% | 89% |
Notă
- ^ David Pribnow (1975). Secvența nucleotidică a unui site de legare a ARN polimerazei la un promotor timpuriu T7. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 72: 784-788.
- ^ Heinz Schaller, Christopher Gray și Karin Herrman (1975). Secvența nucleotidică a unui site de legare a ARN polimerazei de la ADN-ul bacteriofagului fd. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 72: 737-741.
- ^ Calvin B. Harley și Robert P. Reynolds (1987). Analiza secvențelor promotorului E. coli . Acizi nucleici Rez. 15 (5): 2343-61.
