Agaroză

De la Wikipedia, enciclopedia liberă.
Salt la navigare Salt la căutare
Exemplu de utilizare a gelului de agaroză: gelul este utilizat aici într-o cameră electroforetică orizontală pentru separarea biomoleculelor.

Agaroza este un polimer polizaharidic purificat din agar-agar , o substanță gelatinoasă extrasă de obicei din Rhodophyta . [1] Este un polimer liniar a cărui unitate de bază este agaroboză - o dizaharidă compusă din (1,3) -β-D-galactopiranoză- (1,4) -3,6-anhidro-α-L-galactopiranoză. Cele două monozaharide sunt unite între ele printr- o legătură glicozidică . Agaroza este una dintre cele două componente principale ale agarului și se obține prin purificarea agarului din cel de-al doilea component al său, agaropectina. [2]

Agaroza este cumpărată în mod obișnuit sub formă de pulbere albă care se dizolvă în apă clocotită și este frecvent utilizată în biologia moleculară pentru separarea moleculelor mari, inclusiv ADN , prin electroforeză .

Structura

Agaroza este un polimer liniar a cărui masă moleculară este de aproximativ 120.000. Unitatea fundamentală a agarozei este agaroboză, adică un dimer zaharidic format din D-galactoză și 3,6-anhidro-L-galactopiranoză unite printr-o legătură glicozidică α- (1 → 3) și β- (1 → 4).

Structura unității fundamentale a agarozei

Fiecare moleculă de agaroză conține aproximativ 800 de molecule de galactoză; lanțul polimeric de agaroză formează fibre elicoidale care se agregă în structuri supraînfășurate cu o rază de aproximativ 20 / 30nm. [3] Fibrele sunt semi-rigide și variază foarte mult în lungime pe baza concentrației de agaroză. [4]

Structura tridimensională a agarozei este menținută ca atare prin formarea legăturilor H ; în consecință prin încălzirea gelului, acesta revine la starea lichidă.

Aplicații

Rezultatul unei separări electroforetice a acizilor nucleici este adesea evidențiat de intercalatorii care emit radiații vizibile atunci când sunt excitați de razele UV.

Agaroza este o matrice excelentă pentru lucrul cu proteine ​​și acizi nucleici datorită proprietăților sale fizice și chimice, precum și stabilității sale termice. Are un grad scăzut de complexitate moleculară și, prin urmare, este puțin probabil să interacționeze cu alte biomolecule .

Cea mai obișnuită utilizare a gelului de agaroză este de a acționa ca suport în timpul separării electroforetice: sonde sunt create în gelul de agaroză purificat, în interiorul căruia sunt „încărcate” probele de interes. Gelul are pori relativ mari și această proprietate permite biomoleculelor - inclusiv fragmente de ADN cu> 100 perechi de baze și complexe proteice cu o greutate> 200 kDa - să fie separate în funcție de mărimea lor. De fapt, moleculele mai mici migrează mai rapid la baza gelului decât moleculele mai mari.

Proprietate

Agaroza are o temperatură de topire diferită de solidificare / gelificare, proprietate definită ca histerezis termic. Temperatura sa de fierbere variază în funcție de organismul din care este extras (în general între 80 și 90 ° C), precum și de cea a gelificației (în general între 30 și 40 ° C), prezentând astfel o histerezis că poate varia de la 40 ° C la peste 50 ° C. [5]

Notă

  1. ^ Martin Chaplin, Hagar , la web.archive.org . Adus la 11 februarie 2017 (arhivat din original la 16 octombrie 2007) .
  2. ^ 3. AGAR , pe www.fao.org . Adus la 11 februarie 2017 .
  3. ^ CAPITOLUL 1 - PRODUCȚIA, PROPRIETĂȚILE ȘI UTILIZĂRILE AGAR , pe www.fao.org . Adus la 11 februarie 2017 .
  4. ^ Tom Maniatis, EF Fritsch și Joseph Sambrook, Capitolul 5, protocolul 1 , în Molecular Cloning - A Laboratory Manual , vol. 1, p. 5.4, ISBN 978-0-87969-136-3 .
  5. ^ (EN) Stabilizatori alimentari, îngroșători și agenți de gelifiere , 6 noiembrie 2009, DOI : 10.1002 / 9781444314724 . Adus pe 12 iunie 2018 .

Elemente conexe

Alte proiecte

Controlul autorității GND ( DE ) 4217413-2
Chimie Portalul chimiei : portalul științei compoziției, proprietăților și transformărilor materiei
Adus de la „ https://it.wikipedia.org/w/index.php?title=Agarosio&oldid=120882159 ”